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Geotrichum candidum

Geotrichum candidum est une espèce du genre Geotrichum.

Ce fungi fait partie du microbiome humain, notamment associé à la peau, aux expectorations et aux matières fécales, où il est présent dans 25-30% des échantillons[1]. Il est courant dans les sols et a été isolé des sols collectés dans le monde entier, sur tous les continents[1].

Geotrichum candidum est l’agent responsable de la géotrichose chez l'homme[2], ainsi que de la pourriture aigre, une maladie chez les plantes qui infecte les agrumes, les tomates, les carottes et d’autres légumes[3]. Il peut affecter les fruits cultivés de Durio tels que Durio graveolens[4].

G. candidum est largement utilisé dans la production de certains produits laitiers, y compris les fromages à croûte tels que le camembert, le saint-nectaire, le reblochon, etc[5]. Le champignon peut également être trouvé dans le viili, où il est responsable de la texture veloutée du produit.

Dans une étude de 2001, on constate que G. candidum consomme le polycarbonate trouvé dans des CD[6].

Description

Les colonies de Geotrichum candidum sont minces, étalées, molles, crémeuses et blanches à l'état anamorphe. Le champignon est caractérisé par des hyphes qui apparaissent rampants, principalement immergés et en septate[1]. La couleur des hyphes semble être hyaline ou légèrement pigmentée. Lorsque les hyphes deviennent aéroportés, leur forme devient arthroconidie, en forme de tonneau ou ellipsoïdale[1]. Les chlamydospores sont sous-globales, solitaires, sur des hyphes indifférenciés[1]. Les blastoconidies se développent parfois sur les hyphes latéralement[1]. Les conidies apparaissent arthrosporeuses, terminales ou intercalaires, aériennes à la surface de la gélose. La taille des conidies varie de 4,8 à 12,5 µm x 2,4 à 2,5 µm.

On pense que G. candidum est homothallique mais la plupart des isolats sont autostĂ©riles[1]. La reproduction sexuĂ©e est observĂ©e pour la première fois dans des souches isolĂ©es de sols Ă  Porto Rico. Le champignon produit des asques globuleux contenant une seule et mĂŞme ascospore ovoĂŻde, globuleuse Ă  ovale, Ă  parois Ă©paisses et non Ă©paissies, mesurant 6 Ă  ÎĽm sur 7 Ă  10 ÎĽm. Les ascospores ont une paroi intĂ©rieure lisse et une paroi extĂ©rieure sillonnĂ©e. Les septa sont perforĂ©s par des microspores, disposĂ©s dans une structure en anneau. Les colonies semblent se dĂ©velopper plus rapidement dans la phase sexuelle que dans la phase asexuĂ©e. Les colonies se dĂ©veloppent Ă  une vitesse de 5 Ă  mm par jour Ă  24 °C.

Croissance

Geotrichum candidum forme une colonie Ă  croissance rapide pouvant atteindre 5 Ă  cm de diamètre en 5 jours sur de la gĂ©lose de Sabouraud, de la gĂ©lose de moĂ»t et des milieux synthĂ©tiques. Au microscope, la croissance est caractĂ©risĂ©e par la production d'hyphes ramifiĂ©s de manière dichotomique qui ressemblent Ă  des diapasons d'accord le long du bord de la colonie. Les chaĂ®nes condiales deviennent aĂ©riennes, Ă©rigĂ©es ou dĂ©combantes et mesurent 6–12(–20) x 3–6(–9) ÎĽm. Le champignon peut pousser sur une variĂ©tĂ© d’agrumes et causer la pourriture aigre. Il a tendance Ă  provoquer la pourriture des fruits stockĂ©s Ă  une tempĂ©rature comprise entre 0 et 5 °C. Les conidies sont incolores et ont un revĂŞtement visqueux. G. candidum est Ă©galement prĂ©sent occasionnellement dans les intestins, les selles, les expectorations et la peau. Le champignon se dĂ©veloppe dans le sol, l'eau, les eaux usĂ©es, divers substrats vĂ©gĂ©taux, la pâte de boulanger, les enveloppes de fermentation, le pain, le lait et les produits laitiers. La tempĂ©rature optimale de croissance est de 25 °C avec un pH de 5,0–5,5[7]. La plage de tempĂ©rature change en fonction de la surface sur laquelle le champignon se dĂ©veloppe. Par exemple, chez les plantes, la tempĂ©rature optimale se situe entre 25 et 27 °C. Chez les animaux, la tempĂ©rature optimale se situe entre 30 et 31 °C. La tempĂ©rature maximale de croissance est de 35 Ă  38 °C. La croissance fongique peut ĂŞtre favorisĂ©e par le D-glucose, le D-mannose, le D-xylose, le L-sorbose, le D-fructose, le D-galactose, le saccharose, le D-mannitol, le sorbitol, l'Ă©thanol et le glycĂ©rol. La sporulation nĂ©cessite souvent un Ă©quilibre de carbone et d'azote[1].

