Lyssavirus

Les espèces du genre Lyssavirus sont des virus enveloppés, leur génome mesure 12 kilobases. Il est constitué d'une molécule d'ARN monocaténaire (à un seul brin), de polarité négative, non segmenté, et de forme hélicoïdale. Celle-ci est contenue dans une enveloppe ayant la forme d'un obus ou d'une balle de révolver, de 100 à 300 nanomètres de long et de 75 nanomètres de diamètre[2].

Leur génome compte cinq gènes codant cinq protéines de structure. Trois forment la nucléocapside à symétrie hélicoïdale : la nucléoprotéine N, la phosphoprotéine P et une ARN-dépendante polymérase (L). Deux forment l'enveloppe : la protéine de matrice M, et la glycoprotéine G, en association avec des lipides de la cellule-hôte.

La protéine M est localisée sur la face interne, elle forme des oligomères qui donnent une rigidité à la structure virale.

La glycoprotéine G est insérée en surface, dans la membrane lipidique, formant des spicules de 5 à 10 nanomètres de long et de 3 nanomètres de diamètre. Ces spicules portent des domaines glycosylés qui permettent l'attachement du virion aux récepteurs de la cellule-hôte[2].

La protéine G induit la production d'anticorps neutralisants qui sont la principale défense immune contre une infection à lyssavirus.

Le complexe de ribonucléoprotéines N, P, L induisent une immunité cellulaire augmentant la production d'anticorps, ainsi qu'une mémoire immunologique à long terme (immunité de plus longue durée).

L'existence de l'enveloppe explique la fragilité du virus dans le milieu extérieur. Le virus est inactivé par le soleil, les solvants, les savons et les ammoniums quaternaires.

Jusqu'aux années 1950, le virus de la rage (RABV pour RABies Virus, rage des mammifères terrestres) a été considéré comme le seul représentant de son genre Lyssavirus. La découverte de nouveaux sérotypes de Lyssavirus chez les chauves-souris a conduit à une diversification du genre[3].

En 2017, le genre Lyssavirus compte au moins 14 espèces ou génotypes basées sur l'analyse des séquences du génome viral (nucléoprotéine N). Ces génotypes forment trois phylogroupes, définis selon la distance génétique et les réactions croisées sérologiques. D'autres critères peuvent s'y ajouter, s'ils sont disponibles, comme les caractères écologiques, géographiques, pathogéniques et selon l'hôte[3].

Le nombre des cas humains de la liste ci-dessous sont à la date de 2017.

Une infection à lyssavirus provoque, chez l'hôte sensible, une encéphalite progressive aiguë chez la plupart des mammifères. L'exposition se fait à partir de la salive d'un animal enragé, généralement par morsure avec effraction cutanée, ou par contact avec une muqueuse (bouche, œil).

Le virus très neurotrope se multiplie localement dans le tissu musculaire pour pénétrer les nerfs périphériques et par là remonter à la moelle épinière et au cerveau. Le virus rabique ne passe pas par le sang (absence de virémie)[7].

Le virus se fixe par sa glycoprotéine G qui peut s'attacher à trois types de récepteurs situés à la surface des cellules neuronales. Principalement le récepteur nicotinique de l'acétylcholine, et aussi au récepteur du NGF (Nerve Growth Factor, facteur de croissance des nerfs) et au récepteur NCAM (Neural Cell Adhesion Molecule, CD 56)[8].

Une fois fixé, le virus est internalisé dans la cellule par des vésicules endosomiques. La fusion des membranes virales et cellulaires libère les nucléocapsides dans le cytoplasme. La transcription du génome viral se fait à l'aide de la polymérase L et de la phosphoprotéine P.

Les molécules d'ARN néosynthétisées sont encapsidées et la maturation des nouveaux virus commence. Toutes ces étapes s'effectuent dans le cytoplasme. L'accumulation des nouveaux virus dans le cytoplasme forme des amas visibles en microscopie optique : les corps de Négri. Les particules virales sont ensuite libérées à la membrane cytoplasmique.

Toujours par voie nerveuse, les virus se disséminent dans l'organisme passant dans la salive, les larmes, les muqueuses nasales et digestives, les follicules pileux et les urines[8].

Le rôle exact des différentes protéines des lyssavirus dans les mécanismes de la maladie est mal connu[9]. Les différentes manifestations de la rage restent encore inexpliquées. Par exemple, l'existence d'une forme furieuse et d'une forme paralytique de la rage n'a pas été corrélée avec une localisation cérébrale spécifique des virus rabiques [10], malgré l'hypothèse d'une atteinte spécifique de l'hippocampe pour expliquer l'agressivité[8].

• (en) Référence ICTV : Lyssavirus (consulté le 25 janvier 2021)

• (en) Stanley Plotkin, Vaccines, Philadelphie, Saunders Elsevier, 2008, 1725 p. (ISBN 978-1-4160-3611-1, lire en ligne), chap. 27 (« Rabies vaccines »), p. 687-714.
• (en) « Rabies WHO Immunological Basis », sur apps.who.int, 2017 (consulté le 14 novembre 2018).
• (en) WHO, WHO Expert Consultation on Rabies : Third Report, WHO Press, 2018, 183 p. (ISBN 978-92-4-121021-8, lire en ligne). .