Alphaproteobacteria
Les Alphaproteobacteria (en français les Alphaprotéobactéries) sont une classe de bactéries à Gram négatif de l'embranchement des Pseudomonadota. Son nom, formé sur les mots grecs alpha (ἄλφα : première lettre de l'alphabet) et Proteus (Προτεύς : Protée, dieu capable de se métamorphoser) complétés du néolatin bacteria (bactérie), n'est exceptionnellement pas dérivé du nom de son ordre type Caulobacterales.
| Règne | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Pseudomonadota |
- Caulobacteria Cavalier-Smith 2020
- Alphabacteria Cavalier-Smith 2002
- Anoxyphotobacteria (Gibbons & Murray 1978) Murray 1988
C'est une classe très diversifiée qui comprend relativement peu de genres pathogènes humains tels que Bartonella, Brucella ou encore Rickettsia. On y trouve également des genres endosymbiotes d'arthropodes et de nématodes (Wolbachia), symbiotes de plantes dans la rhizosphère (Rhizobium),phototrophes (Rhodobacter) ou méthanotrophes (familles des Methylocystaceae et Beijerinckiaceae), etc. D'après la théorie endosymbiotique, les proto-mitochondries (en) dont proviennent les mitochondries actuelles sont vraisemblablement des Alphaproteobacteria proches des Rickettsia.
L'espèce Agrobacterium radiobacter (anciennement A. tumefaciens) est exploitée par le génie génétique comme vecteur de transfection pour introduire de l'ADN étranger dans des cellules végétales. Des adaptations à la présence de biocides et à des températures élevées ont été décrites chez Rubellimicrobium thermophilum dans un environnement industriel (fabrication de papier)[2].
Taxonomie
Ce taxon est décrit en 2006 par G.M. Garrity et al. dans la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology[1]. Il est validé la même année par une publication dans l'IJSEM[3].
En 2013, M.P. Ferla et al. s'appuient sur un séquençage des gènes de l'ARN ribosomique de la grande et de la petite sous-unité pour proposer une subdivision des Alphaproteobacteria en trois sous-classes : Caulobacteridae, Magnetobacteridae et Ricketsiidae (corrig.)[4]
Liste d'ordres
Ordres validement publiés
Selon la LPSN (3 décembre 2022)[5] :
- Caulobacterales Henrici & Johnson 1935 – ordre type
- Emcibacterales Iino et al. 2016
- Holosporales Szokoli et al. 2020
- Hyphomicrobiales Douglas 1957
- Iodidimonadales Iino et al. 2016
- Kordiimonadales Kwon et al. 2005
- Magnetococcales Bazylinski et al. 2013
- Micropepsales Harbison et al. 2017
- Minwuiales Sun et al. 2018
- Rhodobacterales Garrity et al. 2006
- Rhodospirillales Pfennig & Trüper 1971
- Rhodothalassiales Venkata Ramana et al. 2014
- Rickettsiales Gieszczykiewicz 1939
- Sneathiellales Kurahashi et al. 2008
- Sphingomonadales Yabuuchi & Kosako 2006
Ordres en attente de publication valide
Selon la LPSN (3 décembre 2022)[5] les ordres suivants sont en attente de publication valide (Ca. signifie Candidatus) :
- « Parvularculales » Garrity et al. 2003
- « Ca. Pelagibacterales » Grote et al. 2012
Voir aussi
Articles connexes
Notes et références
- Garrity GM, Bell JA & Lilburn T « Class I. Alphaproteobacteria class. nov. » In : Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM (eds) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2ème édition, vol. 2 (The Proteobacteria), partie C (The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria). Springer, New York, 2005. https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-0-387-29298-4_1
- (en) Ewald B. M. Denner, Marko Kolari, Douwe Hoornstra, Irina Tsitko, Peter Kämpfer, Hans-Jürgen Busse et Mirja Salkinoja-Salonen, « Rubellimicrobium thermophilum gen. nov., sp. nov., a red-pigmented, moderately thermophilic bacterium isolated from coloured slime deposits in paper machines », Int. J. Syst. Evol. Microbiol., vol. 56, no Pt 6, , p. 1355--1362 (DOI 10.1099/ijs.0.63751-0, résumé, lire en ligne, consulté le )
- Euzéby JP « Validation list no. 107. List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published » Int J Syst Evol Microbiol. 2006;56(1):1-6. Accès libre.
- Ferla MP et al. « New rRNA gene-based phylogenies of the Alphaproteobacteria provide perspective on major groups, mitochondrial ancestry and phylogenetic instability » PLoS One 2013;8(12):e83383. Accès libre.
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 3 décembre 2022