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Colwellia

Taxonomie

Étymologie

L'étymologie de ce genre est la suivante : Col.well’i.a N.L. fem. n. Colwellia, cette bactérie a été nommée ainsi en honneur de la microbiologiste américaine, le professeur Rita R. Colwell[1] - [2].

Historique

Le genre Colwellia a été décrit en après l'isolement d'une bactérie des profondeurs marines[1]. L'analyse de la séquence nucléotidiques de l'ARNr 5S a permis d'identifier une autre bactérie proche mais identifiée auparavant comme Vibrio psychroerythrus. Cela a donné lieu à la création de deux nouvelles espèces, Colwellia psychrerythraea et Colwellia hadaliensis dans ce nouveau genre bactérien et de le classer au sein des Protéobactéries. La famille Colwelliaceae décrite en a permis de regrouper dans une même famille les genres Colwellia et Thalassomonas du fait de l'homologie de leurs séquences nucléotidiques en ARNr 16S[3]. En , lors de la description de l'ordre Alteromonadales dans le Bergey's Manual, la famille Alteromonadaceae y est intégrée comme unique famille de cet ordre et contenant entre autres les Colwellia[4]. La même année dans la liste des nouveaux noms n°106, les Colwellia sont séparées de cette famille et intégrée dans celle des Colwelliaceae[5].

Liste des espèces
Espèces décrites de manière valide

Selon la LPSN (19 septembre 2022)[6], le genre Colwellia compte 22 espèces publiées de manière valide :

Espèce publiée de manière non valide

"Candidatus Colwellia aromaticivorans"

Espèces dont le genre est disputé

En , Liu propose de scinder le genre Colwellia en trois genres nommés Colwellia, Cognaticolwellia et Pseudocolwellia[7]. Les espèces suivantes, classées actuellement au sein du genre Colwellia ont été également proposées pour faire partie de ces genres bactériens.

  • Genre Cognaticolwellia (dĂ©crit en 2021) avec les espèces Cognaticolwellia aestuarii (=Colwellia aestuarii), Cognaticolwellia beringensis (=Colwellia beringensis) et Cognaticolwellia chukchiensis (=Colwellia chukchiensis)
  • Genre Pseudocolwellia avec les espèces Pseudocolwellia agarivorans (=Colwellia agarivorans)

Description

Lors de sa description de , la famille Colwelliaceae reprend la description des Colwellia et est composée de bactéries à Gram négatif avec des bacilles à morphologie incurvée et mobiles bien que quelques espèces semblent non mobiles[8]. Ces bacilles ne forment pas d'endospores ni de kystes[8]. La majeure partie des bactéries de cette famille sont des chimioorganotrophes anaérobies facultatifs nécessitant des ions sodium pour leur croissance[8].

Notes et références
  1. Deming et et al. 1988, p. 152.
  2. (en) « Genus Colwellia », sur LPSN,
  3. Ivanova, Flavier et Christen 2004, p. 1781.
  4. Bowman et McMeekin 2005, p. 443.
  5. (en) Jean Euzéby, « Validation List no. 106. Validation of publication of new names and new combinations previously effectively published outside the IJSEM », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, IUMS, vol. 55,‎ , p. 2235–2238 (DOI 10.1099/ijs.0.64108-0)
  6. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 19 septembre 2022
  7. Liu 2020, p. 919.
  8. Ivanova, Flavier et Christen 2004, p. 1785.

Bibliographie
  • (en) Jody W. Deming, Leslie K. Somers, William L. Straube, David G. Swartz et Michael T. Macdonell, « Isolation of an Obligately Barophilic Bacterium and Description of a New Genus, Colwellia gen. nov. », Systematic and Applied Microbiology, vol. 10, no 2,‎ , p. 152-160 (DOI 10.1016/S0723-2020(88)80030-4)
  • (en) Elena P. Ivanova, SĂ©bastien Flavier et Richard Christen, « Phylogenetic relationships among marine Alteromonas-like proteobacteria: emended description of the family Alteromonadaceae and proposal of Pseudoalteromonadaceae fam. nov., Colwelliaceae fam. nov., Shewanellaceae fam. nov., Moritellaceae fam. nov., Ferrimonadaceae fam. nov., Idiomarinaceae fam. nov. and Psychromonadaceae fam. nov. », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 54, no 5,‎ , p. 1773-1788
  • (en) John P. Bowman et Thomas A. McMeekin, « Order X. Alteromonadales ord. nov. », dans Brenner Don J., Krieg Noel R., Staley James T., Garrity GM (eds), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), New York, Springer, , p. 443
  • (en) E.P. Ivanova et V.V. Mikhailov, « A New Family, Alteromonadaceae fam. nov., Including Marine Proteobacteria of the Genera Alteromonas, Pseudoalteromonas, Idiomarina, and Colwellia », Microbiology, vol. 70,‎ , p. 10–17 (DOI 10.1023/A:1004876301036)
  • (ru) E.P. Ivanova et V.V. Mikhailov, « A New Family, Alteromonadaceae fam. nov., Including Marine Proteobacteria of the Genera Alteromonas, Pseudoalteromonas, Idiomarina, and Colwellia », Microbiologiia, vol. 70,‎ , p. 15-23
  • (en) A Liu, YJ Zhang, P Cheng, YJ Peng, J Blom et QJ Xue, « Whole genome analysis calls for a taxonomic rearrangement of the genus Colwellia. », Antonie Van Leeuwenhoek, vol. 113,‎ , p. 919-931 (DOI 10.1007/s10482-020-01405-6)

Liens externes
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