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Amalgaviridae

Les Amalgaviridae sont une famille de virus de l'ordre des Durnavirales qui comprend deux genres et dix espèces. Ce sont des virus à ARN à double brin, rattachés au groupe III de la classification Baltimore, qui infectent principalement les plantes (phytovirus), une espèce infectant des champignons (mycovirus).

Amalgaviridae
Description de l'image Defaut 2.svg.
Classification selon l’ICTV
Royaume Riboviria
Règne Orthornavirae
Embranchement Pisuviricota
Classe Duplopiviricetes
Ordre Durnavirales

Famille

Amalgaviridae
ICTV 2013[1]

Genres de rang inférieur

Selon NCBI (21 décembre 2020)[2] :

Étymologie

Le nom de famille « Amalgaviridae » dérive du terme « amalgame », en référence au mélange d'homologies avec les Totiviridae et les Partitiviridae qui caractérise la famille des Amalgaviridae[3], suivi du suffixe -viridae qui caractérise les noms de familles de virus.

GĂ©nome

Les virus de la famille des Amalgaviridae ont un génome monopartite d'environ 3,5 kilobases[4] - [5]. Il présente deux cadres de lecture ouverts qui se chevauchent partiellement et codent l' ARN polymérase ARN-dépendante (RdRp) et une protéine de capside supposée[4] - [6].

Liste des genres et espèces

Selon ICTV[7] :

  • Amalgavirus
    • Allium cepa amalgavirus 1
    • Allium cepa amalgavirus 2
    • Blueberry latent virus[8]
    • Rhododendron virus A[5]
    • Southern tomato virus (espèce-type)[4]
    • Spinach amalgavirus 1
    • Vicia cryptic virus M[6]
    • Zoostera marina amalgavirus 1
    • Zoostera marina amalgavirus 2
  • Zybavirus
    • Zygosaccharomyces bailii virus Z (espèce-type)

Notes et références
  1. ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 24 janvier 2021
  2. NCBI, consulté le 21 décembre 2020
  3. (en) « Amalgavirus », sur ViralZone (consulté le ).
  4. (en) S Sabanadzovic, R. A. Valverde, J. K. Brown, R. R. Martin et I. E. Tzanetakis, « Southern tomato virus: The link between the families Totiviridae and Partitiviridae », Virus Research, vol. 140, nos 1–2,‎ , p. 130–7 (DOI 10.1016/j.virusres.2008.11.018).
  5. (en) S Sabanadzovic, N Abou Ghanem-Sabanadzovic et R. A. Valverde, « A novel monopartite dsRNA virus from rhododendron », Archives of Virology, vol. 155, no 11,‎ , p. 1859–63 (DOI 10.1007/s00705-010-0770-5).
  6. (en) W Liu et J Chen, « A double-stranded RNA as the genome of a potential virus infecting Vicia faba », Virus Genes, vol. 39, no 1,‎ , p. 126–31 (DOI 10.1007/s11262-009-0362-1).
  7. (en) « Virus Taxonomy: 2019 Release », sur ICTV, (consulté le ).
  8. (en) R. R. Martin, J Zhou et I. E. Tzanetakis, « Blueberry latent virus: An amalgam of the Partitiviridae and Totiviridae », Virus Research, vol. 155, no 1,‎ , p. 175–80 (DOI 10.1016/j.virusres.2010.09.020).

Liens externes
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