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Liste de types d'ARN

Ceci est une liste de différents types d'ARN observés dans la nature. Certaines catégories sont très larges, d'autres se limitent à un seul ARN.

Différents types d'ARN

Dans la cellule ou in vitro, il existe donc plusieurs types ou catégories d'ARN :

  • ARNg : ARN gĂ©nomique (ARN double brin qui constitue le gĂ©nome de certains virus).
  • ARN guide (guide RNA) : petits ARN transcrits de 50 Ă  70 nuclĂ©otides qui jouent un rĂ´le de matrice d’ARN pour l’ADN-tĂ©lomĂ©rase.
  • ARNi : ARN interfĂ©rant (interfĂ©rence par ARN) ; molĂ©cule d’ARN capable de contrĂ´ler l’expression de gènes situĂ©s sur des ARN viraux (en se fixant par complĂ©mentaritĂ© sur leur sĂ©quence nuclĂ©otidique). Ce principe est utilisĂ© en biologie molĂ©culaire pour inhiber l’expression d’un gène de façon spĂ©cifique.
  • ARN messager ou ARNm : il est formĂ© par transcription d'un gène de l'ADN dont il est la copie. Son rĂ´le consiste Ă  transporter l'information gĂ©nĂ©tique recueillie du noyau vers le cytoplasme oĂą elle sera traduite en protĂ©ine par les ribosomes du rĂ©ticulum endoplasmique.
  • ARN prĂ©messager ou prĂ©-ARN messager ou prĂ©-ARNm : ARN prĂ©curseur des ARNm, subit des modifications post-transcriptionnelles aboutissant Ă  l'obtention de l'ARNm.
  • ARNnm : ARN non messagers ; c’est-Ă -dire des ARN qui ne sont pas traduits en protĂ©ines.
  • ARN positif : ARN viral Ă  polaritĂ© positive qui peut ĂŞtre traduit directement par les ribosomes de la cellule infectĂ©e. Dans le cas des ARN viraux Ă  polaritĂ© nĂ©gative, une transcriptase virale les transcrit en ARN Ă  polaritĂ© positive afin qu’ils puissent ĂŞtre traduits en protĂ©ines.
  • ARN de transfert ou ARNt : ils servent Ă  « traduire » les codons de l'ARNm en acides aminĂ©s. Ce sont des molĂ©cules qui se placent sur les sites du ribosome oĂą va ĂŞtre lu l'ARN messager. Un ARNt est un brin court qui a un anticodon sur sa boucle, et un acide aminĂ© attachĂ© Ă  l'autre extrĂ©mitĂ© et qui sera transfĂ©rĂ© Ă  la protĂ©ine en formation.
  • ARNt-aminoacyl : ARN de transfert (ARNt) chargĂ©, c’est-Ă -dire un ARNt portant son acide aminĂ©.
  • ARNtm: essentiels pour la plupart des bactĂ©ries, ces ARN ont une fonction hybride entre celle d'un ARNt et un ARNm. Ils servent Ă  libĂ©rer les ribosomes bloquĂ©s lors de la traduction d'ARNm accidentellement tronquĂ©s, en aiguillant la lecture sur eux-mĂŞmes (fonction ARNm) et en chargeant les ribosomes manquants de codons suivants (fonction ARNt forcĂ©e afin de permettre la translocation traductionnelle). La courte sĂ©quence peptidique codĂ©e par la fonction ARNm est fusionnĂ©e Ă  la protĂ©ine naissante mais incomplète et constitue un signal cible des protĂ©ases intracellulaires (p.ex. ANDENYALAA chez E. coli). Ainsi non seulement les ribosomes sont libĂ©rĂ©s du blocage accidentel et peuvent ĂŞtre rĂ©utilisĂ©s, mais les protĂ©ines et l'ARN incomplets sont aussi dĂ©truits et Ă©galement recyclĂ©s.
  • ARN ribosomique ou ARNr : il reprĂ©sente 80 % de l'ARN total d'une cellule. AssociĂ© Ă  des protĂ©ines, il forme le ribosome qui constitue la tĂŞte de lecture de l'information gĂ©nĂ©tique transcrite par l'ARN messager.
  • ARNt isoaccepteurs : diffĂ©rents ARN de transfert capables de porter le mĂŞme acide aminĂ©.
