| Légende | PK | Désignation | 
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|  | Origine du chaînage : Paris-Gare de Lyon | 
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|  |  | Ligne de Paris-Lyon à Marseille-Saint-Charles  | vers Paris-GdL | 
|  | 154,370 |  | 
|  | 154,874 | Laroche - Migennes (86 m) | 
|  |  | Ligne de Paris-Lyon à Marseille-Saint-Charles  | vers Marseille-St-Ch. | 
|  |  | Bif. vers le racc. militaire de Laroche - Migennes | 
|  | 155,453 | Pont sur l'Armançon | (111 m) | 
|  | 155,8xx | Limite d'électrification 1,5 kV – CC depuis Laroche (V. 1) | 
|  | 156,711 | Cheny PN no 2 (89 m) | 
|  | 157,9xx | Passage sous la ligne de Laroche à L'Isle - Angely (voie métrique) | vers L'Isle - Angely | 
|  | 159,236 | Bonnard - Bassou (89 m) | 
|  | 159,838 | Pont sur le Serein | (63 m) | 
|  | 162,687 | Chemilly - Appoigny (92 m) | 
|  | 166,463 | ??? (halte) PN no 13 (96 m) | 
|  |  | Ligne de Saint-Florentin - Vergigny à Monéteau - Gurgy | vers St-Florentin - V. | 
|  | 167,632 | Passage sous l'A 6 | 
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|  |  | Monéteau - Gurgy (103 m) | 
|  | 171,446 | Jonches PN no 19 (102 m) | 
|  | 171,482 | PN no 19 sur la N 77 | 
|  | 171,720 | Passage sous la N 6 | 
|  |  | Ligne de Joigny à Auxerre (voie métrique) | vers Joigny | 
|  |  | Auxerre-Saint-Gervais (102 m) | 
|  |  | Ligne d'Auxerre-Saint-Gervais à Gien | vers Gien | 
|  | 178,781 | Augy - Vaux PN no 22 (103 m ; desserte routière) | 
|  | 182,005 | Champs - Saint-Bris (109 m) | 
|  | 182,302 | Passage sous la D 606 | 
|  | 183,743 | Pont sur l'Yonne | (84 m) | 
|  | 186,256 | Vincelles (110 m) | 
|  | 190,979 | Pont sur la D 606 | (5 m) | 
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|  | 191,390 | Cravant - Bazarnes (121 m) | 
|  | 192,091 |  | 
|  | 192,721 | Pont sur l'Yonne | (63 m) | 
|  |  | Ligne de Cravant - Bazarnes à Dracy-Saint-Loup  | vers Dracy-St-Loup | 
|  | 195,729 | Prégilbert PN no 37 (119 m) | 
|  | 196,838 | Pont sur le canal du Nivernais | (16 m) | 
|  | 197,121 | Pont sur l'Yonne | (54 m) | 
|  | 197,453 | Trucy-sur-Yonne PN no 39 (120 m) | 
|  | 200,419 | Mailly-la-Ville (132 m) | 
|  | 200,499 | PN no 41 sur la D 950 | 
|  | 203,129 | Mailly-le-Château (128 m) | 
|  | 203,212 | Pont sur l'Yonne | (55 m) | 
|  | 203,430 | Pont sur le canal du Nivernais | (13 m) | 
|  | 203,789 | Pont sur le canal du Nivernais | (13 m) | 
|  | 203,874 | Pont sur l'Yonne | (55 m) | 
|  | 207,xxx | Merry-sur-Yonne | 
|  | 207,665 | Pont sur l'Yonne | (54 m) | 
|  | 207,718 | Pont sur le canal du Nivernais | (14 m) | 
|  | 210,309 | Châtel-Censoir (133 m) | 
|  | 213,549 | Pont sur le canal du Nivernais | (13 m) | 
|  | 203,874 | Pont sur l'Yonne | (55 m) | 
|  | 215,446 | Lucy-sur-Yonne PN no 48 (140 m) | 
|  | 217,573 | Crain PN no 49 (141 m) | 
|  | 218,196 | Coulanges-sur-Yonne | 
|  | 218,599 | Pont sur l'Yonne | (66 m) | 
|  | 219,036 | PN no 51 sur la N 151 | 
|  | 219,7xx | Limites | 
|  | 220,364 | Pousseaux PN no 52 (143 m) | 
|  | 220,752 | Pont sur l'Yonne | (53 m) | 
|  |  | Ligne de Triguères à Surgy | vers Triguères | 
|  |  | Surgy (144 m) | 
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|  | 225,530 | Pont sur la N 151 | (5 m) | 
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|  | 226,687 | Clamecy (161 m) | 
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|  | 228,042 | Pont sur la D 977 | (13 m) | 
|  | 228,1xx | Pont sur le Beuvron | (18 m) | 
|  | 228,982 | Pont sur le Beuvron | (22 m) | 
|  |  | Ligne de Clamecy à Gilly-sur-Loire  | vers Gilly-sur-L. | 
|  | 228,0xx | Bif. de Beaugy, vers la ligne de Clamecy à Nevers (non-exploitée) | vers Nevers | 
|  | 229,635 | Pont sur le Sauzay | (19 m) | 
|  | 229,904 | PN no 2 sur la D 977 | 
|  | 230,2xx | Passage sous la N 151 | 
|  | 231,566 | Moulot PN no 3 (171 m) | 
|  | 236,360 | Billy-sur-Oisy (203 m) | 
|  | 240,3xx | Limites | 
|  | 244,165 | Étais (255 m) | 
|  | 244,8xx | Limite de sections exploitée / non-exploitée | 
|  | 246,8xx | Limites | 
|  | 252,022 | Entrains (220 m) | 
|  | 252,2xx | Limite de sections non-exploitée / déclassée | 
|  | 252,2xx | PN no 19 sur la D 957 | 
|  | 258,6xx | Ciez - Couloutre (221 m) | 
|  | 262,9xx | Perroy (221 m) | 
|  | 268,0xx | Donzy (188 m) | 
|  | 274,6xx | Suilly (170 m) | 
|  | 277,5xx | Saint-Quentin PN no 51 (166 m) | 
|  | 280,5xx | Saint-Martin - Saint-Laurent (164 m) | 
|  |  | Plateforme coupée par l'A 77 | 
|  |  | Bif. vers le racc. de Cosne | 
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|  |  | Ligne de Moret - Veneux-les-Sablons à Lyon-Perrache  | vers Lyon-Pche | 
|  |  | Ponts (× 4) sur le Nohain | 
|  |  | Ligne de St-Germain-du-Puy à Cosne-Cours-sur-L. | vers St-Germain-du-Puy | 
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|  |  | Cosne-sur-Loire (148 m) | 
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|  |  | Ligne de Moret - Veneux-les-Sablons à Lyon-Perrache  | vers Moret |