Venenivibrio stagnispumantis
Venenivibrio stagnispumantis souche CP.B2 est le premier micro-organisme isolé de la source chaude terrestre Champagne Pool (75 °C, pH 5,5) à Waiotapu en Nouvelle-Zélande[1] - [2].
RĂšgne | Bacteria |
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Embranchement | Aquificae |
Classe | Aquificae |
Ordre | Aquificales |
Famille | Hydrogenothermaceae |
Hetzer et al. 2008
Morphologie
Les cellules sont des bùtonnets mobiles et légÚrement incurvés (1,04 à 1,56 ”m de long et 0,33 à 0,41 ”m de large)[2].
Conditions de croissance
La bactĂ©rie est chimiolithotrophe obligatoire capable d'utiliser H2 comme donneur d'Ă©lectrons, O2 comme accepteur d'Ă©lectrons correspondant et CO2 comme source de carbone. Venenivibrio stagnispumantis gagne de l'Ă©nergie mĂ©tabolique en utilisant la « rĂ©action Knallgas » : H2 + Âœ O2 â H2O. Pour la croissance, du soufre Ă©lĂ©mentaire (S0) ou du thiosulfate (S2O32â) est nĂ©cessaire. La croissance est observĂ©e dans des conditions thermophiles entre 45 °C et 75 °C (optimum 70 °C), dans des conditions acidophiles modĂ©rĂ©es entre pH 4,8 et 5,8 (pH optimal 5,4) et dans des conditions microaĂ©rophiles entre 1,0 % et 10,0 % (v/v) d'O2 (optimum entre 4,0 % et 8,0 % (v/v) d'O2)[2].
Phylogénie
L'analyse phylogénétique basée sur les séquences d'ADNr 16S indique que la souche CP.B2 appartient à l'ordre des Aquificales et représente la souche type d'une nouvelle espÚce d'un nouveau genre au sein de la famille des Hydrogenothermaceae. La séquence du gÚne de l'ARNr 16S pour la souche CP.B2 est déposé dans la base de données de séquences nucléotidiques GenBank sous le numéro d'accession DQ989208. La teneur en G+C de l'ADN génomique est de 29,3 mol % qui est la plus faible teneur en G+C rapportée pour une espÚce de l'ordre Aquificales[2].
Tolérance aux composés d'arsenic et d'antimoine
Venenivibrio stagnispumantis affiche une tolérance à des concentrations relativement élevées de composés d'arsenic et d'antimoine. Les cellules se sont développées en présence de jusqu'à 8 mM d'arsénite (As3+), 15 mM d'antimoine trivalent (Sb3+) et plus de 20 mM d'arséniate (As5+), mais aucune croissance n'a été observée lorsque As3+ et As5+ ont été fournis comme seule paire de donneur et d'accepteur d'électrons[2].
Ătymologie
Veneni vibrio. (latin : le vibrion du poison), stagni spumantis (latin : de la piscine bouillonnante, se rapportant Ă Champagne Pool)[2].
Collection culturelle
Venenivibrio stagnispumantis souche CP.B2 est déposé dans la Japan Collection of Microorganisms sous JCM 14244, dans l'American Type Culture Collection sous ATCC BAA-1398 et dans la German Collection of Microorganisms sous DSM 18763[2].
Milieu de culture
Milieu de culture Venenivibrio stagnispumantis | |
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NaOH | 0,15 g |
KCl | 0,50 g |
MgCl2 âą 6 H2O | 1,36 g |
MgSO4 âą 7 H2O | 7,00 g |
Na2S2O3 âą 5 H2O | 2,00 g |
CaCl2 âą 2 H2O | 0,40 g |
NH4Cl | 0,20 g |
K2HPO4 | 0,25 g |
Oligo-éléments (100 x) | 10.00 ml |
SEM | 1,95 g |
Eau distillée | jusqu'à 1 000 ml |
Le pH du milieu est ajusté à 5,5, réparti dans des cuves de culture et autoclavé sous CO2. AprÚs l'inoculation, la phase gazeuse initiale est remplacée par H2 / CO2 / O2 (79 % / 15 % / 6 %) et pressurisée à 170 kPa[2].
Solution d'oligo-éléments (100 x) | |
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Na2-EDTA âą 2 H2O | 500,00 mg |
CoCl2 âą 6 H2O | 150,00 mg |
MnCl2 âą 4 H2O | 100,00 mg |
FeSO4 âą 7 H2O | 100,00 mg |
ZnCl2 | 100,00 mg |
AlCl3 âą 6 H2O | 40,00 mg |
Na2WO4 âą 2 H2O | 30,00 mg |
CuCl2 âą 2 H2O | 20,00 mg |
Ni2SO4 âą 6 H2O | 20,00 mg |
Na2SeO3 | 10,00 mg |
H3BO3 | 10,00 mg |
Na2MoO4 âą 2 H2O | 10,00 mg |
Eau distillée | jusqu'à 1 000 ml |
Le pH de la solution est ajusté à 3,0 avec HCl[2].
Références
- (en) Adrian Hetzer, Hugh W. Morgan, Ian R. McDonald et Christopher J. Daughney, « Microbial life in Champagne Pool, a geothermal spring in Waiotapu, New Zealand », Extremophiles, vol. 11, no 4,â , p. 605â14 (PMID 17426919, DOI 10.1007/s00792-007-0073-2).
- (en) A. Hetzer, I. R. McDonald et H. W. Morgan, « Venenivibrio stagnispumantis gen. nov., sp. nov., a thermophilic hydrogen-oxidizing bacterium isolated from Champagne Pool, Waiotapu, New Zealand », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 58, no 2,â , p. 398â403 (PMID 18218938, DOI 10.1099/ijs.0.64842-0).
Liens externes
- (en) Adam Podstawka, « Venenivibrio stagnispumantis CP B.2, CP.B2 | Type strain | DSM 18763, JCM 14244 | BacDiveID:132082 », sur bacdive.dsmz.de (consulté le )