Riboviria
Riboviria est un domaine (distinct des domaines du vivant) de la classification des virus introduit en 2018 par l'ICTV[3]. C'est un taxon qui comprend tous les virus qui utilisent une polymérase dépendant de l'ARN homologue pour la réplication (HIV, Coronavirus, Influenza, Rougeole). Il comprend des virus à ARN qui codent une ARN polymérase dépendant de l'ARN et des virus à transcription inverse (avec des génomes d'ARN ou d'ADN) qui codent une ADN polymérase dépendant de l'ARN. L'ARN polymérase dépendant de l'ARN (RdRp), ou ARN réplicase, produit de l'ARN (acide ribonucléique) à partir de l'ARN. L'ADN polymérase dépendant de l'ARN (RdDp), ou transcriptase inverse (RT), produit de l'ADN (acide désoxyribonucléique) à partir de l'ARN. Tous les virus à ARN ont des ARN réplicases homologues qui sont aussi homologues aux reverse transcriptases.Ces réplicases sont essentielles pour répliquer le génome viral et transcrire les gènes viraux en ARN messager (ARNm) pour la traduction des protéines virales[4] - [5]. Par contre ces virus à ARN n'ont pas tous la même protéine de capside. Beaucoup de virus à ARN ont comme protéine de capside la Single Jelly Roll fold (SJR)(voir Jelly roll fold sur Wikipedia en anglais).
Il contenait (jusqu'en 2018) un seul embranchement phylogénétique : les Negarnaviricota, regroupant tous les virus à ARN monocaténaire de polarité négative[6].
Liste des embranchements
Selon NCBI (24 janvier 2021)[7] :
- Règne des Orthornavirae
- Artverviricota
- Règne des Pararnavirae
- Duplornaviricota
- Kitrinoviricota
- Lenarviricota
- Negarnaviricota
- Pisuviricota
Notes et références
- ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 23 janvier 2021
- (en) « Virus Taxonomy: 2018b Release », ICTV, (consulté le ).
- (en) Peter J. Walker, Stuart G. Siddell, Elliot J. Lefkowitz, Arcady R. Mushegian, Donald M. Dempsey, Bas E. Dutilh, Balázs Harrach, Robert L. Harrison, R. Curtis Hendrickson, Sandra Junglen, Nick J. Knowles, Andrew M. Kropinski, Mart Krupovic, Jens H. Kuhn, Max Nibert, Luisa Rubino, Sead Sabanadzovic, Peter Simmonds, Arvind Varsani, Francisco Murilo Zerbini et Andrew J. Davison, « Changes to virus taxonomy and the International Code of Virus Classification and Nomenclature ratified by the International Committee on Taxonomy of Viruses (2019) », Archives of Virology,‎ , p. 1-13 (PMID 31187277, DOI 10.1007/s00705-019-04306-w, lire en ligne)
- (en) « Create a megataxonomic framework, filling all principal taxonomic ranks, for realm Riboviria » [docx], sur International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), .
- (en) « ICTV Taxonomy history: Riboviria », sur talk.ictvonline.org, International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (consulté le ).
- (en) Jens H. Kuhn, Yuri I. Wolf, Mart Krupovic, Yong-Zhen Zhang, Piet Maes, Valerian V. Dolja et Eugene V. Koonin, « Classify viruses — the gain is worth the pain », Nature, vol. 566, no 7744,‎ , p. 318-320 (PMID 30787460, DOI 10.1038/d41586-019-00599-8, Bibcode 2019Natur.566..318K, lire en ligne)
- NCBI, consulté le 24 janvier 2021
Références biologiques
- (en) Référence ICTV : Riboviria (consulté le )
- (en) Référence NCBI : Riboviria (taxons inclus) (consulté le )