Flavivirus

Ce groupe comprend entre autres :

• le virus de la dengue
• le virus de la fièvre jaune
• le virus de l'encéphalite de Saint Louis
• le virus de l'encéphalite japonaise
• le virus du Nil occidental
• le virus Zika
• le virus de l'encéphalite à tiques
• le BYD virus, identifié en Chine en 2010, qui affecte les canards.

Ce sont des virus à ARN positif simple brin. Ils mesurent entre 40 et 50 nm en moyenne et leur génome fait environ 10 000 paires de bases. Leur génome code 10 protéines : 3 structurales (C, prM, E) et 7 non structurales (NS1, NS2…)

Ces virus sont principalement transmis par les moustiques. Ils posent des problèmes de santé publique, notamment en zone urbaine (transmission par Aedes aegypti).

Ils ont un cycle de réplication semblable entre eux : l'entrée dans la cellule cible se fait grâce à la protéine E qui va se lier aux récepteurs cellulaires et entraîner une endocytose. Le virus est alors embarqué dans une vésicule endosomiale. Le pH acide de cette dernière va entraîner une fusion de l'enveloppe virale et de la membrane endosomiale, relargant alors le génome dans le cytosol[2]. Le génome ARN est alors directement traduit en une polyprotéine qui va donner les 10 protéines virales. La RNA-dependent-RNA-polymérase va alors copier le génome pour créer un brin « matrice » servant à la réplication de tous les ARN viraux. Les virions immatures formés se retrouvent dans le réticulum endoplasmique pour être liés aux proto protéines prM et E, puis vont dans l'appareil de Golgi où une furine va cliver les deux protéines pour permettre aux virions de prendre leur forme finale. Les virions matures sont alors transportés par des vésicules et passent dans le milieu extracellulaire par exocytose[3].

L'ICTV recense les 53 espèces suivantes :

• (en) Référence ICTV : Flavivirus (consulté le 1^er février 2021)