Maladie à virus Zika

Le virus est détecté la première fois en avril 1947 chez un singe macaque rhésus utilisé comme « sentinelle » (animal en captivité faisant l'objet d'examens périodiques) lors d'une surveillance de la fièvre jaune dans la forêt Zika, au bord du lac Victoria sur la presqu'île d'Entebbe en Ouganda[S 1]. Il est à nouveau isolé dans la même forêt en 1948 chez un moustique Aedes africanus. Sa spécificité sérologique est décrite en 1952[S 1]. La transmission vectorielle par un moustique du genre Aedes est par ailleurs prouvée expérimentalement en laboratoire en 1956[S 2].

Le premier cas humain est décrit en 1954[S 3]. En 1968, puis à nouveau entre 1971 et 1975, le virus est isolé chez l'humain au Nigeria. Entre 1951 et 1981, des preuves d'infections, par isolement de virus ou par la recherche de traces sérologiques chez l'humain, sont détectées dans plusieurs pays africains (Ouganda, Tanzanie, Égypte, République centrafricaine, Sierra Leone, Gabon et Sénégal) et asiatiques (Inde, Malaisie, Philippines, Thaïlande, Viêt Nam et Indonésie)[S 2]. Le génome du virus est séquencé pour la première fois en 2006[S 4].

Au début du mois d'avril 2007, une épidémie touche les îles Yap aux États fédérés de Micronésie[A 2]. Elle culmine au mois de mai, puis régresse, avec des cas décrits jusqu'en juillet[3]. Ce sont près de 900 cas[S 5] qui sont probablement attribuables au virus Zika, dont 99 cas confirmés[3] - [4]. Le virus a probablement été introduit dans îles Yap par un moustique, ou un être humain infecté, venu des Philippines, où des preuves de sa présence ont déjà été mises en évidence[S 5]. Une étude sérologique montre que près des trois quarts des habitants de l'île ont été infectés, mais aucune hospitalisation, ni aucun décès lié, ne sont recensés[3] - [S 5] - [S 6]. Le virus gagne également d'autres îles proches, comme Ulithi, Fais, Eauripik, Woleai et Ifalik[3].

Fin 2013, les services sanitaires de Polynésie française estiment que 55 000 personnes ont été touchées par le zika sur une période d'environ trois mois, soit un cinquième de la population totale. Cette épidémie de zika touche pour la première fois un territoire associé à un pays européen, provoquant ainsi un intérêt accru de la communauté scientifique, d'autant plus que la Polynésie française dispose d'un réseau hospitalier et de structures permettant d'observer la propagation de ce virus et son impact sur une population. Fin décembre 2013, 19 cas de complication en syndrome de Guillain-Barré sont enregistrés[A 3] - [A 4] - [5] (soit 1 cas sur 2 900 malades).

Une épidémie a touché en 2013-2014 plusieurs îles du Pacifique : la Polynésie française, la Nouvelle-Calédonie (également dans les îles Cook et l'île de Pâques (Chili)[6].

En janvier 2016, l'OMS a fait une déclaration d'urgence et placé le virus sous surveillance élevée, en février l'OMS déclarait la microcéphalie associée au virus Zika au Brésil « urgence de santé publique »[7].
Un peu plus de 10 mois plus tard, (le 18 novembre 2016) l'OMS a mis fin à sa déclaration d'urgence pour recommander une approche de santé publique à portée internationale sur le long terme (PHEIC), ce qui n'est pas une rétrogradation de la maladie sur l'échelle de risque mais « que Zika est là pour rester et que la réponse de l'OMS est également là pour rester », dans les régions où vit le moustique vecteur[7]. L'OMS a insisté sur le fait que le virus Zika et ses complications (dont malformations congénitales et paralysies temporaires) ne disparaîtront pas avant longtemps[7]. La recherche doit se poursuivre sur les modes de propagation du virus, par le moustique et d'une personne à l'autre, sur l'occurrence et les causes des complications graves, sur l'existence éventuelle de cofacteurs, (autres virus, susceptibilités génétiques, facteurs environnementaux...)[7].

Carte du monde montrant la répartition du virus Zika en 2012 :

• Pays où le virus a été isolé chez l'humain.
• Pays où des anticorps anti-virus ont été mis en évidence chez l'humain.

