Haplogroupe CT
En génétique humaine, l'haplogroupe CT est un haplogroupe du chromosome Y, définissant une des lignées ancestrales majeures communes à l'humanité le long des lignées mùles de pÚre en fils.
Les hommes dans cet haplogroupe ont un chromosome Y avec la mutation SNP M168, accompagnée des mutations P9.1 et M294. Ces mutations sont présentes dans toutes les lignées mùles humaines excepté les A et B, qui sont tous deux presque exclusivement africains.
Généralités
Le plus rĂ©cent ancĂȘtre patrilinĂ©aire commun (en anglais MRCA ou Most Recent Common Ancestor) de tous les hommes CT d'aujourd'hui est probablement plus ancien que la premiĂšre migration de Homo sapiens hors d'Afrique (Out of Africa), migration Ă laquelle quelques-uns de ses descendants participĂšrent. Il aurait vĂ©cu en Afrique avant cette migration fortement supposĂ©e[3] - [2] - [4].
En conservant le concept de l'Adam Y-chromosomal (plus rĂ©cent ancĂȘtre patrilinĂ©aire commun de tous les hommes vivants), CT-M168 est popularisĂ© dans des articles comme le lignage de l'Adam Eurasien (plus rĂ©cent ancĂȘtre patrilinĂ©aire commun Ă tous les non-Africains).
Aucun individu masculin n'a encore Ă©tĂ© dĂ©couvert dans le paragroupe CT*, ce qui signifie que tous les hommes dans cet haplogroupe sont aussi dĂ©finis comme Ă©tant dans une de ses branches majeures, les subclades. Tous les lignages connus survivants qui descendent de CT sont dans un des deux subclades majeurs, l'haplogroupe CF et l'haplogroupe DE. Tous les deux semblent ĂȘtre apparus seulement quelques milliers d'annĂ©es aprĂšs le premier ancĂȘtre commun de CT. Ă son tour, DE est divisĂ© en un haplogroupe D trĂšs majoritairement asiatique (et marginalement africain[5]) et un haplogroupe E distribuĂ© surtout en Afrique, tandis que CF est divisĂ© en un haplogroupe C est-asiatique, nord-amĂ©ricain (marginalement sud-amĂ©ricain[6]) et ocĂ©anien et un haplogroupe F, qui est dominant dans la plupart des populations non-africaines[3].
L'haplogroupe CT est donc le lignage ancĂȘtre commun Ă beaucoup d'hommes vivants aujourd'hui, incluant la plupart des Africains parmi lesquels l'haplogroupe E prĂ©domine, et beaucoup de non-Africains, parmi lesquels l'haplogroupe F prĂ©domine.
Sous-clades
- Haplogroupe CF (P143)
- Haplogroupe C (Y-ADN) (M130, M216) : en Asie, Océanie, et Amérique du Nord
- Haplogroupe C1 (F3393)
- Haplogroupe C1a (CTS11043)
- Haplogroupe C1b (F1370)
- Haplogroupe C1b (K281)
- Haplogroupe C1b1a (B66/Z16458)
- Haplogroupe C1b1a1, anciennement C5 (M356) : en Asie du Sud, Asie centrale, et Asie du Sud-Ouest
- Haplogroupe C1b1a (B66/Z16458)
- Haplogroupe C1b2 (B477/Z31885)
- Haplogroupe C1b2a, anciennement C2 (M38) : en Indonésie, Nouvelle-Guinée, Mélanésie, Micronésie, et Polynésie
- Haplogroupe C1b2b, anciennement C4 (M347) : chez les AborigĂšnes d'Australie
- Haplogroupe C1b (K281)
- Haplogroupe C2, anciennement C3 (M217, P44) : à travers l'Eurasie et l'Amérique du Nord, mais surtout parmi les Mongols, Kazakhs, Tongouses, Paléo-sibériens et en Amérique du Nord, les peuples de langues na-dené
- Haplogroupe C1 (F3393)
- Haplogroupe F (Y-ADN) (M89, M213) : à travers l'Eurasie, l'Océanie, et Les Amériques
- F1 (P91, P104)
- F2 (M427, M428)
- F3 (P96)
- F4 (P254)
- Haplogroupe G (Y-ADN) (M201, P257) : en Europe, Asie de l'Ouest, Asie centrale, Asie du Sud, et Afrique du Nord
- Haplogroupe H (Y-ADN) (M69, M370) : en Asie du Sud, Asie centrale, Asie du Sud-Ouest
- Haplogroupe IJK (Y-ADN) (L15/S137, L16/S138) : en Europe, Asie de l'Ouest, Afrique du Nord et Afrique de l'Est
- Haplogroupe IJ (Y-ADN) (M429/P125) : en Europe, Asie de l'Ouest, Afrique du Nord et Afrique de l'Est
- Haplogroupe I (Y-ADN) (M170, M258, P19, P38, P212, U179) : en Europe
- Haplogroupe J (Y-ADN) (12f2.1, M304) : en Europe, Asie de l'Ouest, Afrique du Nord et Afrique de l'Est
- Haplogroupe K (Y-ADN) (M9) : partout en Eurasie, Afrique du Nord, Océanie, Afrique de l'Est, et les Amériques
