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Enterobacter sichuanensis

Enterobacter sichuanensis est une des espèces du genre de bactéries Enterobacter. Ce sont des bacilles à Gram négatif de la famille des Enterobacteriaceae faisant partie de l'embranchement des Pseudomonadota.

Enterobacter sichuanensis
Description de cette image, également commentée ci-après
Culture de l'espèce E. cloacae sur GTS, espèce du même genre que E. sichuanensis

Espèce

Enterobacter sichuanensis
Wu, Feng et Zong 2018[1]

Historique

Enterobacter sichuanensis est une bactérie décrite en sur la base d'une souche isolée depuis un échantillon d'urine humaine prélevé sur un patient atteint d'insuffisance rénale chronique en Chine à l'hôpital West China de Sichuan en [1].

Taxonomie

Étymologie

L'étymologie de cette espèce E. sichuanensis est la suivante : si.chuan.en’sis N.L. masc./fem. adj. sichuanensis, isolée à Sichuan en Chine[1] - [2].*

Phylogénie

Les analyses phylogéniques basées sur le gène de l'ARNr 16S ont montré que cette espèce E. sichuanensis est probablement incluse dans le genre Enterobacter avec une homologie de séquence de 99% avec différentes espèces de ce genre. Par contre, cette séquence présente aussi une homologie de plus de 99 % avec Leclercia adecarboxilata et plus de 98.65 % avec Citrobacter portucalensis, Citrobacter muliniae, Citrobacter werkmanii et Enterobacter muelleri et de ce fait dans la famille Enterobacteriaceae[3]. Pour mieux positionner cette espèce, le séquençage du génome a été réalisé et l'arbre phylogénique déduit de la comparaison de 207 gènes en commun chez les Enterobacteriaceae a permis de placer la souche WCHECL1597 au sein des Enterobacter[3]. L'identité moyenne des nucléotides (ANI, Average nucleotide identity) calculée pour la souche WCHECL1597 est de 79.81 à 91.49 % avec les autres espèces de ce genre et les valeurs d'isDDH confirme qu'il s'agit d'une espèce distincte[3].

Description

E. sichuanensis est une bactĂ©rie anaĂ©robie facultative Ă  Gram nĂ©gatif ne formant pas de spores. Ces bactĂ©ries sont mobiles et font une taille de 1,6 Âµm de large pour 2,8 Âµm de long. Le test Voges–Proskauer est positif ainsi que le test catalase tandis que le test oxydase est nĂ©gatif[4]. Ses tests sont positifs pour la BĂŞta-galactosidase, l'arginine dihydrolase et l'Ornithine dĂ©carboxylase, et nĂ©gatifs pour la lysine dĂ©carboxylase, la dĂ©aminase, la gĂ©latinase, l'activitĂ© urĂ©ase et la production d'indole. En culture, les bactĂ©ries forment des colonies circulaires, blanches, translucides et lisses après 24h Ă  35 °C. Les croissance peut se produire de 4 Ă  37 °C en prĂ©sence de 0 Ă  9 % (w/v) de NaCl en TSB[4]. La croissance n'est pas possible Ă  45 ou 50 °C . Le pH de croissance se situe en 5.0 et 10 avec un optimum de 6 Ă  7. Les acides gras cellulaires majoritaires de cette bactĂ©rie sont les acides gras C16:0, C17:0 cyclo et C14:0[4].

La souche type de cette espèce a un pourcentage de bases GC de 55,2 %[4].

Souche type

La souche type de l'espèce E. sichuanensis est la souche WCHECL1597 qui porte les identifiants CCTCC AB 2017104 (au China Centre for Type Culture Collection), GDMCC 1.1217 (au Guangdong Microbiology Culture Centre) et KCTC 52994 (au Korean Collection for Type Cultures) qui sont différentes banques de cultures bactériennes[5] - [2].

Multi-résistance

Lors de sa description, cette espèce est décrite comme possédant un profil de résistance à l'Aztréonam, la Céfazoline, la Céfoxitine, la Ceftriaxone, l'Ertapénem et l'Imipénem. La souche type affiche un profil de résistance intermédiaire vis à vis de la Pipéracilline/tazobactam et du Nitrofurantoïne[6].

Cette même souche est susceptible aux antibiotiques Amikacine, Céfépime, Ciprofloxacine, Lévofloxacine, Gentamicine, Tigécycline, Tobramycine et le Triméthoprime/sulfaméthoxazole[3].


Habitat

L'espèce E. sichuanensis est une espèce de bactérie dont la souche type, WCHECL1597 a été isolée d'un échantillon d'urine d'un patient[1].

Notes et références

Bibliographie

  • (en) Wenjing Wu, Li Wei, Yu Feng, Mei Kang et Zhiyong Zong, « Enterobacter huaxiensis sp. nov. and Enterobacter chuandaensis sp. nov., recovered from human blood », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 69,‎ , p. 708-714 (DOI 10.1099/ijsem.0.003207)
  • (en) Wenjing Wu, Yu Feng et Zhiyong Zong, « Enterobacter sichuanensis sp. nov., recovered from human urine », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 68,‎ , p. 3922-3927 (DOI 10.1099/ijsem.0.003089)

Liens externes

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