  • ARN antisens (aRNA) : ARN complĂ©mentaire d'une portion d'un autre ARN et inhibant sa fonction. Les ARN antisens peuvent ĂŞtre des Ă©lĂ©ments naturels de rĂ©gulation (exemple : les ARN MIC). Ils peuvent ĂŞtre Ă©galement obtenus par gĂ©nie gĂ©nĂ©tique.
  • ARN MIC : classe particulière d'ARN antisens, complĂ©mentaire de l'extrĂ©mitĂ© 5' d'un ARNm et inhibant sa fonction. Les ARN MIC sont des Ă©lĂ©ments naturels de rĂ©gulation.
  • ARN monocistronique : ARN ne comportant qu'une seule information gĂ©nĂ©tique. Un cistron est une rĂ©gion du gĂ©nome qui ne porte qu'une seule information gĂ©nĂ©tique transcrite en ARN. Ce terme vient de l'emploi du test" cis-trans" utilisĂ©, en gĂ©nĂ©tique classique, pour mettre les cistrons en Ă©vidence chez les bactĂ©ries. Pour un ARNm, un cistron correspond Ă  un seul polypeptide.
  • ARN polycistronique : ARN messager contenant plusieurs cistrons, et donc codant plusieurs chaĂ®nes polypeptidiques distinctes.
  • ARN nuclĂ©aire de grande taille ou ARN nuclĂ©aire hĂ©tĂ©rogène : ARN nuclĂ©aire rĂ©sultant d'une transcription par la polymĂ©rase II. Ces ARN sont hĂ©tĂ©rogènes en taille et peu stables.
  • ARN recombinant : molĂ©cule d'ARN composĂ©e de fragments d'origines distinctes rĂ©unis in vitro par une ARN ligase.
  • ARN satellite : ARN qui peut accompagner certains virus. L'ARN satellite, encapsidĂ©, est spĂ©cifique de chaque virus, et ne peut se rĂ©pliquer sans lui.
  • petits ARN nuclĂ©aires ou ARNsn : ARN de la machinerie d'Ă©pissage ou splicĂ©osome. Ils sont associĂ©s Ă  des protĂ©ines au sein de particules ribonuclĂ©oprotĂ©iques appelĂ©es snRNP ou parfois "snurps".
  • petits ARN nuclĂ©olaires ou snoARN : ARN guides participant Ă  l'incorporation de modifications chimiques dans d'autres ARN. Les deux principales modifications sont la mĂ©thylation de la position 2' du ribose et la pseudouridylation (transformation de l'uridine en pseudouridine).
  • aptamères : ARN artificiels sĂ©lectionnĂ©s "in vitro" pour une propriĂ©tĂ© particulière de fixation d'un ligand ou de catalyse enzymatique.
  • ARNnc (ARN de non-codage; voir aussi "ARNnm", ci-dessus). La plupart des ARN ne code pas une protĂ©ine (97 % selon Mattick[1]). Certains de ces ARNnc ont des rĂ´les de rĂ©gulateur de processus mĂ©taboliques (voir ci-dessus). Une grande partie peut simplement ĂŞtre sans signification, mais elle pourrait Ă©galement servir d'autres rĂ´les tels que les codages postulĂ©s des Ă©lĂ©ments d'action; (voir après) :

Confusion

Malgré son nom, l'ARN polymérase n'est pas un ARN mais une enzyme catalysant la synthèse d'ARN à partir d'ADN, de la même manière que l'ADN polymérase n'est pas un ADN mais l'enzyme qui catalyse la synthèse d'ADN à partir d'ADN. Il s'agit en effet, consacrées par l'usage, des transpositions en français de l'anglais « RNA polymerase » et « DNA polymerase » où l'on s'est contenté de remplacer chaque sigle anglais par son correspondant français, et de rajouter plus loin un accent, sans changer l'ordre des mots. La traduction proprement dite serait "polymérase à ARN" ou "polymérase à ADN", ce qui conduirait sans confusion au sens indiqué.

Notes et références

  1. Mattick, J.S., (2003). "Challenging the dogma: The hidden layer of non-protein-coding RNAs on complex organisms", BioEssays, 25, 930-939.

Voir aussi

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