Le virus Zika a pour origine des régions tropicales d'Afrique et d'Asie. En Afrique, il a été isolé chez l'humain en Ouganda, en République centrafricaine, au Nigeria et au Sénégal, et des preuves sérologiques d'infections ont été rapportées en Tanzanie, en Égypte, au Sierra Leone, au Gabon, en Éthiopie, en Somalie et au Cameroun[S 2] - [S 7]. En Asie, il a été isolé en Indonésie et au Cambodge, et des preuves sérologiques d'infections ont été décrites en Inde, en Malaisie, en Thaïlande, au Pakistan, aux Philippines, à Singapour et au Viêt Nam[S 2] - [S 7] - [S 8] - [A 5].

Le virus est considéré comme émergent[S 9] - [8] après avoir été identifié comme responsable d'une épidémie sur les îles Yap, en États fédérés de Micronésie, et d'autres îles voisines en 2007. Le virus Zika est néanmoins rarement à l'origine de grandes épidémies et sa diffusion est difficile à suivre : l'infection n'est pas obligatoirement symptomatique, et lorsqu'elle l'est, le diagnostic peut être difficile à poser, tant les symptômes peuvent être confondus à ceux d'autres arboviroses comme la dengue ou le chikungunya[3] - [S 7] - [9].

Avant l'épidémie des îles Yap, seuls une quarantaine de cas cliniques étaient décrits[3]. D'autre part, les tests de diagnostic rapide pour la dengue peuvent être sujets à une réactivité croisée avec le virus Zika, occasionnant une mauvaise attribution étiologique pour certaines épidémies de dengue[S 2] - [S 10]. L'importance en santé publique et la répartition réelle du virus Zika peuvent dès lors être grandement sous-estimées, ce que tend à suggérer l'amplitude de la séroprévalence mise en évidence dans de nombreuses études[S 7].

En 2013, aucun décès ou hospitalisation due à une fièvre Zika n'a été répertorié[3] - [4] mais en 2019, alors que les facteurs explicatif de la propagation rapide et à la gravité de la maladie observée lors des épidémies récentes sont encore insaisissables[10], à la suite de l'étude fine d'une épidémie survenue en 2015 au Brésil, des liens entre ce virus et celui de la Dengue sont apparus. De manière générale, selon les observations disponibles en 2019, une immunité acquise contre la dengue (DENV) protège l'individu contre une infection ultérieure par le ZIKV, ce qui pourrait expliquer la faible incidence de la maladie Zika observée en Afrique du Sud [10], cependant, au moins dans certaines circonstances, rares, une infection antérieure par la dengue (qui est un virus apparenté, véhiculé par un moustique) semble - parfois - aggraver le risque de contracter le virus Zika, et qu'il induise une maladie plus aigüe[10].

Carte du monde montrant la répartition du virus Zika en janvier 2016 :

• Pays où le virus a été isolé chez l'humain.
• Pays où des anticorps anti-virus ont été mis en évidence chez l'humain.

Situation américaine en février 2016

• Plus d'un million de cas confirmés.
• Entre 1 500 et un million de cas confirmés.
• Moins de 1 500 cas confirmés.

Le virus Zika est détecté dans le Nord-Ouest du Brésil en mai 2015. Ce pays rapporte ensuite le plus grand nombre de cas de zika jamais décrit jusqu’alors (440 000 à 1 300 000 cas suspects, portés à 1,5 million fin janvier 2016 selon l'OMS[A 6]). Le virus est ensuite détecté d'octobre 2015 à mi-janvier dans une vingtaine de pays : Argentine, Barbade, Bolivie, Brésil, Colombie, Équateur, Haïti, Salvador, Guadeloupe, Guatemala, Guyane, Guyana, Honduras, Mexique, Panama, Paraguay, Saint-Martin, Salvador, Surinam, Porto Rico, Venezuela[6].

Le virus a aussi été détecté dans des îles isolées du Pacifique (îles Samoa et Solomon en février-mai 2015)[6], Fiji (en août) et Vanuatu[6] de même qu'au Cap-Vert au large de l’Afrique (octobre 2015)[6].

