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MetaCyc

La base de donnĂ©es MetaCyc contient un grand nombre d'informations sur le mĂ©tabolisme et les enzymes de nombreux ĂȘtres vivants : structure des enzymes, cofacteurs, activateurs et inhibiteurs, spĂ©cificitĂ©s de substrat, et, dans certains cas, constantes cinĂ©tiques. Elle fournit Ă©galement des commentaires et des rĂ©fĂ©rences dans la littĂ©rature. MetaCyc recueille essentiellement des donnĂ©es expĂ©rimentales sur les voies mĂ©taboliques[1] - [2].

MetaCyc est utilisĂ©e comme jeu de donnĂ©es de rĂ©fĂ©rence en vue de prĂ©dire le mĂ©tabolisme d'ĂȘtres vivants en fonction du sĂ©quençage de leur gĂ©nome ; cela a Ă©tĂ© notamment le cas de centaines d'organismes, y compris ceux du BioCyc Database Collection.

Références
  1. (en) « Publications MetaCyc »
  2. (en) Caspi R, Foerster H, Fulcher CA, et al., « The MetaCyc Database of metabolic pathways and enzymes and the BioCyc collection of Pathway/Genome Databases », Nucleic Acids Res., vol. 36,‎ , D623–31 (PMID 17965431, PMCID 2238876, DOI 10.1093/nar/gkm900, lire en ligne)

Lien externe
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