Bacillus
Les Bacillus forment un genre de bactéries à gram positif, appartenant à la famille des bacillacées (Bacillaceae), l’ordre des bacillales (Bacillales), la classe des bacilles (Bacillis), le phyllum des firmicutes (Firmicutes).
| Règne | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Firmicutes |
| Classe | Bacilli |
| Ordre | Bacillales |
| Famille | Bacillaceae |
Espèces de rang inférieur
De forme bacilles, les dimensions de ces bactéries sont variables ; elles peuvent aller de (0.5 × 1.2 µm) à (2.5 × 10 µm). Elles sont aérobies ou aéro-anaérobies facultatives, et tirent leur énergie par respiration ou fermentation. Ces bactéries sont capables de produire des endospores leur permettant de résister à des conditions environnementales défavorables. Celles-ci donneront naissance à de nouvelles bactéries en cas de conditions favorables.
Les Bacillus sont hétérotrophes, saprophytes et ubiquitaires. Elles sont fréquemment retrouvées dans le sol où certaines espèces ont un rôle dans le cycle du carbone et de l'azote. On peut trouver des Bacillus dans des denrées alimentaires.
Les bactéries du genre Bacillus sont connues comme étant capables de former des inclusions intracellulaires de polyhyxyalcanoates sous des conditions de stress (ex : déficit d’éléments tels que le phosphore, l’azote, l’oxygène combiné avec un excès en sources carbonées).
Il en existe un grand nombre d'espèces avec des propriétés physiologiques et des habitats très variés (terre, poussière, etc.). Certaines espèces sont trouvées dans l'eau douce, d'autres dans l'eau de mer. Il existe des espèces thermophiles, acidophiles, psychrophiles, alcalinophiles. Les espèces saprophytes sont responsables de multiples dégradations de produits alimentaires (sûrissement et caillage du lait, etc.). Certains d'entre eux ont des rôles utiles comme producteurs d'antibiotiques (tyrothricine, polymyxines, bacitracine...) ou d'antifongiques (mycosubtiline).
- Bacillus anthracis, responsable de la maladie du charbon.
- Bacillus cereus, ubiquitaire, présent dans le sol et nombreux autres environnements, certaines souches sont pathogènes.
- Bacillus licheniformis.
- Bacillus megaterium, très fréquent dans le sol. Il est impliqué dans le cycle du phosphore et plus précisément dans la minéralisation du phosphore organique.
- Bacillus subtilis, ubiquitaire, bactérie du sol, utilisé en biotechnologie, également impliqué dans le cycle du phosphore pour les mêmes fonctions que Bacillus megaterium.
- Bacillus thuringiensis, pathogène des insectes nuisibles en agriculture. Il peut être utilisé pour les combattre.
- Bacillus mesentericus...
- Bacillus amyloliquefaciens, proche parent de Bacillus subtilus, utilisé dans la production industrielle d'amylase,
- Bacillus coagulans, producteur d'acide lactique est utilisé dans la production industrielle de cet acide organique
- Paenibacillus
Matrice d'identification des bactéries du genre Bacillus
La présence d'un caractère chez 100 % des souches est notée par 1 ou "+1", et l'absence chez 100 % des souches de ce caractère par "-1" et le caractère variable à 50 % par "0" ou une cellule vide. L'absence d'information correspond à une case vide. La variabilité des autres caractères est calculée selon la formule :
