Colwellia psychrotropica
Colwellia psychrotropica est une des espèces du genre bactérien Colwellia. Cette espèce est formée de bacilles à Gram négatif de la famille des Colwelliaceae. Ces bactéries marines psychrophiles font partie de l'embranchement des Pseudomonadota.
| Règne | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Pseudomonadota |
| Classe | Gammaproteobacteria |
| Ordre | Alteromonadales |
| Famille | Colwelliaceae |
| Genre | Colwellia |
Historique
Colwellia psychrotropica a été décrite en en même temps que trois autres espèces du genre Colwellia, Colwellia demingiae, Colwellia rossensis et Colwellia hornerae, toutes les quatre isolées à partir de prélèvements d'eaux de l'Antarctique[2].
Taxonomie
Étymologie
L'étymologie de cette espèce Colwellia psychrotropica est la suivante : psy.chro.tro.pi’ca Gr. masc. adj. psychros, froid; L. fem. adj. tropica, tropique, cercle; N.L. fem. adj. psychrotropica, qui a une affinité pour le froid[3] - [4].
Phylogénie
La comparaison des séquences de l'ARNr 16S de la souche ACAM 179 et de celles des autres souches de Colwellia, a montré une homologie d'environ 95,1 % à 97,8 %. L'analyse phylogénique confirme la proximité de cette souche et des autres Colwellia. Elle se retrouve sur le même nœud que la souche ACAM 608 qui deviendra Colwellia rossensis[5]. Cette même analyse phylogénique montre que les genres les plus proches sont les genres Pseudoalteromonas et Alteromonas[5]. Tout comme ces deux genres et les autres Colwellia, l'espèce Colwellia psychrotropica est classée parmi les Gammaproteobacteria et les Protéobactéries à cette date [5]. La famille Colwelliaceae décrite ensuite en a permis de regrouper dans une même famille les genres Colwellia et Thalassomonas du fait de l'homologie de leurs séquences nucléotidiques en ARNr 16S[6]. En , lors de la description de l'ordre Alteromonadales dans le Bergey's Manual, la famille Alteromonadaceae y est intégrée comme unique famille de cet ordre et contenant entre autres les Colwellia[7]. La même année dans la liste des nouveaux noms n°106, les Colwellia sont séparées de cette famille et intégrée dans celle des Colwelliaceae[8].
Description
Lors de sa description de , L'espèce C. psychrotropica est décrite comme une espèce de bactéries à Gram négatif avec des bacilles à morphologie incurvée et mobiles avec parfois des bactéries plus sphériques[9]. La majeure partie des bactéries de cette famille sont des chimiohétérotrophes anaérobies facultatifs nécessitant des ions sodium pour leur croissance[9] - [10].
La souche type de cette espèce C. psychrotropica est la souche ACAM 179[4].
Habitat
Tout plusieurs autres Colwellia, l'espèce C. psychrotropica est une bactérie psychrophile marine. Elle a par ailleurs été isolée dans le pycnocline d'un lac salin marin méromictique en Antarctique[9].
Notes et références
- Bowman et et al. 1998, p. 1171.
- Bowman et et al. 1998, p. 1172.
- Bowman et et al. 1998, p. 1178.
- (en) « Species Colwellia psychrotropica », sur LPSN,
- Bowman et et al. 1998, p. 1177.
- Ivanova, Flavier et Christen 2004, p. 1781.
- Bowman et McMeekin 2005, p. 443.
- (en) Jean Euzéby, « Validation List no. 106. Validation of publication of new names and new combinations previously effectively published outside the IJSEM », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, IUMS, vol. 55,‎ , p. 2235–2238 (DOI 10.1099/ijs.0.64108-0)
- Bowman et et al. 1998, p. 1179.
- Ivanova, Flavier et Christen 2004, p. 1785.
Bibliographie
- (en) John P. Bowman, John J. Gosink, Sharee A. McCammon, Tom E. Lewis, David S. Nichols, Peter D. Nichols, Jenny H. Skerratt, Jim T. Staley et Tom A. McMeekin, « Colwellia demingiae sp. nov., Colwellia hornerae sp. nov., Colwellia rossensis and Colwellia psychrotropica sp. nov.: psychrophilic Antarctic species with the ability to synthesize docosahexaenoic acid (22:6ω3). », Int. J. Syst. Bacteriol., vol. 48, no 4,‎ , p. 1171-1180 (DOI 10.1099/00207713-48-4-1171)
- (en) JY D'Aoust et DJ. Kushner, « Vibrio psychroerythrus sp. n.: classification of the psychrophilic marine bacterium, NRC 1004. », J Bacteriol, vol. 111,‎ , p. 340-342 (DOI 10.1128/jb.111.2.340-342.1972)
- (en) Jody W. Deming, Leslie K. Somers, William L. Straube, David G. Swartz et Michael T. Macdonell, « Isolation of an Obligately Barophilic Bacterium and Description of a New Genus, Colwellia gen. nov. », Systematic and Applied Microbiology, vol. 10, no 2,‎ , p. 152-160 (DOI 10.1016/S0723-2020(88)80030-4)
- (en) Elena P. Ivanova, Sébastien Flavier et Richard Christen, « Phylogenetic relationships among marine Alteromonas-like proteobacteria: emended description of the family Alteromonadaceae and proposal of Pseudoalteromonadaceae fam. nov., Colwelliaceae fam. nov., Shewanellaceae fam. nov., Moritellaceae fam. nov., Ferrimonadaceae fam. nov., Idiomarinaceae fam. nov. and Psychromonadaceae fam. nov. », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 54, no 5,‎ , p. 1773-1788
- (en) John P. Bowman et Thomas A. McMeekin, « Order X. Alteromonadales ord. nov. », dans Brenner Don J., Krieg Noel R., Staley James T., Garrity GM (eds), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), New York, Springer, , p. 443
- (en) E.P. Ivanova et V.V. Mikhailov, « A New Family, Alteromonadaceae fam. nov., Including Marine Proteobacteria of the Genera Alteromonas, Pseudoalteromonas, Idiomarina, and Colwellia », Microbiology, vol. 70,‎ , p. 10–17 (DOI 10.1023/A:1004876301036)
- (ru) E.P. Ivanova et V.V. Mikhailov, « A New Family, Alteromonadaceae fam. nov., Including Marine Proteobacteria of the Genera Alteromonas, Pseudoalteromonas, Idiomarina, and Colwellia », Microbiologiia, vol. 70,‎ , p. 15-23
Liens externes
- Ressources relatives au vivant :