Labyrinthulomycetes
Les Labyrinthulomycetes (ICBN) ou Labyrinthulea[1] (ICZN) sont une classe de protistes du supergroupe des Stramenopile, qui produisent un réseau ectoplamisque[2] - [3] de filaments ou de tubes, dont les cellules se servent pour absorber des éléments nutritifs et le long desquels elles glissent. Il y a deux groupes principaux, les labyrinthulides et les thraustochytrides. Ce sont des êtres essentiellement marins, généralement sous forme de parasites sur des algues ou des décomposeurs de matériel végétal mort. Leur groupe comprend aussi des parasites d'invertébrés marins.
Règne | Chromista |
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Division | Labyrinthulomycota |
Bien qu'ils soient situés en dehors des cellules, les filaments sont dotés d'une membrane. Ils se forment et se connectent au cytoplasme par une organelle unique nommée un « bothrosome » par Porter (1969)[4] - [5] ou « sagenogenetosome » par Perkins (1972)[6] - [7]. Les cellules sont à noyau unique et typiquement en forme d'œuf, et se déplacent le long du réseau amorphe à des vitesses entre 5-150 µm par minute. Les cellules des labyrinthulides sont renfermées dans les tubes alors que, chez les thraustochytrides, elles sont attachées à leurs côtés.
Classification
À l'origine, les labyrinthulomycètes furent classés par Whittaker (1969) sous l'embranchement désuet des Labyrinthulomycota. On les considérait comme des moisissures visqueuses inhabituelles, bien qu'ils ne ressemblent pas beaucoup aux autres moisissures amiboïdes (placées au sein des Mycétozoaires[8] ou bien au sein des Myxomycètes[2] - [9]). La structure de leurs semences (zoospores) et en plus des études génétiques démontrent qu'ils sont un groupe primitif d'hétérokontées, mais leur classification n'est toujours pas résolue.
Ils étaient anciennement positionnés au sein des Fungi[10] et étudiés comme tels par des biologistes marins[11] - [12] - [13].
Cavalier-Smith les considérait comme des chromistes hétérocontes hétérotrophes et les rangeait, en 1997, au sein du phylum des Sagenista[1]. Puis, ses réflexions sur la classification phylogénétique évoluant, il les classait, en 2010, dans le phylum des Bigyra[14].
Au sein du règne des Chromista, la classe n'a que deux ordres, les Labyrinthulales et les Thraustochytriales[15].
D'autres biologistes ont une vision différente de la taxinomie du vivant et les considèrent comme un phylum qu'ils placent dans le super-groupe des Stramenopila[16].
Le comité Adl et al. (2012)[5] de la Société internationale des protistologistes entérine le taxon Labyrinthulomycetes Dick 2001, placé au sein des Stramenopiles Patterson 1989.
Liste des familles et des ordres
Selon AlgaeBase (12 septembre 2022)[17] et World Register of Marine Species (12 septembre 2022)[18] :
- Labyrinthulida Lankester , 1877
- Thraustochytriida Sparrow, 1973
Selon NCBI (30 avril 2013)[19] :
- non-classé Amphitremida
- famille Amphitraemidae
- famille Labyrinthula
- famille Thraustochytriaceae
Systématique
Le nom correct complet (avec auteur) de ce taxon est Labyrinthulea Olive ex Cavalier-Smith, 1986[17].
