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Extinction fonctionnelle

L'expression « extinction fonctionnelle » désigne soit la cessation de la reproduction des individus d'une espèce, soit le fait qu'une espèce ne joue plus le rôle qui était le sien dans l'écosystème. Dans un contexte médiatique un certain flou entoure la notion d'extinction fonctionnelle, employée dans des sens parfois divers.

Le crapaud doré, déclaré éteint en 2001.

L'extinction fonctionnelle se distingue de l'extinction tout court, dont le critère le plus généralement admis est la mort du dernier spécimen[1].

L'espèce cesse de se reproduire
Symboles de la liste rouge de l'UICN.

Cette définition est celle de biologistes comme Kevin de Queiroz (en), et celle adoptée par le Committee on Recently Extinct Organisms (CREO). Selon ce Comité, « l'extinction fonctionnelle est une extinction inévitable, elle se réfère à une population réduite qui n'est plus en mesure de se reproduire »[1]. Cette situation se produit par exemple quand il ne reste que des spécimens du même sexe. Pour K. de Queiroz, une espèce se définissant comme un processus de transmission d’information génétique (et non comme la somme de ses membres), l'extinction fonctionnelle est en fait une extinction déjà réalisée, et non pas seulement une extinction inévitable[1].

L'espèce ne joue plus son rôle dans l'écosystème

Cette définition est celle des écologues. En ce sens, l'extinction fonctionnelle peut intervenir très tôt au début du déclin d'une population[2]. En effet, une espèce est considérée en danger à partir du moment où elle perd 30 % de ses effectifs mais selon les études écologiques, l'extinction fonctionnelle commence avant même la perte d'un tiers de la population de l'espèce, en raison des effets en cascade, ou « cascades alimentaires », dans l'écosystème[3].

T. Säterberg et ses collègues observent dans un article de la revue Nature en 2013[4] que la mort de moins d'un tiers des membres d'une espèce suffit à entraîner des phénomènes de coextinction : ainsi, avant la disparition d'une espèce, le taux de mortalité de ses membres ayant augmenté, certains de ses prédateurs ou de ses symbiotes s'éteignent complètement[5]. Cette étude montre aussi que l'extinction fonctionnelle d'une espèce provoque éventuellement l'extinction complète d'espèces qui ne lui sont pas directement liées dans le réseau trophique[6]. Plus la masse corporelle d'un animal est importante (plus il est gros), plus son extinction fonctionnelle déclenche de déséquilibres dans l'écosystème et de coextinctions[5].

Une connaissance plus précise des extinctions fonctionnelles peut guider les efforts entrepris en matière de conservation des espèces.

Exemples d'espèces fonctionnellement éteintes à l'époque moderne
Tigre de Chine méridionale.

Ces exemples font référence au premier sens (biologique) de l'extinction fonctionnelle :

Le , l'Australian Koala Foundation a publié un communiqué de presse selon lequel « L'Australian Koala Foundation (AKF) pense que les Koalas pourraient être fonctionnellement éteints dans tout le paysage australien[25]. », communiqué de presse relayé par plusieurs agences de presse[26]. Malgré cela, les koalas ne sont actuellement pas considérés comme fonctionnellement éteints[27] ; alors que leur population a diminué, la Liste rouge de l'UICN les répertorie uniquement comme « vulnérables ». Les populations ont diminué de 80 % dans certaines zones mais seraient encore viables dans un grand nombre d'autres régions selon Stuart Blanch, de WWF Australie. Le communiqué de presse de l'AKF a été publié à la veille des élections de 2019 en Australie, où des sujets tels que le changement climatique étaient des problèmes majeurs[28].

En 2011, une enquĂŞte de 3 ans sur la population faunique de l'Ă©cosystème de la BĂ©nouĂ© du nord du Cameroun (les parcs nationaux de BĂ©nouĂ©, Bouba-Ndjidda et Faro et 28 zones de chasse entourant les parcs) a conclu que la population de guĂ©pards du nord du Cameroun (Acinonyx jubatus) et les chiens sauvages africains (Lycaon pictus) Ă©taient maintenant fonctionnellement Ă©teints[29] - [30].

Parmi les définitions de l'extinction fonctionnelle dans des médias de grande diffusion, on trouve l'idée de consanguinité excessive : une espèce fonctionnellement éteinte serait « une population qui, même si elle se reproduit toujours, souffre d'une consanguinité qui peut menacer sa viabilité future », selon une spécialiste des koalas de l’université du Queensland s'exprimant dans The Conversation[31].

