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Gammaproteobacteria

Les Gammaproteobacteria sont une classe de bactéries de l'embranchement (ou phylum) des Pseudomonadota (anciennement Proteobacteria)[1]. Avec environ 250 genres c'est la plus grande des classes de Procaryotes. C'est aussi l'une des plus étudiées car elle comporte de nombreux genres d'intérêt médical, écologique et scientifique.

Description

La classe Gammaproteobacteria a été définie en dans le Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Elle comprend de plusieurs ordres bactériens parmi les plus connus tels que les Enterobacterales, les Legionellales, les Pseudomonales et les Vibrionales impliquées dans la santé humaine. Cette classe regroupe des bactéries très ubiquitaires dont certaines ont été retrouvés jusque dans les nuages, pluies et brouillards[2] - [3].

Les exemples suivants illustrent la diversité, l'ubiquité mais aussi l'importance médicale des Gammaproteobacteria :

Taxonomie

Décrites en , les Gammaproteobactéria ont connu de nombreuses modifications au cours des années. En , les Acidithiobacillales ont été déplacées de cette vers une nouvelle classe créée pour les contenir, Acidithiobacillia[4].

En , les Gammaproteobacteria comprennent neuf classes dont sept ayant un nom correctement validés par l'ICSP, une nécessitant un changement de nom et une autre publiée de manière invalide[5].

Liste d'ordres

Ordres validement publiés

Selon la LPSN (6 novembre 2022)[6] :

Ordres reclassés (synonymes)

Selon la LPSN (6 novembre 2022)[6] les ordres suivants ont été reclassés :

Ordres en attente de publication valide

Selon la LPSN (6 novembre 2022)[6] (Ca. signifie Candidatus) :

  • « Ca. Comchoanobacterales » Needham et al. 2022
  • « Ca. Tethybacterales » Taylor et al. 2021
  • « Vibrionales » Garrity & Holt 2001

Non classés dans un ordre

Parmi les non-classifiées [7]Azoamicus ciliaticola endosymbiote d'un cilé et caractérisé par sa capacité à réaliser une dénitrification à l’intérieur de leur hôte, en milieux aqueux dépourvu d'oxygène.

Références

  1. (en) George M. Garrity, Julia A. Bell et Timothy G. Lilburn, « Class III. Gammaproteobacteria class. nov. », dans D. J. Brenner, N. R. Krieg, J. T. Staley, G. M. Garrity, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol. 2 : The Proteobacteria, part B (The gammaproteobacteria), New York, Springer, , 2e éd., XXVIII-1106 p. (ISBN 978-0387-24144-9, BNF 39993051), p. 1.
  2. Delort A.M & Parazols M (2007) Des microorganismes dans les nuages? In Les Mercredis de la Science., mars 2017
  3. Delort, A. M., Vaïtilingom, M., Amato, P., Sancelme, M., Parazols, M., Mailhot, G., ... & Deguillaume, L. (2010). A short overview of the microbial population in clouds: Potential roles in atmospheric chemistry and nucleation processes. Atmospheric Research, 98(2-4), 249-260.
  4. (en) Kelly P Williams et Donovan P Kelly, « Proposal for a new class within the phylum Proteobacteria, Acidithiobacillia classis nov., with the type order Acidithiobacillales, and emended description of the class Gammaproteobacteria », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 63, no 8, , p. 2901-2906 (PMID 23334881, DOI 10.1099/ijs.0.049270-0)
  5. (en) « Class Gammaproteobacteria », sur LPSN,
  6. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 6 novembre 2022
  7. (en) « Candidatus Azoamicus ciliaticola », sur NCBI taxonomy database (consulté le )

Références biologiques

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