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National Center for Biotechnology Information

Le National Center for Biotechnology Information (NCBI), en français « Centre amĂ©ricain pour les informations biotechnologiques Â», est un institut national amĂ©ricain pour l'information biologique molĂ©culaire.

National Center for Biotechnology Information
Le logo du NCBI Ă©voque la double spirale de l'ADN.
Histoire
Fondation
Cadre
Sigle
(en) NCBI
Type
Siège
Pays
Coordonnées
38° 59′ 45″ N, 77° 05′ 56″ O
Organisation
Organisation mère
Site web
Carte

Cet organisme, fondé en 1988 et situé à Bethesda dans le Maryland, fait partie de la Bibliothèque américaine de médecine, un des Instituts américains de la santé.

Missions

Le NCBI conduit des recherches dans la biologie informatique, développe des logiciels pour analyser des données de génome et fournir des informations biomédicales.

Le NCBI n'est pas une base de données, mais il développe aussi des bases de données publiques telles que :

Il est en quelque sorte le pendant américain de l’Institut européen de bio-informatique (EBI).

Le NCBI propose et contient une base de donnĂ©es NCBI taxonomy qui n'est qu'indicative. Le site internet du NCBI prĂ©cise que cette base n'est pas une source fiable pour la nomenclature ou de classification, et qu'il faut consulter la littĂ©rature scientifique pertinente pour les informations les plus fiables[1]. La taxonomie du NCBI reprĂ©sente environ 10 % des espèces vivantes de la planète. Cette taxonomie est une classification curĂ©e et se propose comme une nomenclature organisĂ©e pour les sĂ©quences d'organismes dans des bases de donnĂ©es publiques[2]. Le TaxID (identifiant unique dans la taxonomie du NCBI) sert de lien entre les trois bases de donnĂ©es du International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC, « Collaboration internationale en bases de donnĂ©es de sĂ©quences nuclĂ©otidiques »)[3] dont sont membres la DNA Data Bank of Japan (DDBJ), le NCBI (États-Unis) et l'Institut europĂ©en de bio-informatique (EMBL-EBI, Europe)[4].

Notes et références

  1. (en) « Disclaimer: The NCBI taxonomy database is not an authoritative source for nomenclature or classification - please consult the relevant scientific literature for the most reliable information. » (Voir bas de page sur cet exemple de recherche.)
  2. (en) « Home - Taxonomy », sur ncbi.nlm.nih.gov (consulté le ).
  3. (en) Scott Federhen, Karen Clark, Tanya Barrett et Helen Parkinson, « Toward richer metadata for microbial sequences: replacing strain-level NCBI taxonomy taxids with BioProject, BioSample and Assembly records », Standards in Genomic Sciences, vol. 9, no 3,‎ , p. 1275 (ISSN 1944-3277, DOI 10.4056/sigs.4851102, lire en ligne, consulté le ).
  4. (en) « International Nucleotide Sequence Database Collaboration », sur insdc.org (consulté le ).

Voir aussi

Articles connexes

  • Entrez, le système global de recherches inter-bases de donnĂ©es du NCBI.
  • BLAST, un logiciel du NCBI, permettant la comparaison de sĂ©quences de nuclĂ©otides et de protĂ©ines.
  • La liste des pages WikipĂ©dia dĂ©crivant un taxon utilisant une rĂ©fĂ©rence au NCBI.

Liens externes

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