Enterobacter
Enterobacter est un genre de bacilles Gram négatifs de la famille des Enterobacteriaceae. Son nom, composé du grec enteron (ἒντερον : intestin) et du néolatin bacter (petit bacille), peut se traduire par « petit bacille intestinal »[1].
Enterobacter
Culture de E. cloacae sur GTS
L'habitat est l'intestin de l'Homme et des animaux, Enterobacter est aussi trouvé dans les selles, les eaux d'égouts, le sol, les produits laitiers. Certaines souches du genre Enterobacter peuvent être responsables d'infections nosocomiales.
Taxonomie
Jusqu'en 2016 ce genre était rattaché par des critères phénotypiques à la famille des Enterobacteriaceae. Malgré la refonte de l'ordre des Enterobacterales par Adeolu et al. en 2016 à l'aide des techniques de phylogénétique moléculaire, Enterobacter reste dans la famille des Enterobacteriaceae dont le périmètre redéfini compte néanmoins beaucoup moins de genres qu'auparavant[2].
Liste d'espèces
Selon la LPSN (31 octobre 2022)[3] :
- Enterobacter asburiae Brenner et al. 1988
- Enterobacter bugandensis Doijad et al. 2016
- Enterobacter cancerogenus (Urosevic 1966) Dickey & Zumoff 1988
- Enterobacter chengduensis Wu et al. 2019
- Enterobacter chuandaensis Wu et al. 2019
- Enterobacter cloacae (Jordan 1890) Hormaeche & Edwards 1960 – espèce type
- Enterobacter dykesii Cho et al. 2021
- Enterobacter hormaechei O'Hara et al. 1990
- Enterobacter huaxiensis Wu et al. 2019
- Enterobacter kobei Kosako et al. 1997
- Enterobacter ludwigii Hoffmann et al. 2005
- Enterobacter mori Zhu et al. 2011
- Enterobacter oligotrophicus corrig. Akita et al. 2020
- Enterobacter quasihormaechei Wang et al. 2020
- Enterobacter quasimori Wu et al. 2021
- Enterobacter quasiroggenkampii Wu et al. 2020
- Enterobacter roggenkampii Sutton et al. 2018
- Enterobacter siamensis Khunthongpan et al. 2014
- Enterobacter sichuanensis Wu et al. 2018
- Enterobacter soli Manter et al. 2011
- Enterobacter vonholyi Cho et al. 2021
- Enterobacter wuhouensis Wang et al. 2020
Des reclassements ont été effectués au sein même du genre Enterobacter :
- Enterobacter asburiae : reclassement de E. muelleri
- Enterobacter cancerogenus : reclassement de E. taylorae
- Enterobacter cloacae subsp. dissolvens : reclassement de E. dissolvens
- Enterobacter mori : reclassement de Enterobacter tabaci
- Enterobacter hormaechei subsp. xiangfangensis : reclassement de E. xiangfangensis
Par ailleurs, un grand nombre d'espèces auparavant classées parmi les Enterobacter ont été reclassées dans d'autres genres :
- Cronobacter sakazakii (Farmer et al. 1980) Iversen et al. 2008 : reclassement de E. sakazakii
- Franconibacter helveticus (Stephan et al. 2007) Stephan et al. 2014 : reclassement de E. helveticus
- Franconibacter pulveris (Stephan et al. 2008) Stephan et al. 2014 : reclassement de E. pulveris
- Klebsiella aerogenes (Hormaeche & Edwards 1960) Tindall et al. 2017 : reclassement de E. aerogenes
- Kluyvera intermedia (Izard et al. 1980) Pavan et al. 2005 : reclassement de E. intermedius
- Kosakonia arachidis (Madhaiyan et al. 2010) Brady et al. 2013 : reclassement de E. arachidis
- Kosakonia cowanii (Inoue et al. 2001) Brady et al. 2013 : reclassement de E. cowanii
- Kosakonia oryzae (Peng et al. 2009) Brady et al. 2013 : reclassement de E. oryzea
- Kosakonia oryzendophytica (Hardoim et al. 2015) Li et al. 2016 : reclassement de E. oryzendophyticus
- Kosakonia oryziphila (Hardoim et al. 2015) Li et al. 2016 : reclassement de E. oryziphilus
- Kosakonia radicincitans (Kämpfer et al. 2005) Brady et al. 2013 : reclassement de E. radicincitans
- Kosakonia sacchari (Zhu et al. 2013) Gu et al. 2014 : reclassement de E. sacchari
- Lelliottia amnigena (Izard et al. 1981) Brady et al. 2013 : reclassement de E. amniogenus
- Lelliottia nimipressuralis (Carter 1945) Brady et al. 2013 : reclassement de E. nimipressuralis
- Pantoea agglomerans (Beijerinck 1888) Gavini et al. 1989 : reclassement de E. agglomerans
- Phytobacter massiliensis (Lagier et al. 2014) Ma et al. 2021 : reclassement de E. massiliensis
- Pluralibacter gergoviae (Brenner et al. 1980) Brady et al. 2013 : reclassement de E. gergoviae
- Pluralibacter pyrinus (Chung et al. 1993) Brady et al. 2013 : reclassement de E. pyrinus
- Siccibacter turicensis (Stephan et al. 2007) Stephan et al. 2014 : reclassement de E. turicensis
Bibliographie
- (en) thèse en ligne (Université de Wageningen University) - 2010 Detection, occurrence, growth and inactivation of Cronobacter spp.
- (en) 2011 Enterobacter sakazakii: an emerging foodborne pathogenic bacterium
Articles connexes
Notes et références
- Hormaeche E & Edwards PR « A proposed genus Enterobacter » Int J Syst Evol Microbiol. 1960;10(2):71-74. Accès libre.
- Adeolu M et al. « Genome-based phylogeny and taxonomy of the ‘Enterobacteriales’: proposal for Enterobacterales ord. nov. divided into the families Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Morganellaceae fam. nov., and Budviciaceae fam. nov. » Int J Syst Evol Microbiol. 2016;66(12):5575-5599. Accès libre.
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 31 octobre 2022
Liens externes
- (en) Référence BioLib : Enterobacter Hormaeche & Edwards, 1960 (consulté le )
- (en) Référence Catalogue of Life : Enterobacter Hormaeche & Edwards, 1960 (consulté le )
- (fr+en) Référence ITIS : Enterobacter Hormaeche & Edwards, 1960 (consulté le )
- (en) Référence NCBI : Enterobacter "Cloaca" Castellani & Chalmers 1919 (taxons inclus) (consulté le )
- (en) Référence uBio : site déclaré ici indisponible le 7 avril 2023
- (en) Référence World Register of Marine Species : taxon Enterobacter Hormaeche & Edwards, 1960 (+ liste espèces) (consulté le )
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