Désoxyribonucléase
La désoxyribonucléase (ou ADNase ou DNAse) est une enzyme clivant les acides désoxyribonucléiques en nucléotides ou polynucléotides. Elle hydrolyse les liaisons phosphodiester.
| Désoxyribonucléase | ||
 Structure d'une DNase I humaine (PDB 4AWN) | ||
| Caractéristiques générales | ||
|---|---|---|
| Symbole | DNASE | |
| Code ATC | B06 | |
| Gène DNASE1 – DNase I | ||
| Homo sapiens | ||
| Locus | 16p13.3 | |
| Masse moléculaire | 31 434 Da[1] | |
| Nombre de résidus | 282 acides aminés[1] | |
| N° EC | 3.1.21.1 | |
| Liens accessibles depuis GeneCards et HUGO. | ||
| Gène DNASE2 – DNase II lysosomale | ||
| Homo sapiens | ||
| Locus | 19p13.13 | |
| Masse moléculaire | 39 581 Da[1] | |
| Nombre de résidus | 360 acides aminés[1] | |
| N° EC | 3.1.22.1 | |
| Liens accessibles depuis GeneCards et HUGO. | ||
| Gène DNASE2B – DNase II β | ||
| Homo sapiens | ||
| Locus | 1p31.1 | |
| Masse moléculaire | 41 713 Da[1] | |
| Nombre de résidus | 361 acides aminés[1] | |
| N° EC | 3.1.22.1 | |
| Liens accessibles depuis GeneCards et HUGO. | ||
Prenons le cas de la DNase I : cette endonucléase réalise une coupure de type a, de préférence sur les bases pyrimidiques. En présence d'ions manganèse (Mn2+), elle coupe les deux brins en bouts francs ; avec des ions magnésium (Mg2+) elle coupe un brin en petits fragments.
Coupure de type a en bouts francs
5'-----'3'-OH + P-5-----3' 3'-----'5'-P HO-3-----5'
La réaction catalysée est la suivante :
ADN + H2O → nucléotides et/ou polynucléotides
Chez les bactéries, on distingue deux types de DNAses :
- Les désoxyribonucléases thermolabiles ;
- Les désoxyribonucléases thermostables, ou thermonucléases.
| IUBMB | Entrée IUBMB |
|---|---|
| IntEnz | Vue IntEnz |
| BRENDA | Entrée BRENDA |
| KEGG | Entrée KEGG |
| MetaCyc | Voie métabolique |
| PRIAM | Profil |
| PDB | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum |
| GO | AmiGO / EGO |
| IUBMB | Entrée IUBMB |
|---|---|
| IntEnz | Vue IntEnz |
| BRENDA | Entrée BRENDA |
| KEGG | Entrée KEGG |
| MetaCyc | Voie métabolique |
| PRIAM | Profil |
| PDB | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum |
| GO | AmiGO / EGO |
Bactériologie
De nombreuses bactéries possèdent une ou plusieurs enzymes capables d'hydrolyser l'ADN. La mise en évidence de l'enzyme se fait sur les géloses à l'ADN.
Par exemple :
- Chez les Staphylococcus, la mise en évidence d'une thermonucléase suffit à l'identification de l'espèce Staphylococcus aureus. De plus chez cette espèce, La DNAse sécrétée est capable d'hydrolyser des acides ribonuléiques (elle possède une activité RNAse).
- Chez les Enterobacteriaceae TDA négatives, seules les souches appartenant au genre Serratia sécrètent une DNAse.
Applications pratiques
En bactériologie, la recherche de la DNAse est un critère important dans l'identification de nombreux genres et espèces : Streptococcus ß-hémolytiques, Moraxella, Pseudomonas aeruginosa, Brevundimonas diminua, Stenotrophomonas maltophilia, Vibrio, Aeromonas, Bacillus, Micrococcus etc.
Notes et références
- Les valeurs de la masse et du nombre de résidus indiquées ici sont celles du précurseur protéique issu de la traduction du gène, avant modifications post-traductionnelles, et peuvent différer significativement des valeurs correspondantes pour la protéine fonctionnelle.