| Légende | PK | Désignation | 
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|  | Origine du chaînage : Paris-Gare de Lyon via Dijon-Ville | 
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|  |  | Ligne de Dijon-Ville à Vallorbe (frontière)  | vers Dijon-Ville | 
|  |  | Bif. de Tavaux, vers la ligne de Chagny à Dole-Ville  | vers Chagny | 
|  | 360,535 | Dole-Ville (231 m) | 
|  | 361,003 | Pont sur la D 475 | (16 m) | 
|  | 361,174 | Bif. | 
|  |  | Bif. vers la ligne de Dole-Ville à Poligny | vers Poligny | 
|  |  | Ligne de Dijon-Ville à Vallorbe (frontière)  | vers Vallorbe | 
|  | 362,800 | Sous-station 63 / 25 kV – 50 Hz de Brevans | 
|  | 363,730 | Passage sous la D 673 | 
|  | 368,236 | Rochefort-sur-Nenon (225 m) | 
|  | 371,355 | Moulin-Rouge (230 m) | 
|  | 375,886 | Orchamps (243 m) | 
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|  | 378,331 | La Barre (235 m) | 
|  | 378,664 | Saut-de-mouton sur la ligne de Gray à Fraisans | (5 m) ; vers | 
|  | 380,698 | Ranchot (241 m) | 
|  | 386,1xx | Limites | 
|  | 387,993 | Saint-Vit (251 m) | 
|  | 393,398 | Dannemarie - Velesmes (251 m) | 
|  | 393,844 | Poste de sectionnement de Dannemarie-sur-Crête | 
|  | 398,415 | Bif. de Franois, vers la ligne de Franois à Arc-et-Senans | vers Arc-et-Senans | 
|  |  | Franois (275 m) | 
|  | 402,319 | Besançon-Saint-Fergeux (276 m) | 
|  | 402,4xx | Pont sur la N 57 | 
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|  | 405,780 | Besançon-Viotte (281 m) | 
|  | 406,113 | Bif. vers la ligne de Besançon-Viotte à Vesoul | vers Vesoul | 
|  | 406,997 | Passage sous la D 683 | 
|  | 407,304 |  | vers Le Locle | 
|  | 408,320 | Tunnel de Châlezeule | (1 104 m) | 
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|  | 410,341 | Pont sur la D 683 | (26 m) | 
|  | 414,585 | Roche-lez-Beaupré (259 m) | 
|  | 416,182 | Passage sous la D 683 | 
|  | 416,469 | Novillars (253 m) | 
|  | 421,727 | Deluz (263 m) | 
|  | 425,332 | Laissey (273 m) | 
|  | 425,549 | Tunnel de Laissey | (40 m) | 
|  | 427,992 | Sous-station 63 / 25 kV – 50 Hz de Douvot | 
|  | 428,056 | Douvot PN no 76 (276 m) | 
|  | 430,022 | Ougney-Douvot (279 m) | 
|  | 432,712 | Tunnel de Fourbanne | (309 m) | 
|  | 435,738 | Tunnel de Champvans | (571 m) | 
|  | 436,652 | Pont sur la D 683 | (13 m) | 
|  | 437,922 | Baume-les-Dames (291 m) | 
|  | 438,272 | Tunnel de Baume-les-Dames | (558 m) | 
|  | 440,303 | Tunnel de Grange-Ravey no 1 | (48 m) | 
|  | 440,412 | Tunnel de Grange-Ravey no 2 | (42 m) | 
|  | 442,512 | Tunnel de Bois-la-Ville | (252 m) | 
|  | 443,753 | Tunnel de Hyèvre-Paroisse | (264 m) | 
|  | 444,892 | Hyèvre-Paroisse PN no 78 (288 m) | 
|  | 445,420 | Passerelle d'Hyèvre | (36 m) | 
|  | 446,284 | Tunnel de Branne | (362 m) | 
|  | 447,590 | Pont sur la D 683 | (13 m) | 
|  | 452,734 | Pont sur la D 683 | (13 m) | 
|  | 453,032 | Tunnel de Clerval | (102 m) | 
|  | 453,510 | Clerval (285 m) | 
|  | 455,956 | Passage sous l'A 36 | 
|  | 456,961 | Pompierre PN no 84 (284 m) | 
|  | 458,520 | Poste de sectionnement de Pompierre-sur-Doubs | 
|  | 459,798 | Pont sur le canal du Rhône au Rhin | (20 m) | 
|  | 460,075 | Pont sur le Doubs | (38 m) | 
|  | 460,660 | Rang PN no 87 (291 m) | 
|  | 461,086 | Tunnel de Rang | (1 162 m) | 
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|  | 462,875 | Passage (avec le canal du Rhône au Rhin) sous la D 683 | 
|  | 463,345 | L'Isle-sur-le-Doubs (292 m) | 
|  | 464,461 | Pont sur le canal du Rhône au Rhin | (19 m) | 
|  | 464,713 | Viaduc de Médière (Doubs) | 
|  | 466,356 | Tunnel de la Prétière | (300 m) | 
|  | 466,723 | Viaduc de la Prétière (Doubs) | 
|  | 467,508 | Pont sur le canal du Rhône au Rhin | (15 m) | 
|  | 468,951 | Saint-Maurice (Doubs) PN no 90 (301 m) | 
|  | 472,204 | Colombier-Fontaine (303 m) | 
|  | 478,505 |  | vers Saint-Hippolyte | 
|  | 478,675 | Viaduc de Voujeaucourt (Doubs) | (32 m) | 
|  | 479,013 | PN no 98 sur la D 438 | 
|  |  | Voujeaucourt (314 m) | 
|  | 481,4xx | Bif. vers le racc. de Montbéliard | 
|  | 482,150 | Bif. vers la ligne de Montbéliard à Morvillars | vers Morvillars | 
|  | 482,249 | Tunnel de Montbéliard | (535 m) | 
|  | 483,246 | Pont sur le canal du Rhône au Rhin | (16 m) | 
|  | 483,411 | Viaduc de l'Allan | (56 m) | 
|  | 489,689 | Pont sur la D 663 ;  tramway de la Vallée d'Hérimoncourt (voie métrique) | (13 m) ; vers Hérimoncourt | 
|  |  | Montbéliard (320 m) | 
|  | 488,0xx | Limites | 
|  | 489,915 | Passage sous le viaduc de la Lizaine (ligne Rhin-Rhône (LGV)  ) | vers | 
|  | 491,676 | Héricourt (343 m) | 
|  | 491,985 | Sous-station 63 / 25 kV – 50 Hz d'Héricourt | 
|  | 494,8xx | Limites | 
|  | 496,624 | Passage sous la N 19 | 
|  | 498,723 | Pont sur le canal de la Haute-Saône | (23 m) | 
|  | 499,819 | Bif. vers le racc. de Belfort | 
|  |  | Lignes : | vers | 
|  |  | Lignes de Belfort à Sochaux et à Réchésy (voie métrique) | vers Sochaux et Réchésy | 
|  |  | Belfort (358 m) | 
|  |  | Ligne de Belfort à Étueffont-Haut (voie métrique) | vers Étueffont | 
|  |  | Ligne de Paris-Est à Mulhouse-Ville  | vers Paris-Est |