IPBS-Toulouse

En 1972, Claude Paoletti et Jean Cros créent le Laboratoire de Pharmacologie et de Toxicologie Fondamentales (LPTF)[6], qui deviendra en 1990 le septième pôle français du programme national IMABIO (Ingénierie des macromolécules). De nouvelles thématiques de recherche telles que la cancérologie, la neurologie et la génotoxicologie émergent[7]. Entre 1990 et 1995, de nouvelles équipes arrivent pour développer les thématiques de la tuberculose, de l’ingénierie des protéines, et de la biologie structurale.

En 2020, l'IPBS change de logo et fait évoluer son image pour mettre en avant les maladies sur lesquelles les chercheurs travaillent : cancer, infection et inflammation.

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  Nouveau logo 2020 - forme horizontale
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  Nouveau logo 2020 - forme carrée
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  Ancien logo de l'IPBS jusqu'en 2016
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  Actuel logo de l'IPBS depuis 2016
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  Logo du vingtième anniversaire de l'IPBS

L'IPBS compte seize équipes de recherche.

Les nouveaux objectifs scientifiques s'appuient sur deux axes de recherche complémentaires liés au cancer, à l'inflammation et aux maladies infectieuses :

• Biologie du microenvironnement tissulaire et cellulaire - Ce premier axe de recherche visera à l'étude, aux niveaux tissulaire et cellulaire, du microenvironnement dans la maladie et de son influence sur le traitement. Il recouvrera les thématiques suivantes :
  • Le microenvironnement dans le cancer, les maladies inflammatoires et infectieuses : rôle dans la protection/sensibilité à la maladie et impact sur le traitement
  • Les cellules immunitaires/inflammatoires dans le cancer, les maladies inflammatoires et infectieuses
  • Le métabolisme des cellules eucaryotes et bactériennes dans le cancer et les infections
• Mécanismes structurels et moléculaires de la maladie : Ce second axe de recherche sera lié, au niveau moléculaire, à l'étude des mécanismes structurels et moléculaires de la maladie, afin de caractériser les cibles et de proposer des candidats pour de nouvelles thérapies. Il recouvrera les thématiques suivantes :
  • Relations structure-fonction-activité des protéines et des complexes protéiques dans les cellules eucaryotes et les bactéries, et conception rationnelle de ligands fonctionnels pour le traitement du cancer et des infections dans les cellules immunitaires/inflammatoires dans les cas de cancer, de maladies inflammatoires et infectieuses.
  • Stabilité du génome
  • Lipides eucaryotes et bactériens, membranes et enveloppes
  • Tolérance et résistance aux médicaments dans les cas de cancer et d'infection

Des approches d'ingénierie tissulaire telles qu'organes sur puce, organoïdes et impression de tissus en 3D, qui combinent des cellules avec des matériaux d'ingénierie, sont utilisées pour étudier les fonctions des organes et améliorer les stratégies d'administration de médicaments.

L'utilisation et le développement de technologies corrélatives d'imagerie et d'ingénierie tissulaire, soutenues par l'expertise actuelle en microscopie optique, spectrométrie de masse et imagerie moléculaire permettent de mieux comprendre le microenvironnement tissulaire et cellulaire dans les tumeurs et les tissus infectés.

L'institut dispose d’un large éventail d'installations technologiques et d'équipements de pointe à l’intention de la communauté scientifique toulousaine, nationale et internationale. Quatre plateformes technologiques, labellisées au niveau national "Infrastructures en Biologie Santé et Agronomie (IBiSA)"[9] (coordination nationale des plateformes de sciences de la vie) sont accueillies sur le campus de l'institut. Elles adhèrent à la charte du GIS GENOTOUL[10] qui coordonne les plateformes toulousaines en sciences du vivant.

Ces équipements technologiques sont ouverts aux groupes de recherches des secteurs académique et privé et impliqués dans le développement et l'innovation technologique.

Ces plateformes ont toutes obtenues la certification NF X 50-900, norme spécifique aux plateformes technologiques qui englobe une certification ISO9001:2015 (Lloyd's Register Quality Assurance, LRQA)[11].

Le Comité Consultatif Scientifique conseille le directeur et le comité de direction, à la fois sur la politique scientifique de l'institut mais aussi sur les aspects stratégiques liés à la vie des équipes de recherche (création, modification des orientations de recherche, transition, etc.). Par ailleurs, il évalue les projets scientifiques menés par chaque équipe de recherche de l'institut.

Il est composé de neuf chercheurs internationalement reconnus (par ordre alphabétique) :

• Frederick Alt de Harvard Medical School,
• Mina Bissell du Laboratoire national Lawrence-Berkeley,
• Mélanie Blokesch de l'EPFL (École polytechnique fédérale de Lausanne),
• Patrick Couvreur de l’Institut Galien Paris Sud[17],
• Sabine Ehrt de Weill Medical College,

• Kathryn Lilley de l’Université de Cambridge,
• Dino Moras de l’Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire,
• Eric Solary de l’Institut Gustave-Roussy,
• David Russell de l’Université Cornell.

Depuis 1999, l’IPBS a été très actif dans le partenariat avec l’industrie. Le premier centre de criblage à haut débit public-privé entre le CNRS et Pierre Fabre SA a été présent à l'IPBS de 1999 à 2003. Neuf petites entreprises de biotechnologie (start-ups) ont été créées ou incubées à l'IPBS au cours des dix dernières années.