| Gen | Espèce | -1 = Coccoïde; 1 = Bacilloïde | Diamètre bactérien (µm) | disposé en Chaine / Train | Mobilité | Spore centrale | Spore intermédiaire | Spore terminale | Spore déformante | Cristaux parasporaux | Corps parasporaux | Forme spore -1 = Sphérique; +1 = Cylindrique | Anaérobie | 50 °C | 65 °C | Lécithinase en milieu Nagler (Réaction au Jaune d'œuf) | Caséinase | Amylose = Amydon Hydrolase | ADH = L-Arginin DeHydrogenase | L-Tryptophane > Indol +Kovacs/James reagent =aldeh>rouge | Gélatinase = Collagenase (film de radiologie ou disc de gel) | NO3 red = Nitrate réductase > Nitrites(rouge) | D-Fructose (oxydation) | D-Gluconate (oxydation) | N-Acétyl-Glucosamine (oxydation) | Glutarate (oxydation) | D/L-Lactate (oxydation) | Putrescine (oxydation) | D-Tréhalose (oxydation) | Gaz en glucose (oxydation) | D-Arabinose | Glycérol (oxydation) | Glycogène (oxydation) | Inuline (oxydation) | D-Mannitol (oxydation) | Salicine (oxydation) | D-Tréhalose (oxydation) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ''Bacillus'' | ''anthracis'' | 0,9 | 1,3 | 0,8 | -0,99 | -0,7 | 0,8 | -0,7 | -1 | -1 | -1 | 0,01 | 0,99 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | -1 | -1 | -1 | 1 | -1 | -1 | -1 | 1 | -1 | -1 | -1 | 1 | |||||||
| Bacillus | ''cereus'' | 0,9 | 1,4 | 0,8 | 0,95 | 0,7 | 0,7 | -0,7 | -1 | -1 | -1 | 0,25 | 0,99 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | -0,5 | -1 | 0,1 | 0,75 | -1 | -1 | 0,25 | 0,25 | -1 | -1 | 0,25 | 1 | |||||||
| Bacillus | subtilis | 0,9 | 0,8 | -0,7 | 1 | 0,8 | 0,8 | -0,8 | -1 | -1 | -1 | 0,01 | -1 | 0,1 | -1 | -1 | 1 | 1 | -1 | -1 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 0,5 | 1 | 1 | 1 | ||||||||
| Bacillus | amylo-liquefaciens | 0,9 | 0,8 | 0,7 | 1 | -0,8 | 0,8 | 0,8 | -1 | -1 | -1 | 0,01 | -1 | 0,1 | -1 | -1 | 1 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | -1 | 1 | 1 | 1 | |||||||
| Bacillus | licheniformis | 0,9 | 0,8 | 0,5 | 1 | 0,7 | 0,7 | -0,3 | -1 | -1 | -1 | 0,5 | 1 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | -1 | 1 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 0,1 | 1 | 1 | 1 | |||||||
| Bacillus | pumilus | 0,9 | 0,7 | -1 | 1 | 0,7 | 0,7 | -0,7 | -1 | -1 | -1 | 0,75 | -1 | 0,1 | -1 | -1 | 1 | -1 | -1 | -1 | 1 | -1 | -1 | -1 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | |||||||
| Bacillus | thurigiensis | 0,9 | 1,4 | 0,9 | 0,9 | -0,5 | 0,7 | -0,5 | -1 | 1 | -1 | 0,25 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 1 | -1 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | -1 | -1 | 0,5 | 1 | ||||||||
| Bacillus | mycoides | 0,9 | 1,3 | 0,95 | -0,95 | 0,4 | 0,7 | -0,5 | -1 | -1 | -1 | 0,01 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 0,1 | -1 | 1 | 0,5 | -1 | -1 | 1 | 1 | -1 | -1 | 0,5 | 1 | |||||||
| Bacillus | megaterium | 0,9 | 1,5 | 0,95 | 0,95 | 0,7 | 0,7 | -0,5 | -1 | -1 | -1 | -0,5 | -1 | -1 | -1 | -1 | 1 | 1 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | |||||||
| Bacillus | circulans | 0,9 | 0,8 | -0,7 | 1 | -0,7 | 0,7 | 0,7 | 1 | -1 | -1 | 0,01 | 1 | -1 | -1 | -1 | -1 | 1 | -0,5 | -1 | 0,1 | 0,5 | -1 | -1 | 0,1 | 0,1 | 0,5 | 1 | 1 | 1 | |||||||
