Tétratricopeptide

La première structure à avoir été déterminée est celle de la protéine phosphatase 5 (en). Sa résolution par cristallographie aux rayons X a permis d'identifier une paire d'hélices α antiparallèles[2]. Cette structure contient une répétition TPR de trois tandems formant une structure en solénoïde α.

Une structure TPR typiques est caractérisée par des interactions entre les hélices A et B du premier motif et l'hélice A’ du motif TPR suivant. Bien que la nature de ces interactions soit variable, les deux premières hélices du motif TPR présentent typiquement un angle d'empilement d'environ 24° au sein d'un motif isolé. Les répétitions de plus de trois motifs TPR produisent des superhélices droites caractérisées par une face convexe et une face concave, cette dernière intervenant généralement dans la liaison avec un ligand[1] - [3].

En ce qui concerne la séquence peptidique de répétitions tétratricopeptide, on observe un mélange de grands et de petits résidus hydrophobes sans qu'aucune position soit totalement invariante. Certains résidus sont cependant généralement conservés, comme le tryptophane 4, la leucine 7, la glycine 8, la tyrosine 11, l'alanine 20, la phénylalanine 24, l'alanine 27 et la proline 32. Parmi ceux-ci, les résidus aux positions 8, 20 et 27 tendent à être davantage conservés. Plutôt qu'être occupées par un résidu spécifique, les autres positions sont occupées par un résidu préférentiellement petit, grand ou aromatique. Les résidus situés entre les hélices jouent un rôle essentiellement structurel tandis que les résidus situés entre motifs TPR adjacents jouent un rôle à la fois structurel et fonctionnel[1].

La protéine adaptatrice Hop (en) assure l'association des protéines chaperonnes Hsp70 et Hsp90. Elle contient trois répétitions TPR ayant chacune sa spécificité de liaison particulière pour des peptides donnés. Le domaine TPR1 reconnaît l'extrémité C-terminale de Hsp70 tandis que le domaine TPR2 se lie au domaine C-terminal de Hsp90. Ces deux séquences C-terminales se terminent par un motif Glu–Glu–Val–Asp (EEVD) et les interactions sont de nature à la fois électrostatique et hydrophobe[1] - [4].

La protéine PEX5 (en) interagit avec signal de cible peroxysomale à travers des motifs PTR : la plupart de ses contacts avec l'extrémité C-terminale du tripeptide signal se font avec la face concave des motifs TPR1, TPR2 et TPR3[5] - [6].

La protéine NCF2 (en) (facteur cytosolique neutrophile 2) est une sous-unité indispensable de la NADPH oxydase dont les motifs TPR assurent l'assemblage avec les autres sous-unités du complexe enzymatique[7].