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Thermothérapie des agrumes

La thermothérapie des agrumes est l'application de hautes ou basses températures en vue d'inactiver des micro-organismes pathogÚnes. C'est, avec le micro-greffage de méristÚme et la culture in vitro de style/stigmate de fleur stérilisée, une technique éprouvée de régénération (plus rarement en français «assainissement») des agrumes[1] - [2] - [3]. Dans les publications académiques, l'anglais citrus sanitation est plus fréquent que citrus regeneration[4].

La thermothérapie se pratique en enceinte climatique sur de jeunes plantes en pot, ou sur les arbres de plein champ, ou in vitro sur les boutures, les bourgeons, les graines ou les pistils de fleurs soumis à un traitement thermique et ou chimique préalable. Les nouvelles techniques de sélection végétale (NPBT) fondées sur une approche génétique ont relancé la recherche sur des protocoles actualisés de régénération des agrumes, notamment éliminant les étapes chronophages de micro-greffe [5] - [6].

Le Citrus tristeza virus.

Nécessité de la régénération des agrumes

« La production de plantes exemptes de virus est nĂ©cessaire pour lutter contre les maladies virales, importer de nouveaux cultivars d'autres pays, Ă©changer du matĂ©riel de sĂ©lection entre pays ou rĂ©gions et prĂ©server le matĂ©riel gĂ©nĂ©tique des plantes » Ă©crivent Min-Rui Wang et Zhen-Hua Cui (2018) dans une synthĂšse sur les mĂ©thodes d'Ă©radication des virus des plantes cultivĂ©es[7]. Les agrumes, la pomme de terre et la vigne sont en premier lieu porteurs de virus de quarantaine, dont le CTV pour les agrumes largement endĂ©mique hors d'Europe, des États-Unis et d'Australie[8].

La technique de régénération des agrumes à partir de la graine est notamment employée en Corée (2013): semis, culture in vitro de l'albumen à 40°C suivie d'une micro greffe)[9]. Elle n'est pas satisfaisante car elle produit des plantes avec des caractÚres indésirables: épineuses, régression au stade juvénile[10]. La régénération par thermothérapie et/ou greffe de méristÚme a été trÚs tÎt privilégiée.

Historique

En 1922, James Johnson mesure les plages de tempĂ©rature d'inactivation du virus mosaĂŻque de la pomme de terre[11]. La publication de G. Nyland et A. C. Goheen, Heat therapy of virus diseases of perennial plants (1969) est une synthĂšse fondatrice, ils Ă©crivent que l’obtention de plantes indemnes (virus non complĂštement labiles) de virus s'obtient par thermothĂ©rapie combinĂ©e avec une culture de mĂ©ristĂšme. Ils donnent une table de tempĂ©ratures pour le traitement par l'air chaud du Candidatus Liberibacter (28 j Ă  40 °C constants), du CTV (29 j Ă  39 °C constants)[12].

En 1957, Desjardins dĂ©couvre que les symptĂŽmes de la tristeza disparaissent d'un limettier aprĂšs passage de 3 semaines en armoire Ă  40 °C constants[13]. Roistacher en 1974 parvient plus rapidement au mĂȘme rĂ©sultat sur le mĂȘme agrume en alternant 28 °C portĂ©s Ă  40 °C le jour et 27 °C la nuit, non seulement CTV mais aussi CPsV (Citrus psorosis virus), le viroĂŻde Concave gum sont Ă©liminĂ©s, suivent de nombreux autres pathogĂšnes inactivĂ©s eux aussi[13]. En 1965, des boutures-greffons de lime, aprĂšs h dans l'eau Ă  45 °C sont greffĂ©s et ne dĂ©veloppent aucun symptĂŽme d'exocortis[14]. La mĂȘme annĂ©e le traitement en plein champs quelques heures pendant une semaine Ă  la vapeur Ă  49 °C fait disparaitre les symptĂŽmes de la maladie du dragon jaune (causĂ©e par la bactĂ©rie Candidatus Liberibacter asiaticus)[15].

