Corynebacterium amycolatum
Corynebacterium amycolatum est une espèce de bacilles à Gram positif, non sporulée, aérobique ou anaérobique facultative, apte à la fermentation[2] avec l'acide propionique comme principal produit final de son métabolisme des glucides. L'un de ses semblables les plus connus est Corynebacterium diphtheriae, l'agent responsable de la diphtérie. C. amycolatum est un composant commun du microbiome cutané humain et des muqueuses, et en tant que tel, il est souvent ignoré par les médecins comme contaminant lorsqu'il est trouvé dans les cultures sanguines[3]. Cependant, C. amycolatum est en réalité un pathogène opportuniste capable de provoquer des maladies humaines graves telles que l'endocardite et la septicémie.
| Règne | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Actinobacteria |
| Classe | Actinomyctetes |
| Ordre | Mycobacteriales |
| Famille | Corynebacteriaceae |
| Genre | Corynebacterium |
Identification
Décrite pour la première fois en 1988, C. amycolatum est l'une des diphtéroïdes les plus souvent isolées des échantillons cliniques. Cependant, il est souvent difficile de la différencier d'autres corynébactéries fermentatives telles que C. minutissimum et C. xerosis, qui sont toutes deux des pathogènes connus comme pouvant infecter les humains. Une méthode de différenciation est l'observation de la paroi cellulaire. Contrairement aux autres membres de ce genre, C. amycolatum est dépourvu d'acide mycolique, des acides gras longs habituellement présents dans la paroi cellulaire. C. amycolatum se distingue également par la morphologie de ses colonies ; l'espèce produit de manière caractéristique des colonies plates, gris blanchâtre, mates ou cireuses sur la gélose de sang de Schaedler. Sa sensibilité aux antibiotiques peut également aider à son identification : l'organisme est généralement résistant à plusieurs antibiotiques. Cependant, en raison de son statut relativement nouveau d'agent pathogène, aucun test de laboratoire standard ne permet encore d'identifier C. amycolatum[2].
Maladie
Il a été démontré que C. amycolatum est à l'origine de pneumonies, de péritonites, d'empyèmes, d'endocardites infectieuses et de septicémies mortelles, dont la plupart sont des infections nosocomiales. En tant qu'agent pathogène opportuniste, la bactérie est pathogène chez les patients immunodéprimés, infectant principalement ceux qui présentent des anomalies cardiaques sous-jacentes ou des dispositifs intravasculaires. L'endocardite provoquée par C. amycolatum infecte généralement le côté gauche du cœur chez les hommes, bien que C. amycolatum ait montré une prédilection pour les femmes[4]. Bien que les cas de maladie aient été peu nombreux, cette sous-déclaration pourrait être due à un mauvais diagnostic de C. amycolatum en tant que C. xerosis, qui est un pathogène humain connu[3] - [5].
Traitement
Pour les quelques cas recensés à ce jour, la vancomycine ou la daptomycine a été utilisée en association avec la rifampicine pour une durée allant de quatre semaines à six mois[6]. Le remplacement de la valve a également été nécessaire dans certains cas d'endocardite infectieuse[7]. Cependant, en raison de son statut pathogène récent, peu de traitements ont été testés et un schéma thérapeutique optimal reste à établir.
RĂ©sistance aux antibiotiques
L'une des caractéristiques de C. amycolatum est sa résistance à une large gamme d'antibiotiques. Diverses souches testées ont montré une résistance aux antibiotiques bêta-lactamines, aux lincosamides, aux macrolides et aux quinolones. Les souches multirésistantes ont été principalement isolées de plaies de patients traités dans les services de chirurgie générale et de chirurgie vasculaire. Cependant, la bactérie s'est révélée particulièrement sensible aux antibiotiques glycopeptides et lipopeptides[8].
Notes et références
- Integrated Taxonomic Information System (ITIS), www.itis.gov, CC0 https://doi.org/10.5066/F7KH0KBK, consulté le 30 août 2021
- (en) « Corynebacterium amycolatum: An Unexpected Pathogen in the Ear », Journal of Clinical & Diagnostic Research, vol. 9, no 12,‎ , DD01–DD03 (PMID 26816893, PMCID 4717710, DOI 10.7860/JCDR/2015/15134.7002)
- (en) Knox, « Nosocomial Endocarditis Caused by Corynebacterium amycolatum and Other Nondiphtheriae Corynebacteria », Emerging Infectious Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, vol. 8, no 1,‎ , p. 97–9 (PMID 11749760, PMCID 2730276, DOI 10.3201/eid0801.010151, lire en ligne, consulté le )
- (en) Belmares, Stephanie Detterline, Janet B Pak et Jorge P Parada, « Corynebacterium endocarditis species-specific risk factors and outcomes », BMC Infectious Diseases, vol. 7,‎ , p. 4 (PMID 17284316, PMCID 1804271, DOI 10.1186/1471-2334-7-4)
- (en) Berner, K Pelz, C Wilhelm et A Funke, « Fatal sepsis caused by Corynebacterium amycolatum in premature infant », Journal of Clinical Microbiology, vol. 35, no 4,‎ , p. 1011–1012 (PMID 9157120, PMCID 229725, DOI 10.1128/JCM.35.4.1011-1012.1997)
- (en) « Corynebacterium amycolatum: An Unexpected Pathogen in the Ear », Journal of Clinical & Diagnostic Research, vol. 9, no 12,‎ , DD01–DD03 (PMID 26816893, PMCID 4717710, DOI 10.7860/JCDR/2015/15134.7002)
- (en) « Endocarditis », The Lecturio Medical Concept Library (consulté le )
- (en) Elmer Koneman, Koneman's Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology, 6 ed, Lippincott Williams & Wilkins, , 798 p. (ISBN 9780781730143, lire en ligne)
- NCBI, consulté le 30 août 2021
Liens externes
- (fr+en) Référence ITIS : Corynebacterium amycolatum Collins & al., 1988 (consulté le )
- (en) Référence NCBI : Corynebacterium amycolatum Collins & al. 1988 (taxons inclus) (consulté le )
- (en) Référence uBio : site déclaré ici indisponible le 7 avril 2023