Fin 2015, le Suriname[S 11], la Guyane française[A 7] puis les îles des petites Antilles[A 8] sont à leur tour touchées, puis en janvier 2016, la Barbade avec quelques cas autochtones confirmés[A 9], la Martinique[A 10] et la Guadeloupe[A 11]. En décembre 2015, deux cas sont détectés en Guyane (par l’Institut Pasteur), puis toujours dans l'arc antillais les agences régionales de santé le repèrent en Martinique (2 cas en décembre 2015)[11] puis 12 cas (début janvier 2016) et en Guadeloupe (avec confinement rapide des malades dans tous ces cas)[6].

Une première hypothèse a été que le virus Zika aurait été importé en Amérique avec l'organisation au Brésil, en été 2014, de la Coupe du monde de football ou bien d'un championnat international de pirogue polynésienne[12] - [13] - [S 12]. Durant le premier semestre 2015, il y avait déjà des cas confirmés dans toutes les régions du pays. Avec des symptômes plus doux que ceux de la dengue ou de la fièvre liée au chikungunya (maladies aussi transmises par le moustique Aedes aegypti), l'épidémie de Zika était considérée comme banale. Mais en mars 2016, la publication d'analyses moléculaires et de l’horloge phylogénétique de ces souches virales (faite à partir de sept échantillons viraux provenant respectivement de quatre patients spontanément guéris, d’un donneur de sang, d’un adulte décédé de la maladie, et d’un nouveau-né microcéphale et atteint de malformations congénitales) montraient que selon ces données, il n'y a eu qu'une seule introduction de ZIKV dans les Amériques, entre mai et décembre 2013 (plus d'un an avant la détection de ZIKV au Brésil)[S 13]. Cette période correspond au Brésil à une augmentation des débarquements de passagers aériens provenant de zones d'endémie ZIKV des îles du Pacifique[S 13].

Le virus Zika s'est montré au Brésil potentiellement associé à des symptômes neurologiques graves comme la microcéphalie congénitale du fœtus (acquise lors des grossesses de femmes infectées) et le syndrome de Guillain-Barré, qui, quoiqu'ils continuent à être rares, augmentèrent beaucoup dans le pays[14] - [15] - [16] - [17].
La cartographie des mutations virales disponible en mars 2016 n'a pas pu mettre en exergue de modification d'acides aminés commune aux trois génomes viraux disponibles au moment des études (2015-2016) provenant de cas avec microcéphalie[S 13], par contre les données sur l'incidence géographique des cas incitent à penser que (au Brésil) le risque de microcéphalie est plutôt corrélé à une infection survenue autour de la 17^e semaine de grossesse (ce qui n'explique pas comment le virus affecte le système nerveux du fœtus)[S 13], mais on sait que la protéine non structurelle 1 (NS1) facilite l'acquisition de flavivirus par les moustiques lors du repas sur hôte mammifère infecté, pour ensuite augmenter la prévalence virale chez les moustiques[18]. L'antigénémie NS1 détermine l'infectiosité ZIKV dans son moustique vecteur femelle qui l’ingère lors de son repas sanguin. Une autre étude (2017) a montré que les isolats cliniques de souches virales provenant de l'épidémie la plus récente (américaine) sont bien plus infectieux pour le moustique que la souche FSS13025 isolée au Cambodge en 2010[19]. D'autres travaux ont montré que ces souches épidémiques ont une antigénémie NS1 plus élevée que la souche FSS13025 à cause d'une petite mutation génétique qui modifie légèrement sa protéine NS1, mutation qui rend le virus plus infectieux aussi chez la souris AG6 (à la suite de l’augmentation de l'antigénémie NS1 chez l’hôte infecté)[19]. Ceci pourrait expliquer pourquoi le ZIKV s’est propagé si rapidement et efficacement de l'Asie vers les Amériques[19].

C'est à la suite de l'épidémie américaine que le 1^er février 2016, l’OMS a classé le virus Zika comme « urgence de santé publique de portée internationale »[A 12].

En Europe, le virus est repéré en janvier 2016 au Royaume-Uni, en Italie, aux Pays-Bas, au Portugal, en Suisse (4 cas répertoriés chez des voyageurs rentrant d'Amérique latine[A 13]) et au Danemark. Un risque de transmission en France existe, plutôt dans le sud du pays et via des moustiques Aedes (Aedes albopictus) qui pourraient acquérir le virus du sang d'un patient virémique venant d'un pays touché, mais de mai à novembre (période d'activité des moustiques piqueurs)[6].