- Haplogroupe LT (Y-ADN) (L298/P326)
- Haplogroupe L (Y-ADN) (M11, M20, M22, M61, M185, M295) : sur le sous-continent indien
- Haplogroupe T (Y-ADN) (M70, M184/USP9Y+3178, M193, M272 (anciennement K2)) :en Asie du Sud-Ouest, Asie du Sud, est et sud de l'Inde, Afrique du Nord (Ăgypte, Tunisie, Maroc), la Corne de l'Afrique (Somalie, Ăthiopie), Cameroun (les Peuls), Europe du Sud (PĂ©ninsule IbĂ©rique, Italie, GrĂšce et leurs iles)
- Haplogroupe K(xLT) (M526)
- Haplogroupe M (Y-ADN) (P256) : dans l'est de l'Indonésie, en Papouasie-Nouvelle-Guinée et Mélanésie
- Haplogroupe NO (Y-ADN) (M214)
- Haplogroupe N (Y-ADN) (M231) : en Europe de l'Est, Asie du Nord et Asie de l'Est
- Haplogroupe O (Y-ADN) (M175) : en Océanie et Asie de l'Est
- Haplogroupe P (Y-ADN) (92R7, M45, M74/N12, P27.1/P207)
- Haplogroupe Q (Y-ADN) (M242) : dans les Amériques et l'Eurasie
- Haplogroupe R (Y-ADN) (M207/UTY2, M306/S1) : dans toute l'Eurasie et dans des parties de l'Afrique
- Haplogroupe S (YADN) (M230,P202, P204 (anciennement K5)) : dans l'est de l'Indonésie, en Papouasie-Nouvelle-Guinée et Mélanésie
- Haplogroupe LT (Y-ADN) (L298/P326)
- Haplogroupe IJ (Y-ADN) (M429/P125) : en Europe, Asie de l'Ouest, Afrique du Nord et Afrique de l'Est
- Haplogroupe C (Y-ADN) (M130, M216) : en Asie, Océanie, et Amérique du Nord
- Haplogroupe DE (Y-ADN) (M1/YAP, M145/P205, M203/Page36, P144, P153, P165, P167, P183)
- Haplogroupe D (Y-ADN) (M174) : au Tibet, Japon et aux iles Andaman
- Haplogroupe D1 (M15)
- Haplogroupe D2 (M55, M57, M64.1, M179, P37.1, P41.1 (M359.1), 12f2.2)
- Haplogroupe D3 (P99)
- Haplogroupe E (M40, M96) : en Afrique et régions voisines
- Haplogroupe E1 (P147)
- Haplogroupe E1a (anciennement E1) (M33, M132)
- Haplogroupe E1b (P177)
- Haplogroupe E1b1 (anciennement E3) (P2, DYS391p)
- Haplogroupe E1b1a (anciennement E3a) (M2) : en Afrique de l'Ouest, Centrale, de l'Est et du Sud
- Haplogroupe E1b1b (anciennement E3b) (M215) : en Afrique de l'Est (Ăthiopiens, Somalis), Afrique du Nord (BerbĂšres, Touaregs[7]), Moyen-Orient, Europe (surtout rĂ©gions autour de la Mer MediterranĂ©e)
- Haplogroupe E1b1 (anciennement E3) (P2, DYS391p)
- Haplogroupe E2 (M75)
- Haplogroupe E1 (P147)
- Haplogroupe D (Y-ADN) (M174) : au Tibet, Japon et aux iles Andaman
Références
- Kamin M, Saag L, Vincente M, et al., « A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture », Genome Research, vol. 25, no 4,â , p. 459â466 (PMID 25770088, PMCID 4381518, DOI 10.1101/gr.186684.114)
- (en) Linda Stone, Genes, Culture, and Human Evolution, Malden, Blackwell, , 314 p., relié (ISBN 978-1-4051-5089-7, lire en ligne), « Voyages, Prehistoric Human Expansions », p. 187
- T.M. Karafet, F.L. Mendez, M.B. Meilerman, P.A. Underhill, S.L. Zegura et M.F. Hammer, « New binary polymorphisms reshape and increase resolution of the human Y chromosomal haplogroup tree », Genome Research, vol. 18, no 5,â , p. 830â8 (PMID 18385274, PMCID 2336805, DOI 10.1101/gr.7172008, lire en ligne)
- Underhill and Kivisild et T Kivisild, « Use of Y Chromosome and Mitochondrial DNA Population Structure in Tracing Human Migrations », Annu. Rev. Genet., vol. 41, no 1,â , p. 539â64 (PMID 18076332, DOI 10.1146/annurev.genet.41.110306.130407)
- (en) M. Haber, A.L. Jones, B.A. Connel, Asan, E. Arciero, Y. Huanming, M.G. Thomas, Y. Xue et C. Tyler-Smith, « « A Rare Deep-Rooting D0 African Y-chromosomal Haplogroup and its Implications for the Expansion of Modern Humans Out of Africa » », Genetics,â (lire en ligne)
- (en) Massimo Mezzavilla, Maria Geppert, Chris Tyler-Smith, Lutz Roewer, Yali Xue, « Insights into the origin of rare haplogroup C3* Y chromosomes in South America from high-density autosomal SNP genotyping », Forensic Science International: Genetics,â
- Pereira et al. (2010), Linking the sub-Saharan and West Eurasian gene pools: maternal and paternal heritage of the Tuareg nomads from the African Sahel, European Journal of Human Genetics (2010) 18, 915â923; doi:10.1038/ejhg.2010.21