Articles connexes

Notes et références
  1. Julien Delord, « Quelques questions philosophiques : À propos de la nature des espèces & des extinctions », dans L’extinction d'espèce : Histoire d'un concept & enjeux éthiques, Publications scientifiques du Muséum, coll. « Archives », (ISBN 978-2-85653-863-0, lire en ligne), p. 407–441.
  2. Pablo Servigne et Raphaël Stevens, Comment tout peut s'effondrer. Petit manuel de collapsologie à l'usage des générations présentes : Petit manuel de collapsologie à l'usage des générations présentes, Le Seuil, (ISBN 978-2-02-122333-0, lire en ligne).
  3. Nicolas Hulot, Gauthier Chapelle, Jean-Marie Pelt et Michèle Decoust, Le Vivant comme modèle, Albin Michel, (ISBN 978-2-226-38646-5, lire en ligne).
  4. Säterberg, Sellman et Ebenman, « High frequency of functional extinctions in ecological networks », Nature, vol. 499, no 7459,‎ , p. 468–470 (PMID 23831648, DOI 10.1038/nature12277, Bibcode 2013Natur.499..468S).
  5. (en) Yoshida, « Not yet gone, but effectively extinct », arstechnica, (consultĂ© le ) : « But there is another type, called “functional extinction,” which takes a more ecological approach. Some scientists argue that the threshold for extinction should not be the complete disappearance of a species, but instead the point at which there aren’t enough individuals left in that species to perform whatever roles it was playing in the ecosystem. »
  6. (en) Yoshida, « Not yet gone, but effectively extinct », arstechnica, (consultĂ© le ) : « Dans l'Ă©tude, il apparaĂ®t que certaines des espèces qui avaient disparu Ă  la suite d'une extinction fonctionnelle n'Ă©taient pas directement liĂ©es aux espèces mourantes dans la chaĂ®ne alimentaire : In the study, many of the species that disappeared as a result of a functional extinction weren’t even directly linked to the dying species in the food web. »
  7. (en) « Dec 12, 2006 CE: Chinese River Dolphin Declared Extinct », NationalGeographic.org, Mary Crooks, National Geographic Society, (consultĂ© le ) : « On December 12, 2006, biologists declared the baiji (Chinese river dolphin) "functionally extinct." […] [T]here have been no confirmed baiji sightings in recent years. »
  8. (en) « Yangtze Finless Porpoise », World Wildlife Fund (consultĂ© le ) : « The Yangtze River, the longest river in Asia, used to be one of the only two rivers in the world that was home to two different species of dolphin—the Yangtze finless porpoise and the Baiji dolphin. However, in 2006 the Baiji dolphin was declared functionally extinct. This was the first time in history that an entire species of dolphin had been wiped off the planet because of human activity. »
  9. (en) Tom Phillips, « China's 'extinct' dolphin may have returned to Yangtze river, say conservationists », The Guardian, Beijing, China,‎ (lire en ligne, consulté le ) :
    « Chinese conservationists believe they may have caught a rare glimpse of a freshwater dolphin that was declared functionally extinct a decade ago having graced the Yangtze river for 20 million years. Scientists and environmentalists had appeared to abandon hope […] after they failed to find a single animal during a fruitless six-week hunt along the 6,300-km (3,915-mile) waterway in 2006. […] [T]he unconfirmed sighting occurred during a seven-day search mission down the Yangtze that began in the city of Anqing on 30 September [2016]. »
  10. (en) Luan Xiang, « Feature: Hope prevails for the baiji dolphin's comeback », XiahuaNet, Beijing, China, ZD,‎ (lire en ligne, consulté le ) :
    « Earlier this week, the China Biodiversity Conservation and Green Development Foundation (CBCGDF) released a photograph of a baiji lookalike, captured last month in a section of the Yangtze near Wuhu in the eastern province of Anhu. […] The institute said it would be imprudent to identify the animal in a photograph without further evidence. Nonetheless, it is too soon to label the species "extinct." »
  11. (en) B.D. Smith, D. Wang, G.T. Braulik, R. Reeves, K. Zhou, J. Barlow et R.L. Pitman, « Lipotes vexillifer. The IUCN Red List of Threatened Species 2017: e.T12119A50362206. », Red List,‎ (DOI 10.2305/IUCN.UK.2017-3.RLTS.T12119A50362206.en).
  12. (en) « White Rhino », World Wildlife Fund (consultĂ© le ) : « As of March 2018, there are only two rhinos of the northern white rhino left, both of which are female. »
  13. (en) « Northern white rhinoceros on the brink of extinction », accessscience.com, McGraw Hill,‎ (DOI 10.1036/1097-8542.BR0328011, lire en ligne, consulté le ) :
    « The Northern white rhinoceros (Ceratotherium simum cottoni)—one of two white rhino subspecies—is functionally extinct. »
  14. (en) Lammertink, « No more hope for the Ivory-billed Woodpecker Campephilus principalis », Cotinga, vol. 3,‎ , p. 45–47 (lire en ligne [archive du ] [PDF], consulté le ).