Cinquante demandes et extensions de brevets ont été déposées et près de 95 accords par an sont conclus. L'IPBS travaille en étroite collaboration avec le CNRS et la Société d'Accélération du Transfert de Technologies (SATT). Depuis 2020, l'IPBS accueille la société de biotech G.CLIPS , qui propose des solutions pour la recherche d'agents thérapeutiques ciblant les protéines membranaires.

En reconnaissance de toutes ces activités, l’IPBS s’est vu recevoir le prix "Trophées de l’Innovation INPI 2008"[18]. Chaque année, l'IPBS et ses partenaires industriels accompagnent la formation de plusieurs doctorants dans le cadre de bourses CIFRE.

Les partenaires industriels comprennent : Abtech, Artichem, Adisseo France, Aureus Pharma, BetaTech, BT Pharma, Biovector Therapeutics, Bruker, Cayla, Centre d’Immunologie Pierre Fabre, CERPEM, CRIIT Castres, Diverchim, EDF, Endocube, GlaxoSmithKline, Genclis, GTP Technology, Immuno Designed Molecules, Institut Européen de Biologie Cellulaire, Institut de Recherche Pierre Fabre, L-Path (États-Unis), Millegen, Mitsui-Norin, Nanobiotix, Novaleads, Oncodesign, Palumed, Pierre Fabre Dermo Cosmétique, Praxcell, Protein Biosensor, Sanofi-Aventis, SFRI, Techniques et Fabrication Électroniques, Total, Véolia…

Outils légaux et bonnes pratiques : Contrats de services techniques et de consultation, de collaboration en recherche, de consortium et de confidentialité, de consultation, de transfert de matériel, de données de livres de laboratoire, de contrôle de la qualité...

Aide à la création de start-ups : Depuis 1999, l'IPBS a développé des collaborations scientifiques et/ou accueilli les activités de neuf entreprises : Abtech (radiée le 9/01/2008)[19], Endocube (radiée le 3/12/2008)[20], Millegen (clôturée)[21], Novaleads (radiée le 9/10/2014)[19], Nanobiotix, Protein Bio Sensor (immatriculée le 7/06/2005)[22], Praxcell (radiée le 3/05/2012)[23], Icelltis (immatriculée le 10/01/2008)[24].

Les recherches menées au sein de l'IPBS impliquent plus de 150 collaborations internationales. Elles s'inscrivent dans de grands consortiums internationaux (NIH) et européens (de FP5 à Horizon 2020) : Membre de la Tuberculosis Vaccine Initiative[25] (TBVI, Union Européenne), Membre de la Collaboration for Tuberculosis Vaccine Discovery (CTVD)[26], de la Fondation Bill-et-Melinda-Gates, coordination d'un réseau européen "Innovative Training Network" (Actions Marie Skłodowska-Curie)[27] sur la biologie structurale des protéines membranaires.

Depuis 2000, l'IPBS fait partie du Consortium TBVAC[28]. Ce dernier rassemble un grand nombre de partenaires clés provenant d'excellents laboratoires d'Europe, ainsi que des États-Unis, d'Asie, d'Afrique et d'Australie, dont beaucoup sont des leaders mondiaux dans le domaine de la tuberculose. Des scientifiques et des développeurs de 40 partenaires de recherche collaborent à ce projet, débuté en 2015 pour quatre ans.

Depuis 2015, l’IPBS participe à divers projets européens, tels que RESPIRE 2 et 3, et au réseau de formation initiale (ITN) GLYCOGAN[29].

Sur la base d'une collaboration solide et ancienne avec l'Université de Ljubljana, l'IPBS a développé un laboratoire européen associé (LEA) intitulé "Pulsed Electric Fields Applications in Biology and Medicine", abrégé en LEA EBAM[30]. Ce laboratoire franco-slovène "sans murs", créé en janvier 2011, a été renouvelé jusqu'en 2018.

En 2016 un nouveau Partenariat International de Recherche (IRP, ex. LIA) a été créé entre le CNRS et le CONICET[31] (Argentine) et a renouvelé en janvier 2021 pour quatre années supplémentaires.

Les équipes de l’IPBS sont également membres de programmes européens de coopération transfrontalière, à travers le POCTEFA[32] 2014-2020 interrégional (Espagne-France-Andorre) créé pour promouvoir le développement durable des territoires frontaliers des trois pays des deux côtés des Pyrénées.

Au cours des dernières années, l'IPBS a participé à différents programmes européens: bourse ERC strating grant du Conseil Européen de la Recherche accordée en 2018 au Dr. Étienne Meunier (projet INFLAME), le financement ERA-NET[33] sur la résistance antimicrobienne (JPI-AMR), les projets TBVAC2020[34] et SMA-TB financés par H2020 (qui visent à élaborer des vaccins et des thérapies dirigées vers l'hôte contre la tuberculose), et le réseau doctoral européen Actions Marie Skłodowska-Curie en protéomique/bio-informatique PROTREIN[35].

L’IPBS est principalement soutenu par financement direct et indirect par le CNRS et l’Université Paul Sabatier, recouvrant les salaires de plus de 260 chercheurs. D’autres bailleurs de fonds comprennent l’Union Européenne, l’Occitanie (région administrative), l’industrie, les contrats publics, les associations caritatives et les prestations des plateformes technologiques.

Aujourd'hui, l’institut totalise 2200 publications, cinquante contrats européens et internationaux, plus de 300 thèses soutenues par des étudiants, 70 brevets déposés et huit startups accueillies en incubation.

Sources de financement de l'IPBS