Chromista
Chromista (les Chromistes)[alpha 1] sont un clade prĂ©sumĂ© d'organismes uni- et pluricellulaires. La plupart sont photosynthĂ©tiques, mais certains organismes autrefois classĂ©s parmi les « champignons infĂ©rieurs » â donc hĂ©tĂ©rotrophes â, sont aujourd'hui inclus dans ce taxon.
La pertinence de ce clade est remise en cause par des études récentes[1] rapprochant les Stramenopiles des Rhizaria. Il a donc été proposé d'utiliser le terme de Chromista pour désigner l'ensemble présumé monophylétique formé par les Harosa et les Hacrobia à la place du terme de Chromalveolata au sens large[2].
Les Chromistes sont moins diversifiés que les algues vertes mais plus que les algues rouges[3].
Ătymologie
Le terme Chromista dĂ©rive du grec ÏÏáż¶ÎŒÎ± / chrĂłma, couleur, en rĂ©fĂ©rence aux pigments de ces organismes qui leur donne une teinte plus ou moins soutenue. Le terme fut inventĂ© en 1981 par le biologiste britannique Thomas Cavalier-Smith, sur la base de termes plus anciens comme par exemple Chromophyta.
Caractéristiques propres
On trouve des caractéristiques propres au groupe, qui peuvent avoir disparu secondairement :
- Un réticulum périplastidial, situé entre les deux enveloppes du chloroplaste et les deux membranes externes.
- Les deux sous-groupes StramĂ©nopiles et Haptophytes prĂ©sentent les mĂȘmes pigments photosynthĂ©tiques.
- Le chloroplaste de la cellule est constituĂ© de quatre membranes : les deux membranes communĂ©ment trouvĂ©es chez les chloroplastes et deux membranes externes reliĂ©es le plus souvent Ă l'enveloppe nuclĂ©aire. Cette situation serait le rĂ©sultat d'une endosymbiose secondaire et plus prĂ©cisĂ©ment d'une ingestion d'une Rhodophyte unicellulaire par un autre Eucaryote. Ă ce sujet, la communautĂ© scientifique cherche Ă savoir si l'endosymbiose s'est effectuĂ©e plusieurs fois au sein des Chromistes ou si cela a Ă©tĂ© rĂ©alisĂ© une seule fois â et l'endosymbiote ensuite perdu â, ce qui rĂ©soudrait le problĂšme des StramĂ©nopiles non photosynthĂ©tiques.
- Plasmodium falciparum (Alveolata, Apicomplexa), parasite responsable du paludisme (stade en anneau dans une hématie).
GĂ©ologie
Le plus ancien fossile connu présumé date du Précambrien (700 Ma).
Liste des embranchements/divisions
Selon AlgaeBase (29 janvier 2022) :
- Embranchement des Bacillariophyta Karsten
- Embranchement des Bigyra Cavalier-Smith
- Embranchement des Cryptophyta Cavalier-Smith
- Embranchement des Katablepharidophyta N.Okamoto & I.Inouye
- Embranchement des Ochrophyta Cavalier-Smith
- Embranchement des Telonemia Shalchian-Tabrizi & al.
- Embranchement des Chromista phylum incertae sedis
- sous-rĂšgne des Hacrobia
- Embranchement des Cryptista Cavalier-Smith
- Embranchement des Haptophyta Hibberd ex Edvardsen & Eikrem
- sous-rĂšgne des Harosa (supergroupe SAR)
- infra-rĂšgne des Halvaria (ou Heterokonta ?)
- Embranchement des Ciliophora Doflein
- Embranchement des Miozoa Cavalier-Smith
- Embranchement des Oomycota Arx
- infra-rĂšgne des Rhizaria
- Embranchement des Foraminiferida d'Orbigny
- infra-rĂšgne des Halvaria (ou Heterokonta ?)