RĂ©partition

Geotrichum candidum est extrêmement commun dans les sols et a été isolé de substrats au Canada, aux États-Unis, en Grande-Bretagne, en Allemagne, en Autriche, en Inde, en Afrique du Sud, au Japon, au Brésil et au Pérou[1]. On le trouve également en tant qu'agent causal dans la pourriture acide des agrumes, une pourriture molle associée à l'émission d'une odeur fruitée. Le champignon est également connu comme agent de dégradation après récolte du melon, des courges et des concombres. Il joue un rôle dans la pourriture des fruits de la tomate quand il est conservé à une température de 0 à 5 °C.

Usage commercial

G. candidum peut être utilisé dans le commerce pour ensemencer des fromages à croûte fleurie[7]. Les cultures peuvent être ajoutées au lait, à la saumure ou pulvérisées sur la surface du fromage. La plage de pH optimale pour la croissance sur le fromage varie de 4,4 à 6,7. Le champignon colonise presque toute la surface du fromage au début de sa maturation. On le trouve sur les fromages à pâte molle comme le camembert et les fromages à pâte mi-dure tels que le saint-nectaire et le reblochon. Pour le camembert, les champignons se développent à l'extérieur du fromage, formant une croûte. Le champignon est responsable de la couche uniforme, blanche et veloutée du saint-marcellin. Les lipases et les protéases de G. candidum libèrent des acides gras et des peptides qui confèrent au fromage des arômes distinctifs. G. candidum réduit l'amertume du camembert grâce à l'activité des aminopeptidases qui hydrolysent des peptides hydrophobes de faible poids moléculaire. Les aminopeptidases contribuent également à l'arôme du camembert normand traditionnel. Le champignon neutralise également le caillé en catabolisant l'acide lactique produit par les bactéries. G. candidum prépare le fromage à la colonisation d'autres bactéries sensibles aux acides, telles que Brevibacterium. Le champignon inhibe la croissance de la bactérie Listeria monocytogenes. Des souches commerciales de G. candidum sont disponibles pour l'affinage du fromage[7].

Références

  1. (en) K.H. Domsch, W. Gams et T.H. Andersen, Compendium of soil fungi, Academic Press, (ISBN 978-0-12-220402-9)
  2. « Géotrichose: symptômes, définition, précisions », sur Thérapeutes Magazine (consulté le )
  3. D . Blancard, « Dipodascus geotrichum (E.E. Butler & L.J. Petersen) Arx syn. Geotrichum candidum Link, (1809) », sur INRA, (consulté le )
  4. (en) A. Sivapalan, Rosidah Metussin, Fuziah Harndan et Rokiah Mohd Zain, « Fungi associated with postharvest fruit rots of Durio graveolens and D. kutejensis in Brunei Darussalam », Australasian Plant Pathology, vol. 27,‎ , p. 274–277 (lire en ligne)
  5. « Geotrichum candidum », sur Laboratoire Interprofessionnel de Production (consulté le )
  6. (en) Xavier Bosch, « Fungus eats CD », Nature,‎ (lire en ligne)
  7. (en) R. Boutrou et M. Guéguen, « Interests in Geotrichum candidum for cheese technology », International Journal of Food Microbiology, vol. 102, no 1,‎ , p. 1-20 (lire en ligne)

Source de la traduction

Liens externes

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