Accueil🇫🇷Chercher

Colwellia chukchiensis

Colwellia chukchiensis est une des espèces du genre de bactéries marines Colwellia. Ce sont des bacilles à Gram négatif de la famille des Colwelliaceae faisant partie de l'embranchement des Pseudomonadota.

Colwellia chukchiensis
Description de l'image Defaut 2.svg.

Espèce

Colwellia chukchiensis
Yu, Li et Zeng 2011[1]
souche type BCw111 (CGMCC 1.9127; DSM 22576; LMG 25329)

Historique

Lors de la seconde expĂ©dition du brise-glace Xue Long pour la Recherche Nationale Arctique Chinoise, des prĂ©lèvements effectuĂ©s sur des sĂ©diments Ă  60 m de profondeur dans la Mer de Chukchi ont permis d'isoler la souche BCw111[1]. Cette souche est la souche type de l'espèce Colwellia chukchiensis[1].

Taxonomie

Étymologie

L'étymologie de cette espèce est la suivante : chuk.chi.en’sis N.L. masc./fem. adj. chukchiensis, qui vient de la Mer de Chukchi, lieu d'isolement de la souche type de cette espèce[2] - [3].

Phylogénie

L'analyse de la sĂ©quence nuclĂ©otidique de l'ARNr 16S de la souche BCw111 a permis de classer cette bactĂ©rie parmi diffĂ©rentes espèces de Colwellia. Cette souche est placĂ©e dans un clade comprenant les espèces C. polaris et C. aestuarii[2]. L'homologie de sĂ©quence la plus Ă©levĂ©e pour ce gène l'est avec ces deux espèces avec respectivement 97,8 % et 97,1 %[2]. Ce genre bactĂ©rien est phylogĂ©nĂ©tiquement inclus dans la classe des Pseudomonadota (ex Proteobacteria)[4].

Description

Description générale

Colwellia chukchiensis est une bactĂ©rie Ă  Gram nĂ©gatif. L'espèce est psychrotolĂ©rante et anaĂ©robie facultative sur gĂ©lose marine supplĂ©mentĂ©e avec du nitrate. Cette espèce est formĂ©e des bacilles incurvĂ©s d'une largeur de 0,5 Âµm Ă  1,06 Âµm et de 1,1 Âµm Ă  4,5 Âµm de long[2]. Colwellia chukchiensis est mobile par l'intermĂ©diaire d'un flagelle polaire unique. Cette espèce est positive pour les tests catalase et oxydase[2]. Sur gĂ©lose marine, les colonies sont circulaires et convexes, non pigmentĂ©es, lisses et avec des bords bien dĂ©limitĂ©s. La croissance est optimale Ă  un tempĂ©rature comprise entre 23 °C et 25 °C et reste possible entre 0 °C et 30 °C. Le croissance nĂ©cessite un pH de 5.0 Ă  10.5 (optimal entre pH 6.0 et pH 8.0) et une concentration en NaCl de 0.5 Ă  8.0 % (w/v). Il n'y a ucune croissance au-delĂ  de 33°C ou sans NaCl[2]. Cette espèce ne produit pas de sulfide d'hydrogène, ni d'indole et le test Voges–Proskauer est nĂ©gatif. Elle peut rĂ©duire le nitrate en azote[2]. Elle est aussi capable d'hydrolyser la casĂ©ine, la gĂ©latine et le Tween 80[2].

Activités enzymatiques

En plus des activités enzymatiques catalase et cytochrome oxydase donnant un test positif, Colwellia chukchiensis peut aussi être caractérisée par des tests positifs pour les enzymes suivantes : Phosphatase alcaline, Estérase (C4), Estérase lipase (C8), naphthol-AS-BI-phosphohydrolase, valine arylamidase et leucine arylamidase. Par contre, elle est négative pour les tests d'activités des enzymes arginine dihydrolase, lysine décarboxylase, ornithine décarboxylase, lipase (C14), a-chymotrypsin, Phosphatase acide, trypsine, cystine aryla-midase, alpha-galactosidase, bêta-galactosidase, bêta-glucuronidase, alpha-glucosidase, N-acetyl-b-glucosaminidase, alpha-mannosidase et alpha-fucosidase[2].

GĂ©nome

Lors de sa description, l'espèce la plus proche est C. polaris avec laquelle l'hybridation ADN-ADN est de 42,6 %.

Habitat

La souche type de cette espèce a Ă©tĂ© isolĂ© dans les sĂ©diments marins Ă  une profondeur de 60 m en Mer de de Chukchi[1].

Notes et références

  1. Yu, Li et Zeng 2011, p. 850.
  2. Yu, Li et Zeng 2011, p. 852.
  3. (en) « Species Colwellia chukchiensis », sur LPSN,
  4. Xu et et al. 2017, p. 1972.

Bibliographie

  • (en) Yong Yu, Hui-Rong Li et Yin-Xin Zeng, « Colwellia chukchiensis sp. nov., a psychrotolerant bacterium isolated from the Arctic Ocean », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 61, no 4,‎ , p. 850-853 (DOI 10.1099/ijs.0.022111-0)
  • (en) Zhen-Xing Xu, Heng-Xi Zhang, Ji-Ru Han, Christopher A. Dunlap, Alejandro P. Rooney, Da-Shuai Mu et Zong-Jun Du, « Colwellia agarivorans sp. nov., an agar-digesting marine bacterium isolated from coastal seawater », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 67, no 6,‎ , p. 1969-1974 (DOI 10.1099/ijsem.0.001897)

Liens externes

Cet article est issu de wikipedia. Text licence: CC BY-SA 4.0, Des conditions supplémentaires peuvent s’appliquer aux fichiers multimédias.