Agrume en préconditionnement (31°C, 16 h diurne et 60% d'humidité) dans une enceinte climatique

En 1978, Chiou-Hsiung Huang montre que l'inactivation du CTV nĂ©cessite soit un long sĂ©jour de 15 semaines Ă  40 °C diurne/30 °C nocturne, soit des tempĂ©ratures plus Ă©levĂ©es (39 Ă  45 °C diurne, 29 Ă  33 °C nocturne pendant 10 semaines)[16]. En 2013, l'UnitĂ© de recherche sur les agrumes de Jeju soumet des agrumes infestĂ©s par le CTV et dĂ©foliĂ©es Ă  40 °C constants pendant une semaine. 88,5 % des Setoka sont alors nĂ©gatifs au CTV. La micro greffe des pousses nouvelles en chambre Ă  40 °C constants pendant une semaine suivie de tests PCR et d'une cultures Ă  27 °C diurne/16 °C nocturne est un succĂšs[17].

Protocoles normalisés de thermothérapie

Les protocoles disponibles prĂ©voient une phase de prĂ©conditionnement (6 semaines) pendant laquelle les plantes infectĂ©es sont progressivement habituĂ©es aux tempĂ©ratures Ă©levĂ©es (31 Ă  35°C le jour) avec repos nocturne, elles entrent une vĂ©gĂ©tation robuste. Suit la thermothĂ©rapie proprement dite (4 Ă  12 semaines selon les protocoles) Ă  40 °C pendant 16 h alternĂ©es avec un repos nocturne de h Ă  30 °C. Le prĂ©conditionnĂšrent des porte-greffes non greffĂ©s Ă  l'effet inverse, il sensibilise les plantes [18].

USA

En 2010, dans une publication illustrée le Citrus Germplasm Introduction Program publie son Citrus quarantine, sanitary and certification programs in the USA. La quarantaine américaine a une procédure de régénération (qui n'existe pas à la quarantaine française [19]) ainsi décrite :

« Le bourgeon infectĂ© est greffĂ© sur citrange puis prĂ©conditionnĂ©s Ă  28 Ă  40 °C diurne et 25 °C nocture. AprĂšs prĂ©conditionnement, les plants sont placĂ©s Ă  40 °C le jour ( 16 h) et 30 °C la nuit 8 h pendant 3 mois. A la sortie de l'enceinte climatique le porte-greffe est Ă©laguĂ© et les pousses issues des bourgeons greffĂ©s sont enracinĂ©e par marcottage jusqu'Ă  croissance suffisante. Cette mĂ©thode est efficace contre la plupart des virus des agrumes, sauf les viroĂŻdes (suit la mĂ©thode de la greffe de mĂ©ristĂšme) »

[20].

Nappo

En 2015, l'Organisation nord-américaine pour la protection des plantes (NAPPO) publie un protocole TP 01 Thermotherapy or thermaltherapy qui prévoit :

« Les plantes greffĂ©es sont prĂ©conditionnĂ©es en serre chaude Ă  32 Ă  40 °C diurne et 26 Ă  30 °C nocturne pendant 2 Ă  4 semaines ou en enceinte climatique avec augmentation progressive de la tempĂ©rature (Ă  partir de 30 Ă  32 °C et augmentation de 1 degrĂ© par semaine) pendant 4 Ă  6 semaines. Dans un second temps les plantes sont ensuite placĂ©es dans des enceintes climatiques avec une intensitĂ© lumineuse d'environ 2 000 lux Ă  1 m des lampes, une humiditĂ© relative de 50 Ă  60 % et maintenues Ă  40 °C pendant 16 h diurne et 30 °C pendant 8 h nocturne durant 8 Ă  12 semaines. La plupart des virus des agrumes sont alors Ă©liminĂ©s avec succĂšs.

