Variant Lambda du SARS-CoV-2
Le variant lambda, également connu sous le nom de C.37, est un variant du SARS-CoV-2, virus qui cause la Covid-19[1]. Il a été détecté pour la première fois au Pérou en .
L'Organisation mondiale de la santé (OMS) l'a classé variant d'intérêt le .
Historique
Les premiers échantillons du variant Lambda ont été détectés au Pérou en et en , plus de 90 % des nouveaux cas de COVID-19 au Pérou provenaient du nouveau variant[1] - [2].
En , le variant Lambda a commencé à se répandre en Amérique du Sud et a été détecté dans vingt-neuf pays au total, notamment en Argentine, au Chili et en Équateur[2] - [3]. L'OMS a désigné le variant Lambda comme un « variant d'intérêt » le [1]. À la mi-, 90,6 % des nouveaux cas de COVID-19 à Arequipa et 78,1 % des nouveaux cas à Cusco étaient le variant Lambda selon le ministère péruvien de la Santé[4].
Mutations
Le génome du variant Lambda présente les mutations d'acides aminés suivantes, toutes présentes dans le code de la protéine de pointe du virus : G75V, T761, Δ246-252, L452Q, F490S, D614G et T859N[5]. Il s'agit de mutations faux-sens, c'est-à -dire non silencieuses, induisant un changement fonctionnel.
Mutations d'acides aminés de la variante SARS-CoV-2 Lambda tracées sur une carte du génome du SARS-CoV-2 en mettant l'accent sur le pic.
Statistiques
Il est à noter qu'étant donné que la majorité des pays n'ont des capacités de détection et de séquençage du variant insuffisantes, y compris dans les pays développés, les statistiques sont très probablement sous-estimées.
| Cas par pays (mis Ă jour au ) GISAID [6] | ||
|---|---|---|
| Pays | Cas confirmés | Dernier cas signalé |
| Chili | 840 | |
| États-Unis | 608 | |
| PĂ©rou | 239 | |
| Allemagne | 99 | |
| Mexique | 89 | |
| Argentine | 87 | |
| Équateur | 50 | |
| Espagne | 50 | |
| Israël | 25 | |
| Colombie | 19 | |
| France | 13 | |
| Italie | 10 | |
| Saint-Christophe-et-Niévès | 10 | |
| Suisse | 9 | |
| Égypte | 8 | |
| Royaume-Uni | 7 | |
| Brésil | 4 | |
| Canada | 3 | |
| Pologne | 3 | |
| Aruba | 2 | |
| Australie | 1 | |
| Curaçao | 1 | |
| République tchèque | 1 | |
| Danemark | 1 | |
| Pays-Bas | 1 | |
| Portugal | 1 | |
| Turquie | 1 | |
| Uruguay | 1 | |
| Zimbabwe | 1 | |
| Monde (29 pays) | Total : 2 184 | Total au |
Notes et références
- (en) « Tracking SARS-CoV-2 variants », World Health Organization (consulté le )
- (en) « WHO reports on Lambda: the new variant of COVID-19 that is affecting South America », Entrepreneur, (consulté le )
- (en) Mendez, « WHO says delta Covid variant has now spread to 80 countries and it keeps mutating », CNBC, (consulté le )
- (es) Sebastián Acosta, « Coronavirus en Perú | Minsa: El 90,6 % de los contagios en Arequipa se deben a la variante Lambda », RPP,‎ (lire en ligne, consulté le )
- Sally Robertson, « Le variant Lambda du SARS-CoV-2 a un potentiel de devenir un variant préoccupant VOC (variant of concern) », news-medical.net,‎ (lire en ligne, consulté le ) :
« Le variant Lambda contient aussi une nouvelle délétion (Δ246-252) et de mutltiple mutations faux-sens (non synonymes) (G75V, T76I, L452Q, F490S, D614G et T859N) sur le gène codant la protéine Spike (spicule) »
- « GISAID - hCov19 Variants » (consulté le ).