Ilarvirus
Ilarvirus est un genre de virus de la famille des Bromoviridae à répartition cosmopolite, qui comprend une vingtaine d'espèces officiellement décrites dont le virus de la bigarrure du tabac (TSV, Tobacco streak virus), qui est l'espèce-type. Ce sont des virus à ARN linéaire, à simple brin et à polarité positive (ssRNA), classés dans le groupe IV de la classification Baltimore. Ce sont des phytovirus qui infectent une vaste gamme de plantes-hôtes, notamment de plantes ligneuses, appartenant à au moins neuf familles de dicotylédones.
| Royaume | Riboviria |
|---|---|
| Règne | Orthornavirae |
| Embranchement | Kitrinoviricota |
| Classe | Alsuviricetes |
| Ordre | Martellivirales |
| Famille | Bromoviridae |
Étymologie
Le nom générique, « Ilarvirus », est la contraction de l'expression « isometric labile ringspot virus », qui fait référence à la forme des particules (isométrique), à leur fragilité (labile) et au principal type de symptômes (taches annulaires)[2]. Le terme Ilarvirus a été employé pour la première fois en 1968 par Robert W. Fulton pour décrire des virus tels que le PNRSV (Prunus necrotic ringspot virus) et le PDV (Prune dwarf virus)[3].
Caractéristiques
Le virion est une particule non-enveloppée de 30 nm de diamètre, quasi-sphérique, à symétrie icosaédrique de type T=3 , dont la capside est composée de 180 protéines, 12 pentamères et 20 hexamères[4]. Dans certains cas, les virions sont des particules bacilliformes de quatre classes de tailles différentes. Ces particules bacilliformes se rencontrent chez les plantes infectées par les virus suivants : Prune dwarf virus (PDV), Tulare apple mosaic virus (TAMV), Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV), Apple mosaic virus (ApMV) et Spinach latent virus (SpLV)[5].
Le génome, segmenté, tripartite, est composé d'ARN linéaire à simple brin, à polarité positive (ssRNA), formé de 3 ARN génomiques (ARN1, ARN2 et ARN3) de, respectivement, 2,9, 2,8 et 2,2 kb, plus un ARN subgénomique (ARN4) de 0,8 kb. Chacun des segments génomique a une structure 3' en pseudo-ARNt et une extrémité 5’[4].
Liste d'espèces
Selon Catalogue of Life (29 février 2020)[6] :
- Ageratum latent virus
- American plum line pattern virus
- Apple mosaic virus
- Asparagus virus 2
- Blackberry chlorotic ringspot virus
- Blueberry shock virus
- Citrus leaf rugose virus
- Citrus variegation virus
- Elm mottle virus
- Fragaria chiloensis latent virus
- Humulus japonicus latent virus
- Lilac leaf chlorosis virus
- Lilac ring mottle virus
- Parietaria mottle virus
- Privet ringspot virus
- Prune dwarf virus
- Prunus necrotic ringspot virus
- Spinach latent virus
- Strawberry necrotic shock virus
- Tobacco streak virus
- Tomato necrotic streak virus
- Tulare apple mosaic virus
Notes et références
- ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 24 janvier 2021
- Suzanne Astier, Josette Albouy, Yves Maury et Hervé Lecoq, Principes de virologie végétale : Génome, pouvoir pathogène, écologie des virus, Editions Quae, coll. « Mieux comprendre », , 444 p. (ISBN 978-2-7380-0937-1, lire en ligne), p. 68-69.
- (en) Christian Tidona et Gholamreza Darai, The Springer Index of Viruses, New York, Springer Science & Business Media, , 2088 p. (ISBN 978-0-387-95919-1, lire en ligne), p. 189.
- (en) « Genus: Ilarvirus - Bromoviridae - Positive-sense RNA Viruses », sur International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (consulté le ).
- Catalogue of Life Checklist, consulté le 29 février 2020
Liens externes
- (en) Référence ICTV : Ilarvirus (consulté le )
- (en) Référence BioLib : Ilarvirus (consulté le )
- (en) Référence NCBI : Ilarvirus (taxons inclus) (consulté le )
- (en) Référence uBio : site déclaré ici indisponible le 7 avril 2023
- (en) Référence World Register of Marine Species : taxon Ilarvirus (+ liste espèces) (consulté le )
- (en) R.W. Fulton, « Ilarvirus group », sur Descriptions of Plant Viruses (DPV) (consulté le ).
- (en) « Plant Viruses Online - Ilarviruses », sur bio-mirror.im.ac.cn (consulté le ).
- (en) « Ilarvirus », sur viralzone.expasy.org (consulté le ).
- (en) « Genus: Ilarvirus - Bromoviridae - Positive-sense RNA Viruses », sur International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (consulté le ).