Certains virus difficiles Ă  Ă©liminer, tels que le virus de la marbrure Dweet mottle virus et le virus des feuilles dĂ©chiquetĂ©es des agrumes (CiTLV - citrus tatter leaf virus) demandent des tempĂ©ratures plus Ă©levĂ©es toujours 16 h de jour et 8 h de nuit avec 8 semaines 40 °C diurne/30 °C nocturne puis 2 semaines Ă  42 °C diurne/30 °C nocturne et enfin 2 semaines Ă  44 °C/30 °C ou la micro-greffe du mĂ©ristĂšme »

[21].

bois porteur de CTV et bois sain

PathogÚnes des agrumes et température

Les virus sont les principaux pathogÚnes de quarantaine chez les agrumes. Deux méthodes de thermothérapie sont utilisées pour la régénération des plantes infestées en concurrence avec la culture d'organes floraux.

Thermothérapie par séjour à plus de 40°C

Les tempĂ©ratures non destructives de la plante-hĂŽte. À mesure qu'on s'Ă©loigne des plages de tempĂ©rature dans lesquelles ils sont fonctionnels, les virus s'inactivent avec disparition des symptĂŽmes, puis subissent des atteintes irrĂ©mĂ©diables de leur matĂ©riel gĂ©nĂ©tique. Le niveau de tempĂ©rature et la durĂ©e d'exposition constituent les variables de la thermothĂ©rapie aĂ©rienne classique qui est souvent complĂ©tĂ©e par une greffe de mĂ©ristĂšme[22]. Les problĂšmes de dĂ©foliation peuvent ĂȘtre limitĂ©s avec des composĂ©s Ă  base d'argent ( AgNO 3, AgNPs) [23].

Point d'inactivation thermique et durée d'exposition

En effet la montée en température a un double effet : réduire et jusqu'à éliminer les symptÎmes, réduire la vitesse de circulation des virus dans la plantes [24]. Une plante asymptomatique peut contenir des virus susceptibles de reprendre leur cycle infectieux si le point d'inactivation thermique (TIP) (la température la plus basse nécessaire pour l'inactivation complÚte d'un virus) n'est pas atteint pendant une durée critique d'exposition à déterminer, ce TIP est variable selon les virus[25] - [24].

Ces observations avaient été faites sur le CTV (Citrus Triteza Virus) en 1974 par C. N. Roistacher et al.:

« les tempĂ©ratures estivales trĂšs chaudes peuvent Ă©liminer le virus de la tristeza des branches de mandarine pendant les mois d'Ă©tĂ©, mais le virus rĂ©apparaĂźt pendant l'hiver et le printemps. Les symptĂŽmes de Tristeza peuvent ĂȘtre masquĂ©s si les tempĂ©ratures sont suffisamment Ă©levĂ©es. Lorsque les tempĂ©ratures sont trop chaudes, des piĂšces climatisĂ©es ou spĂ©cialement refroidies sont souhaitables pour induire le dĂ©veloppement rapide des symptĂŽmes de la tristeza »[26].

Thermothérapie par températures destructives

Les tempĂ©ratures extrĂȘmes appliquĂ©es briĂšvement dĂ©truisent les cellules plante-hĂŽte Ă  l'exception de quelques cellules indiffĂ©renciĂ©es, pauvres en eau[7]. AppliquĂ©es Ă  la pulpe des graines ou du pistil des jeunes fleurs puis suivie d'une mise en culture in vitro des mĂ©ristĂšmes survivants (embryogenĂšse somatique), cette seconde mĂ©thode prĂ©sente de nombreux avantages[27] - [28] - [29].

Culture in vitro du stigmate de la fleur

A cÎté de ces méthodes l'embryogenÚse somatique de style/stigmate de fleur est considérée comme l'une des méthodes les plus efficaces pour éradiquer les principaux virus des agrumes et les maladies apparentées. La régénération des plantes se fait par culture in vitro du style/stigmate de la fleur stérilisée soit par thermothérapie (méthode F. Carimi) soit par immersion dans des désinfectants (Tween 20, éthanol à 70 %, Clorox) avec un taux de réussite de 100% et permet d'obtenir rapidement des plantes saines [30].

Régénération par induction multi-pousses

Cette méthode est décrite par une équipe vietnamienne sur l'orange du Cambodge. Elle conduit à des résultats remarquables[31].

enceinte climatique de culture entiÚrement programmable (durée du jour et de la nuit, CO2, etc.)