  15. (en) Butchart, Stattersfield et Brooks, « Going or gone: defining 'Possibly Extinct' species to give a truer picture of recent extinctions », Bulletin of the British Ornithologists' Club, vol. 126A,‎ , p. 7–24 (lire en ligne [archive du ] [PDF], consulté le ).
  16. (en) « Ivory-billed Woodpecker Campephilus principalis », Multi-Species Recovery Plan for South Florida, vol. Birds, no Ivory-billed woodpecker,‎ , p. 4–465 à 4–472 (lire en ligne [PDF], consulté le ).
  17. (en) Martin Schulz, National Recovery Plan for the Christmas Island Shrew (Crocidura attenuata trichura), Australian Government, The Department of the Environment and Energy, (ISBN 0-642-55011-5, lire en ligne) :
    « The Christmas Island Shrew was thought to be extinct until the accidental separate finding of two individuals in 1985… Information indicating the unconfirmed capture of two other shrews in 1958 when South Point (approx.: 10°33′S, 105°39′E) was being cleared for mining was provided by D. Powell (pers. comm. 1997 cited in Meek 1998). »
  18. (en) Platt, « Holiday Species Snapshot: Christmas Island Shrew », Scientific American, (consultĂ© le ) : « There's an official species recovery plan in place, though, just in case the shrews ever show up again. Sadly, that seems like it would require a Christmas miracle. »
  19. (en) Platt, « The Yangtze Giant Softshell Turtle Just Got 25 Percent Closer to Extinction », Scientific American, (consultĂ© le ) : « The massive turtle known as Cu Rua… passed away last week. […] Cu Rua was one of the last four Yangtze giant softshell turtles (Rafetus swinhoei) left in the world. Now only three remain: a turtle of unknown gender in another lake outside of Hanoi and a male-female pair in China. »
  20. (en) Sarah Gibbens, « There Are Only 3 of These Turtles Left on Earth », National Geographic,‎ (lire en ligne, consulté le ) :
    « In the waters of the Yunnan Province of China, a team of conservationists is hoping to find a turtle with some very valuable sperm. […] A male and female are in captivity in the Suzhou Zoo in China, and one wild turtle lives in a Vietnamese lake called Dong Mo. […] In February of [2016], a fourth turtle… died in captivity in Vietnam, reducing the world population by a quarter. »
  21. (en) Serenitie Wang, « One of world's most endangered turtles dies, leaving 3 left », CNN, Beijing, China,‎ (lire en ligne, consultĂ© le ) :
    « The last known female Yangtze giant softshell turtle has died in China, according to Chinese state media, potentially dooming the species to extinction. […] Now, there are only three left in the world, according to the Suzhou Daily. »
  22. (en) « South China Tiger », World Wildlife Fund (consultĂ© le ) : « The South China tiger population was estimated to number 4,000 individuals in the early 1950s. […] By 1996 the population was estimated to be just 30-80 individuals. Today the South China tiger is considered by scientists to be “functionally extinct,” as it has not been sighted in the wild for more than 25 years. »
  23. (en) P. Nyhus, « Panthera tigris ssp. amoyensis. The IUCN Red List of Threatened Species 2008: e.T15965A5334628. », Red List,‎ (DOI 10.2305/IUCN.UK.2008.RLTS.T15965A5334628.en).
  24. (en) AFP, « Tigers declared extinct in Cambodia », The Guardian,‎ (lire en ligne, consulté le ) :
    « The last tiger was seen on camera trap in the eastern Mondulkiri province in 2007, [the World Wildlife Fund] said. “Today, there are no longer any breeding populations of tigers left in Cambodia, and they are therefore considered functionally extinct,” the conservation group said in a statement. »
  25. (en) Tabart, « Australian Koala Foundation calls on the new Prime Minister to protect the Koala » [PDF], Save The Koala, The Australian Koala Foundation, (consultĂ© le ) : « The Australian Koala Foundation (AKF) believes Koalas may be functionally extinct in the entire landscape of Australia. »
  26. (en) Hannah Frishberg, « Koalas are now 'functionally extinct,' experts say », New York Post,‎ (lire en ligne, consulté le ).
  27. (en) Michael Le Page, « No, koalas are not 'functionally extinct', but they are in trouble », New Scientist,‎ (lire en ligne, consulté le ).
  28. (en) Christine Adams-Hosking, « A report claims koalas are 'functionally extinct' – but what does that mean? », The Conversation, The University of Queensland,‎ (lire en ligne, consulté le ).
  29. (en) De Iongh, Croes, Rasmussen et Buij, « The status of cheetah and African wild dog in the Bénoué Ecosystem, North Cameroon », CATnews, vol. 55,‎ , p. 29–31 (lire en ligne [PDF], consulté le ).
  30. (en) Smaranda Biliuti, « North Cameroon without African Wild Dogs or Cheetahs », Softpedia News,‎ (lire en ligne, consulté le ).
  31. Pauline Moullot, « Est-il vrai, comme le dit une association, que l'espèce des koalas est « fonctionnellement éteinte » ? », sur Libération.fr, (consulté le ).
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