Avant mai 2016, environ 39 personnes en Catalogne et 105 en Espagne dont 13 femmes enceintes, ont été contaminées par le virus Zika lors d'un déplacement en Amérique[A 14]. Le premier cas espagnol de malformation d'un bébé a été confirmé, à la suite d'un voyage en Amérique ; il s'agit du second cas en Europe[20].

En octobre 2016, une première transmission sexuelle du virus est signalée en France. Elle s'est produite en région Rhône-Alpes[21].

• 
  Éruption cutanée sur un bras due au virus Zika.
• 
  Manifestation du virus Zika au Brésil (2015).

Le syndrome se présente sous forme d'une maladie fébrile, parfois faible ou absente, pouvant être associée à une éruption maculopapuleuse, débutant sur le visage puis s'étendant au reste du corps, parfois prurigineux, une céphalée, une conjonctivite et de l'arthrite ou une arthralgie, en particulier des petites articulations des chevilles et des mains[S 2] - [S 6] - [S 18] - [40]. D'autres symptômes ont également été ponctuellement rapportés : signes digestifs (diarrhée, constipation, douleur abdominale), des signes neurologiques (vertige, étourdissement, nausée, vomissement, anorexie), myalgie, douleurs rétro-orbitaires et douleurs dorsales[S 2] - [S 6] - [S 18]. Deux cas ont montré des aphtes dans ou autour de la cavité buccale[S 18]. Un cas confirmé présente également des maux de gorge et une toux, mais sans éruption maculopapuleuse[S 8]. On peut retrouver également des œdèmes des mains et des pieds, une anorexie, une photophobie et des adénopathies[S 22]. Un autre cas confirmé présente une prostatite et une hémospermie, associées au seul cas documenté de transmission sexuelle[S 18].

La fièvre Zika est spontanément résolutive, les symptômes durant de 4 à 7 jours[S 6] - [40].

La maladie a touché, lors de l'épidémie des îles Yap, deux fois plus de femmes que d'hommes, et s'est avérée moins sévère chez les enfants[S 6] - [41]. Il ne semble pas y avoir d'effet à long terme de l'infection[S 6], même si un cas présente depuis des arthralgies récurrentes[S 18].

En 2013, aucun effet délétère sur les femmes enceintes ou les nourrissons n'avait été mis en évidence[40]. Cependant, au troisième trimestre de 2015 une étude rapporte une corrélation probable entre infection des fœtus et microcéphalie[A 17] - [S 23]. Dans l'État brésilien du Pernambuco, 58 cas en un seul mois dans plusieurs villes, bien plus que le nombre total de cas enregistrés dans les années précédentes par le Système national de surveillance des naissances (5 cas en 2011, 9 en 2012, 10 en 2013 et 12 en 2014) ; soit un taux moyen de 0,5 pour 10 000 naissances vivantes.

Puis les autres États du Nord-Est confirment aussi une augmentation des cas de microcéphalie sans causes génétiques à la suite d'une infection par le virus Zika. Le 27 janvier, les autorités brésiliennes rapportaient 4 180 cas suspects pour 2015 contre 147 confirmés en 2014[A 6]. Ces épidémies sont caractérisées par un taux d'attaque élevé et une dispersion rapide, typique d'une maladie transmise par des arthropodes[5].

Par ailleurs, 18 cas d'anomalies congénitales, incluant des microcéphalies et des anomalies du tronc cérébral, ont été détectées sur des fœtus ou des enfants polynésiens entre mars 2014 et mai 2015, possiblement liés à l'épidémie survenue dans le pays[A 18].

Ces données ont été jugées suffisantes par les responsables politiques brésiliens pour annoncer publiquement le lien Zika / microcéphalie, alors que ce lien n'était pas définitivement établi[S 24].

Avant 2016 aucun autre flavivirus n'était reconnu pathogène pour le fœtus humain, mais le virus zika est connu pour son neurotropisme sur le cerveau de souris (voir la section physiopathologie).

D'autre part, début 2016, l'épidémie de microcéphalie ne pouvait s'expliquer par d'autres causes infectieuses, ni par des agents environnementaux. L'hypothèse zika étant la plus probable, mais non démontrée, la démonstration doit passer, entre autres, par des études épidémiologiques fines (dont étude cas-témoins) et par une reproduction du phénomène sur le modèle animal. Confirmer ou écarter le lien zika / microcéphalie est devenu une urgence[S 24].