Régénération par micro-greffe: méthode complémentaire ou alternative

La micro-greffe est une mĂ©thode de rĂ©gĂ©nĂ©ration qui s'utilise Ă  la suite d'une thermothĂ©rapie qui produit des jeunes pousses exemptes de virus soit seule Ă  partir de jeunes pousses rĂ©putĂ©e naturellement sans virus directement greffĂ©s sur des porte-greffes cultivĂ©s en milieu sain, mĂ©thode utilisĂ©e et dĂ©crite par Hong-Ji Su Ă  TaĂŻwan en 2008 [32]. L'ensemble des opĂ©rations de micro-greffe se rĂ©alise en milieu aseptique [33]. Le CIHEAM Ă©crit (2009) « Toutes les mĂ©thodes d’assainissement disponibles sont efficaces pour l’élimination du CTV, cependant, considĂ©rant leurs nombreux avantages, le greffage d'apex et l'embryogenĂšse somatique, Ă  partir de stigma et stylet en culture in vitro, sont les techniques prĂ©fĂ©rĂ©es » [34]. Et JosĂ© JuĂĄrez, Pablo Aleza et Luis Navarro (2015) donnent une liste de 5 situations (dont les plantes difficiles Ă  enraciner) oĂč cette technique doit ĂȘtre prĂ©fĂ©rĂ©e (En Espagne, environ 140 millions d'agrumes de pĂ©piniĂšres certifiĂ©s et issus de plants microgreffĂ©s ont Ă©tĂ© plantĂ©s)[35].

La micro-greffe est une opération délicate avec des pourcentages de réussite faibles, souvent inférieurs à 35% [36].

La micro greffe d'apex in vivo sur des semis ùgés de deux semaines donne (2021), chez C. maxima triploïde, 74% de plantes exemptes de CTV, l'élimination des 26 % de pousses positive permet aprÚs un an de produire des pieds mÚres débarrassés de virus CTV[37].

Protocole FAO

Dans son Manuel Technique Shoot-tip grafting in vitro (2012) la FAO indique les limites de la thermothérapie sur agrumes: les agrumes sensibles aux températures élevées et l'inefficience pour éliminer les virus yellow vein et dweet mottle virus, la bactérie Spiroplasma citri et les viroïdes. La FAO préconise d'utiliser les 2 méthodes [38].

Bibliographie

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  • Min-Rui Wang, Zhen-Hua Cui, Jing-Wei Li, Xin-Yi Hao, Lei Zhao et Qiao-Chun Wang, In vitro thermotherapy-based methods for plant virus eradication, Plant Methods, vol. 14, no 87, mars 2018 (accĂšs libre) lire en ligne.

Liens externes

Laboratoires de thermothérapie des agrumes

  • UnitĂ© d’Assainissement viral des Agrumes de La Manouba (Tunisie), lire en ligne
  • Institut national de la recherche agronomique - FiliĂšre Agrumes (Maroc), lire en ligne
  • University of California Riverside Citrus Variety Collection est un des principaux spĂ©cialistes de la rĂ©gĂ©nĂ©ration des agrumes, lire en ligne
  • Institute of Biosciences and Bioresources IBBR UOS Palermo (anciennement Centro di Studio per il Miglioramento Genetico degli Agrumi (CMGA) (Italie) est le laboratoire de rĂ©fĂ©rence pour la rĂ©gĂ©nĂ©ration in vitro des agrumes[39].
  • page Valitest - projet de la Commission EuropĂ©enne - visant Ă  uniformiser et valider les tests de dĂ©tection et de diagnostique des phytoravageurs .

Virus, températures, humidité, UV

  • CorrĂ©lation entre basse tempĂ©rature et le faible indice UV et les Ă©pidĂ©mies de grippe en Europe du Nord de 2010 Ă  2018 [40]. Relation non linĂ©aire de la tempĂ©rature et de humiditĂ© avec le virus de la grippe [41].

Notes et références

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