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Archaeoglobus fulgidus

Archaeoglobus fulgidus est une espèce d'archĂ©es hyperthermophiles sulfato-rĂ©ductrices[2] prĂ©sente notamment dans les gisements pĂ©troliers haute tempĂ©rature[3], avec une tempĂ©rature optimale de dĂ©veloppement se situant autour de 83 °C[4]. Le sĂ©quençage complet de son gĂ©nome[4] a rĂ©vĂ©lĂ© la prĂ©sence d'un ensemble presque complet de gènes codant les enzymes de la mĂ©thanogenèse ; la fonction de ces gènes chez cette archĂ©e demeure cependant inconnue, d'autant que l'absence de mĂ©thyl-coenzyme M rĂ©ductase rend impossible l'existence d'une mĂ©thanogenèse semblable Ă  celle connue chez les autres mĂ©thanogènes. En revanche, A. fulgidus possède une voie mĂ©tabolique, appelĂ©e voie de Wood-Ljungdahl, dont la « branche du mĂ©thyle Â» met en Ĺ“uvre des rĂ©actions semblables Ă  certaines Ă©tapes de la mĂ©thanogenèse.

Ce gĂ©nome est constituĂ© d'un chromosome circulaire unique de 2 178 000 paires de bases, Ă  peu près la moitiĂ© de la taille de celui d'E. coli. Un quart de ce gĂ©nome code des protĂ©ines aux fonctions inconnues mais qui sont Ă©galement exprimĂ©es chez d'autres archĂ©es telles que Methanocaldococcus jannaschii. Un autre quart code des protĂ©ines spĂ©cifiques aux archĂ©es. Ce gĂ©nome contient de nombreuses duplications de gènes, mais les protĂ©ines dupliquĂ©es ne sont pas identiques. Ces duplications de gènes conduisent Ă  un gĂ©nome plus grand que celui de M. jannaschii. Un fait notable est qu'A. fulgidus ne contient aucune intĂ©ine lĂ  oĂą M. jannaschii en a 18.

Notes et références

  1. (en) Référence NCBI : Archaeoglobus fulgidus (taxons inclus)
  2. (en) C.R. Woese, L. Achenbach, P. Rouviere et L. Mandelco, « Archaeal Phylogeny: Reexamination of the Phylogenetic Position of Archaeoglobus fulgidus in Light of Certain Composition-induced Artifacts », Systematic and Applied Microbiology, vol. 14, no 4,‎ , p. 364–371 (lire en ligne) DOI 10.1016/S0723-2020(11)80311-5 PMID 11540072
  3. (en) Janiche Beeder, Roald Kåre Nilsen, Jan Thomas Rosnes, Terje Torsvik et Torleiv Lien, « Archaeoglobus fulgidus Isolated from Hot North Sea Oil Field Waters », Applied and Environmental Microbiology, vol. 60, no 4,‎ , p. 1227-1231 (lire en ligne) PMID 16349231
  4. (en) Hans-Peter Klenk, Rebecca A. Clayton, Jean-Francois Tomb, Owen White, Karen E. Nelson, Karen A. Ketchum, Robert J. Dodson, Michelle Gwinn, Erin K. Hickey, Jeremy D. Peterson, Delwood L. Richardson, Anthony R. Kerlavage, David E. Graham, Nikos C. Kyrpides, Robert D. Fleischmann, John Quackenbush, Norman H. Lee, Granger G. Sutton, Steven Gill, Ewen F. Kirkness, Brian A. Dougherty, Keith McKenney, Mark D. Adams, Brendan Loftus, Scott Peterson, Claudia I. Reich, Leslie K. McNeil, Jonathan H. Badger, Anna Glodek, Lixin Zhou, Ross Overbeek, Jeannine D. Gocayne, Janice F. Weidman, Lisa McDonald, Teresa Utterback, Matthew D. Cotton, Tracy Spriggs, Patricia Artiach, Brian P. Kaine, Sean M. Sykes, Paul W. Sadow, Kurt P. D'Andrea, Cheryl Bowman, Claire Fujii, Stacey A. Garland, Tanya M. Mason, Gary J. Olsen, Claire M. Fraser, Hamilton O. Smith, Carl R. Woese et J. Craig Venter, « The complete genome sequence of the hyperthermophilic, sulphate-reducing archaeon Archaeoglobus fulgidus », Nature, vol. 390,‎ , p. 364-370 (lire en ligne) DOI 10.1038/37052 PMID 9389475
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