Une étude récente renforce l'hypothèse car ayant détecté le virus dans le liquide amniotique, et surtout dans le cerveau fœtal. Il semblerait que le virus stoppe progressivement la croissance du cortex cérébral à partir de la 20^e semaine de gestation[S 25]. Mais ces données restent encore insuffisantes, pour satisfaire les critères standards de causalité[S 26].

Le 19 février 2016, l'OMS liste d'autres causes possibles ou facteurs de risques, à envisager pour le diagnostic différentiel : autres infections virales, causes génétiques… Parmi les facteurs environnementaux, sont listés les métaux lourds (arsenic, mercure, chrome), le tabac, l'alcool, l'irradiation[22], les insecticides n'y figurent pas.

En mars 2016, des chercheurs de l’Institut Pasteur démontrent que le virus Zika peut entraîner une microcéphalie du fœtus, associant un périmètre crânien inférieur aux normes et des anomalies cérébrales[S 27]. Le 24 mars, l'OMS conclue, au vu de l'accumulation d'éléments de preuve, à un lien de causalité " hautement probable "[42], elle mentionne une étude française en Polynésie donnant une première estimation du risque : une infection à virus zika au cours du premier trimestre de grossesse présente un risque de microcéphalie de l'ordre de 1 %[S 28].

Publiée en février 2022[43], "une étude de cohorte brésilienne portant sur plus de 11 millions de nouveau-nés suivis pendant trois ans" estime que "chez les enfants ayant développé un syndrome congénital lié à une infection par le virus Zika au cours de la grossesse, la mortalité est quasiment 12 fois plus élevée par rapport à celle des enfants nés sans ce syndrome". Le Brésil est particulièrement touché par ce syndrome congénital, des études ont "révélé une prévalence de microcéphalie chez le fœtus et le nouveau-né de 42% dans cette population, contre de 6% en Martinique ou en Guadeloupe", ces différences ne sont pas encore expliquées[44].

En 2019, alors que la Dengue et Zika circulent en grande partie sur les mêmes territoires, il semble que - exceptionnellement - les anticorps que nous produisons pour résister aux flavivirus puissent, aussi un rôle négatif dans certaines circonstances : les anticorps produits en réponse à une 1ère Dengue, peuvent exacerber la maladie de la dengue chez les personnes subissant une seconde infection par un autre sérotype DENV. « L’apparition inattendue de maladies congénitales à la suite de l'introduction du ZIKV sur le continent américain a laissé entrevoir la possibilité que des anticorps à réactivité croisée produits lors d’une exposition antérieure au DENV puissent aggraver la maladie Zika via des mécanismes similaires à ceux qui augmentent le degré de sévérité de la dengue DENV5 après une deuxième infection par le DENV6 »[10].

Plusieurs organisations, institutions, revues scientifiques… s'engagent publiquement à laisser en accès direct, libre et gratuit, ouvert à tous, toutes leurs données concernant l'épidémie zika, en refusant tout embargo[45]. Leur appel est largement suivi.

Un groupe de médecins brésiliens lance un manifeste[46] mettant en cause un insecticide, le pyriproxyfène de la firme Monsanto, utilisé contre les moustiques vecteurs de la dengue, et exonérant le rôle du virus Zika dans les cas de microencéphalie. Selon le rédacteur, il est nécessaire d'attendre mars ou avril 2016 les conclusions de l'OMS[A 19] - [A 20]. Le 11 mars 2016, l'OMS indique que le pyriproxyfène n'entraine pas la microcéphalie, dans un communiqué listant quelques rumeurs à dissiper[47].

• Référence Arbovirus Catalog : Zika virus (en)
• (fr) Référence Catalogue of Life : Flavivirus: zika_virus ICTV
• (en) Référence NCBI : Zika virus (taxons inclus)

• Épidémie de fièvre Zika en Amérique
• Syndrome de Guillain-Barré
• Encéphalomyélite aiguë disséminée

• Yang Liu, Jianying Liu, Senyan Du, Chao Shan, Kaixiao Nie & al. (2017) « Evolutionary enhancement of Zika virus infectivity in Aedes aegypti mosquitoes », Nature, mis en ligne le 17 mai 2017, Doi:10.1038/nature22365 (résumé)

• Ressources relatives à la santé :
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• (en) Zika virus infection sur le site du Centre européen pour la prévention et le contrôle des maladies