Selon Cavalier-Smith (1981, 2004, 2010)[4] - [5] - [2] :
- sous-rĂšgne des Harosa (Cavalier-Smith 2010)
- infrarĂšgne des Heterokonta (Cavalier-Smith 1986)
- embranchement des Bigyra (Cavalier-Smith 1998)
- embranchement des Pseudofungi (Cavalier-Smith 1986)
- embranchement des Ochrophyta (Cavalier-Smith 1986)
- infrarĂšgne des Alveolata (Cavalier-Smith 1991)
- embranchement des Myzozoa (Cavalier-Smith 2004)
- sous-embranchement des Dinozoa (Cavalier-Smith 1981)
- sous-embranchement des Apicomplexa (Levine 1970)
- embranchement des Ciliophora (Doflein 1901)
- embranchement des Myzozoa (Cavalier-Smith 2004)
- infrarĂšgne des Rhizaria (Cavalier-Smith 2002)
- embranchement des Cercozoa (Cavalier-Smith 1998)
- embranchement des Retaria (Cavalier-Smith 1999)
- sous-embranchement des Foraminifera (Eichwald 1830)
- sous-embranchement des Radiozoa (Cavalier-Smith 1987)
- infrarĂšgne des Heterokonta (Cavalier-Smith 1986)
- sous-rĂšgne des Hacrobia (Okamoto et al. 2009)
- embranchement des Cryptista (Cavalier-Smith 1989)
- embranchement des Haptophyta (Hibberd 1976)
- embranchement des Heliozoa (Haeckel 1862)
Selon ITIS (13 mars 2012)[6] :
- division des Bacillariophyta
Selon Catalogue of Life (13 mars 2012)[7] :
- embranchement des Cryptophyta
- embranchement des Haptophyta
- embranchement des Hyphochytriomycota
- embranchement des Labyrinthista
- embranchement des Ochrophyta
- embranchement des Oomycota
- embranchement des Sagenista (en)
- embranchement des Chromista phylum incertae sedis
Selon World Register of Marine Species (13 mars 2012)[8] :
- sous-rĂšgne Hacrobia
- embranchement des Cryptophyta
- embranchement des Haptophyta
- embranchement des Heliozoa
- sous-rĂšgne des Harosa
- infra-rĂšgne des Alveolata
- embranchement des Ciliophora
- embranchement des Myzozoa
- infra-rĂšgne des Heterokonta
- embranchement des Bigyra
- embranchement des Ochrophyta
- embranchement des Oomycota
- infra-rĂšgne des Rhizaria
- embranchement des Cercozoa
- embranchement des Foraminifera
- embranchement des Radiozoa
- infra-rĂšgne des Alveolata
Selon Aubert (2017)[9] :
- imperium Eukaryota
- regnum Chromista
- subregnum Hacrobia
- subregnum Harosa
- infraregnum Rhizaria
- infraregnum Halvaria
- superphylum Alveolata
- phylum Myzozoa
- phylum Ciliophora
- superphylum Heterokonta
- phylum Bigyra
- phylum Pseudofungi
- phylum Ochrophyta
- superphylum Alveolata
- regnum Chromista
Voir aussi
- Chromophyte
- Chromalveolata (classification phylogénétique)
- Classification phylogénétique du vivant, un ouvrage de Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader
- Mildiou
Liens externes
- Ressources relatives au vivant :
- Global Biodiversity Information Facility
- (en) EPPO Global Database
- (en) Paleobiology Database
- (mul + en) iNaturalist
- (en) Index Fungorum
- (en) MycoBank
- (en + en) New Zealand Organisms Register
- (en) SystÚme d'information taxonomique intégré
- (en) World Register of Marine Species
- Notice dans un dictionnaire ou une encyclopédie généraliste :
- Chromista (Univ Paris Sud 11)
Notes et références
Notes
- Dans leur ouvrage Classification phylogénétique du vivant, Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader désignent les Chromistes sous le nom de « lignée brune ».
Références taxonomiqies
- (en) Référence Catalogue of Life : Chromista (consulté le )
- (en) Référence AlgaeBase : rÚgne Chromista (consulté le )
- (en) RĂ©fĂ©rence Paleobiology Database : â kingdom Chromista Cavalier-Smith 1981 (consultĂ© le )
- (fr+en) Référence ITIS : Chromista (consulté le )
- (en) Référence World Register of Marine Species : taxon Chromista (+ liste espÚces) (consulté le )
Références
- Burki et al., 2007, Phylogenomics Reshuffles the Eukaryotic Supergroups.
- (en) Cavalier-Smith T, « Kingdoms Protozoa and Chromista and the eozoan root of the eukaryotic tree », Biol. Lett., vol. 6, no 3,â , p. 342â5 (PMID 20031978, DOI 10.1098/rsbl.2009.0948, lire en ligne)
- Augier M (1965). Biochimie et taxinomie chez les Algues. Bulletin de la Société Botanique de France, 112(sup1), 8-15.
- Thomas Cavalier-Smith, "Eukaryotic kingdoms: seven or nine?", BioSystems, Vol.14, No.3-4, 1981, p.461â481. DOI 10.1016/0303-2647(81)90050-2
- Thomas Cavalier-Smith, "Only six kingdoms of life", Proceedings of the Royal Society B, Vol.271, No.1545, June 22, 2004, p.1251â1262. DOI 10.1098/rspb.2004.2705
- Integrated Taxonomic Information System (ITIS), www.itis.gov, CC0 https://doi.org/10.5066/F7KH0KBK, consulté le 13 mars 2012
- Catalogue of Life Checklist, consulté le 13 mars 2012
- World Register of Marine Species, consulté le 13 mars 2012
- Damien Aubert, Classer le vivant : Les perspectives de la systĂ©matique Ă©volutionniste moderne, Paris, Ellipses, , 496 p. [dĂ©tail de lâĂ©dition] (ISBN 978-2-340-01773-3), chap. V (« La classification synthĂ©tique »), p. 324.