Facteur de transcription

Il existe une classification complexe des facteurs de transcription.

• Les facteurs généraux de la transcription, impliqués dans la composition de la machinerie transcriptionnelle basale organisée autour de l'ARN polymérase II.
• Les facteurs spécifiques de la transcription, répondant à un signal biologique et modulant l'expression des gènes :
  • les récepteurs nucléaires :
    • les récepteurs des stéroïdes,
    • les récepteurs orphelins ;
  • les facteurs homéotiques :
    • protéines Cdx ;
  • différentes familles de protéines caractérisées par la nature de leur domaine de liaison à l'ADN :
    • STAT,
    • NF-kB,
    • CREB,
    • p53,
    • NFAT,
    • les facteurs bZip, dont le BACH2,
    • les facteurs bHLH,
    • GATA.

Les facteurs de transcription sont des activateurs ou des répresseurs du complexe transcriptionnel constitué autour de l'ARN polymérase qui agissent en se fixant sur les séquences régulatrices en amont des gènes à transcrire. De manière indirecte, par le recrutement de corégulateurs transcriptionnels, ils peuvent agir sur l'état de condensation de la chromatine en acétylant ou désacétylant spécifiquement certains résidus lysines des histones ce qui a un effet activateur ou répresseur, respectivement, de la transcription.

De par leurs actions sur l'expression des gènes, les facteurs de transcription régulent à différents niveaux l'essentiel des processus cellulaires, depuis la biologie interne de la cellule, ses fonctions structurelles, de métabolisme, de réplication, de différenciation, d'interaction cellule-cellule ou cellule matrice, de sécrétion, jusqu'au processus de migration ou de transports.

La revue Cell a publié en 2010 un premier Atlas des facteurs de transcription et de leurs interactions, créé par 41 chercheurs de 17 institutions internationales. Cet atlas regroupe 762 facteurs de transcription humains et 877 facteurs de transcription murins et montre que la moitié des interactions sont conservées entre les deux espèces[1].