| Bacillus | firmus | 0,9 | 0,8 | -1 | 1 | 0,1 | 0,7 | -0,7 | 0,01 | -1 | -1 | 0,01 | -1 | -1 | -1 | -1 | 1 | 1 | -1 | -1 | 1 | 0,5 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1 | 0,1 | -1 | 0,1 | |||||||
| Bacillus | lentus | 0,9 | 0,8 | 0,5 | 1 | 0,7 | 0,7 | -0,7 | 0,01 | -1 | -1 | 0,01 | -1 | -1 | -1 | -1 | 0,1 | 1 | -1 | -1 | 1 | 0,5 | -1 | -1 | 0,1 | 0,1 | -0,5 | 0,5 | 1 | 0,5 | |||||||
| Bacillus | coagulans | 0,9 | 0,8 | 0,1 | 1 | -0,7 | 0,7 | 0,7 | 1 | -1 | -1 | 0,01 | 1 | 1 | -1 | -1 | 0,1 | 1 | 0,1 | -1 | 1 | -0,51 | -1 | -1 | 1 | -1 | -1 | 0,1 | 1 | 1 | |||||||
| Bacillus | stearothermophilus | 0,9 | 0,9 | -1 | 1 | -0,7 | 0,7 | 0,7 | 1 | -1 | -1 | 0,01 | -1 | 1 | 1 | -1 | 0,5 | 1 | -1 | -1 | 1 | 0,1 | -1 | -1 | 0,5 | 1 | -1 | -1 | -0,5 | 1 | |||||||
| Bacillus | thermodenitrificans | 0,9 | 0,8 | 0,1 | -1 | -0,7 | 0,7 | -0,7 | -1 | -1 | -1 | 0,01 | -1 | 1 | 1 | -1 | -0,5 | 1 | -1 | -1 | 0,5 | -1 | -1 | 0,5 | -1 | -1 | 0,1 | 0,1 | 1 | ||||||||
| Bacillus | sphaericus | 0,9 | 1 | -0,7 | 1 | -0,7 | 0,7 | 0,7 | 1 | -1 | -1 | -0,75 | -1 | -1 | -1 | -1 | -0,1 | 1 | -1 | -1 | -0,5 | 1 | -0,5 | -0,5 | 1 | -0,5 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1 | 0,1 | -1 | ||||
| Bacillus | badius | 0,9 | 0,9 | 1 | 1 | 0,7 | 0,7 | 0,7 | -1 | -1 | -1 | 0,01 | -1 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | -1 | -1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1 | 1 | -1 | ||||
| Virgibacillus | pantothenticus | 0,9 | 0,6 | 1 | -0,7 | 0,7 | 0,7 | 1 | -1 | -1 | -0,5 | -1 | 0,1 | -1 | 1 | 1 | -0,5 | -1 | -1 | 0,1 | -1 | 1 | 1 | -1 | -1 | -1 | 1 | 1 | |||||||||
| Paenibacillus | polymyxa | 0,9 | 0,9 | -1 | 1 | 0,7 | 0,7 | -0,7 | 1 | -1 | -1 | 0,01 | 1 | -1 | -1 | -1 | 1 | 1 | -1 | -1 | -1 | 0,5 | 1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | |||||||
| Paenibacillus | alvei | 0,9 | 0,8 | -0,5 | 1 | 0,7 | 0,7 | -0,7 | 1 | -1 | -1 | 0,5 | 1 | -1 | -1 | -1 | 1 | 1 | -1 | 1 | -0,94 | -1 | -1 | -1 | 1 | 0,5 | -1 | -1 | 0,5 | 0,5 | |||||||
| Paenibacillus | macerans | 0,9 | 0,7 | -1 | 1 | -0,7 | 0,7 | 0,7 | 1 | -1 | -1 | 0,01 | 1 | 0,1 | -1 | -1 | -1 | 1 | -1 | -1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | |||||||
| Paenibacillus | validus | 0,9 | 0,8 | 1 | 1 | -0,7 | 0,7 | 0,7 | 1 | -1 | 1 | 0,01 | 0,1 | -1 | -1 | -1 | 1 | -1 | -1 | -0,94 | 0,5 | -1 | -1 | 1 | 0,1 | 0,1 | 1 | -1 | 1 | ||||||||
| Aneurinibacillus | aneurinilyticus | 0,9 | 0,8 | -1 | 1 | 0,7 | 0,7 | -0,7 | 1 | -1 | 1 | 0,01 | -1 | 1 | -1 | -1 | -1 | 1 | -1 | 0,01 | -1 | 1 | 1 | 1 | -1 | 1 | -1 | -1 | |||||||||
| Brevibacillus | brevis | 0,9 | 0,9 | -1 | 1 | 0,7 | 0,7 | -0,7 | 1 | -1 | -1 | 0,01 | -1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | -1 | -1 | -1 | 1 | 0,1 | 0,1 | -1 | |||||||||
| Brevibacillus | agri | 0,9 | 0,9 | -1 | 1 | 0,7 | 0,7 | -0,7 | 1 | -1 | -1 | 0,01 | -1 | 0,1 | -1 | 1 | 1 | -1 | 1 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | -1 | 1 | 0,1 | |||||||||
| Brevibacillus | laterosporus | 0,9 | 0,9 | -1 | 1 | 0,7 | 0,7 | -0,7 | 1 | -1 | 1 | 0,01 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 1 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 1 | |||||||||