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Peroxydase

Une peroxydase, souvent écrit abusivement peroxidase comme en anglais[1], est une enzyme de type oxydase qui typiquement catalyse une réaction de la forme :

AH2 + H2O2A + 2 H2O
ROOR' + donneur d'électron (2 e) + 2H+ → ROH + R'OH.

Les peroxydases sont les enzymes parmi les plus universelles du monde vivant. Dans l'organisme, les peroxydases décomposent notamment les composés peroxydes, toxiques.

En chimie et biochimie, les peroxydases sont très utilisées comme objet d'étude et réactifs pour des synthèses. La peroxydase de raifort (HRP) est notamment largement utilisée en biotechnologie comme réactif de détection dans les immuno-essais.

Historique

Avant même que la notion d'enzyme eût été formulée, Louis-Antoine Planche constatait en 1810 que des extraits de racine de diverses plantes avaient la propriété d'oxyder et donc de recolorer la teinture de gaïac (incolore à l'état réduit) en présence de peroxyde d'hydrogène (ou eau oxygénée, formule H2O2), ce qui valut le nom aux enzymes responsables, les peroxydases. Aujourd'hui, la source la plus commune de peroxydase à usage biotechnologique est la racine de raifort (ou parfois celle de radis noir). C'est pourquoi les chercheurs la connaissent plutôt sous l'acronyme anglais HRP (HorseRadish Peroxydase)[2].

Activité chimique

Les peroxydases contiennent parfois un hème, une cystéine ou sélénocystéine qui font une réaction d'oxydo-réduction. Elles utilisent notamment le peroxyde d'hydrogène comme substrat, mais d'autres composés, tels les lipides hydroperoxydes. Les donneurs d'électrons acceptés sont plus ou moins variés selon les peroxydases (lié au site actif). Le cytochrome c peroxydase (EC 1.11.1.5) utilise très spécifiquement le cytochrome c.

Typologie

On distingue[3] :

  • les peroxydases à hème :
    • famille des cyclooxygenases : exemples des ubiquistes prostaglandines H synthases (cyclooxygénase, ou PGHS / CyOx), lactoperoxydases ('LPO'), myéloperoxydases ('MPO'), et d'autres moins ubiquistes : alpha-dioxygénase ('DiOx'), perodains ('Pxd'), etc.,
    • peroxydase à 2 hèmes : exemples des cytochromes C peroxydases ('DiHCcP'),
    • famille des catalases : la catalase (no EC 1.11.1.6, 'Kat'),
    • famille des peroxydases DyP-type A/B/C/D : très répandues chez les bactéries, champignons,
    • peroxydases de classe I : exemples de l'ascorbate peroxydase ('APx') et des cytochromes C peroxydases,
    • peroxydases de classe II : exemple de la lignine peroxydase ;
  • les peroxydases sans hème :
    • famille des alkylhydroperoxydases D ('AgpD') et assimilées,
    • haloperoxydases : exemple la manganèse catalase ('MnCat'),
    • glutathione peroxydase : enzyme-clé du métabolisme oxydatif chez tous les animaux et plantes,
    • peroxyrédoxines : exemple des peroxyrédoxines (1CysPrx, 2CysPrx / AhpC, PrxII / PrxV, PrxQ / BCP),
    • NAD(P)H oxydases : exemple des NADPH oxydases ('NadOxd') et déshydrogénase ('BadDH').

Activité biologique

Ce type d'enzyme unique dans les cellules vivantes a notamment pour fonction de décomposer les peroxydes toxiques produits par les stress oxydatifs (peroxydes dérivés de l'oxygène, hydroperoxydes, peroxy-nitriques). Les peroxydases assurent aussi d'autres fonctions.

Voir aussi

Détoxication du peroxyde d'hydrogène avec comme cofacteur possible et par ordre de préférence :

Notes et références

  1. Par exemple EC 1.11.1.9.
  2. Source : didier-pol.net
  3. http://peroxibase.toulouse.inra.fr/classes.php PeroxidataBase de l'INRA de Toulouse
  4. (en) Liliana Dimitrijevic, Claude Aussel, Alain Mucchielli et René Masseyeff, « Purification and characterization of an estrogen-binding peroxidase from human fetuses », Biochimie, Elsevier, vol. 61, no 4, , p. 535-541 (ISSN 0300-9084, PMID 114237, résumé)
  5. http://bioweb.usc.edu/courses/2001-fall/documents/bisc111-peroxidase_isoenzymes.pdf
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