Notes et références
- (en) Thomas Cavalier-Smith, « Sagenista and bigyra, two phyla of heterotrophic heterokont chromists », Archiv für Protistenkunde, vol. 148, no 3,‎ , p. 253–267 (ISSN 0003-9365, DOI 10.1016/S0003-9365(97)80006-1, résumé)
- Marc-André Selosse et Guy Durrieu, « Une classification mycologique phylogénétique francophone (en 2003) », Acta Botanica Gallica, vol. 151, no 1,‎ , p. 73-102 (ISSN 1253-8078, DOI 10.1080/12538078.2004.10516022, lire en ligne)
- (en) Clement K.M Tsui, Wyth Marshall, Rinka Yokoyama, Daiske Honda, J. Casey Lippmeier, Kelly D. Craven, Paul D. Peterson et Mary L. Berbee, « Labyrinthulomycetes phylogeny and its implications for the evolutionary loss of chloroplasts and gain of ectoplasmic gliding », Molecular Phylogenetics and Evolution, vol. 50, no 1,‎ , p. 129-140 (ISSN 1055-7903, DOI 10.1016/j.ympev.2008.09.027, résumé)
- (en) David Porter, « Ultrastructure of Labyrinthula », Protoplasma, vol. 67, no 1,‎ , p. 1-19 (ISSN 0033-183X, DOI 10.1007/BF01256763, résumé)
- (en) Sina M. Adl, Alastair G.B. Simpson, Christopher E. Lane, Julius Lukeš, David Bass, Samuel S. Bowser, Matthew W. Brown, Fabien Burki, Micah Dunthorn, Vladimir Hampl, Aaron Heiss, Mona Hoppenrath, Enrique Lara, Line Le Gall, Denis H. Lynn, Hilary McManus, Edward A.D. Mitchell, Sharon E. Mozley-Stanridge, Laura W. Parfrey, Jan Pawlowski, Sonja Rueckert, Laura Shadwick, Conrad L. Schoch, Alexey Smirnov et Frederick W. Spiegel, « The Revised Classification of Eukaryotes », Journal of Eukaryotic Microbiology, vol. 59, no 5,‎ , p. 429-514 (ISSN 1066-5234, DOI 10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x, lire en ligne)
- (en) Frank O. Perkins, « The ultrastructure of holdfasts, “rhizoids”, and “slime tracks” in thraustochytriaceous fungi and Labyrinthula spp. », Archiv für Mikrobiologie, vol. 84, no 2,‎ , p. 95-118 (ISSN 0302-8933, DOI 10.1007/BF00412431, résumé)
- (en) Giselle Walker, Richard G. Dorrell, Alexander Schlacht et Joel B. Dacks, « Eukaryotic systematics : a user's guide for cell biologists and parasitologists », Parasitology, vol. 138, no 13,‎ , p. 1638-1663 (ISSN 0031-1820, DOI 10.1017/S0031182010001708, lire en ligne)
- (en) Lindsay S. Olive, The Mycetozoans, New York, Academic Press, Inc., , 293 p. (ISBN 0-12-526250-7)
- Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader, Classification phylogénétique du vivant, Paris, Belin, , 3e éd. (1re éd. 2001), 559 p., 1 vol. + 1 livret des arbres de la classification phylogénétique (ISBN 2-7011-4273-3), p. 146-147
- (en) John Charles David, « A Preliminary Catalogue of the Names of Fungi above the Rank of Order », Constancea, vol. 83, no 16,‎ , p. 1-30 (lire en ligne [html])
- (en) Stephen T. Moss, « Chapter 11 : Biology and phylogeny of Labyrintulales and Thraustochydriales », dans Stephen T. Moss, The Biology of marine Fungi, vol. 4 : International marine mycology symposium, Cambridge, Cambridge University Press, , 382 p. (ISBN 0521308992), p. 105-130
- (en) G. Bahnweg et I. Jäckle, « Chapter 12 : A new approach to taxonomy of the Thraustochydriales and the Labyrintulales », dans Stephen T. Moss, The Biology of marine Fungi, vol. 4 : International marine mycology symposium, Cambridge, Cambridge University Press, , 382 p. (ISBN 0521308992), p. 131-140
- (en) Eduardo M. Leaño et Varada Damare, « Chapter 12 : Labyrinthulomycota », dans E.B. Gareth Jones, Ka-Lai Pang (Eds.), Marine Fungi : And Fungal-like Organisms, Boston, De Gruyter, , 528 p. (ISBN 978-3110264067), p. 210-243
- (en) Thomas Cavalier-Smith, « Supplementary material for : Kingdoms Protozoa and Chromista and the eozoan root of the eukaryotic tree », sur Biology Letters, (consulté le )
- BIOGEOnet, Université de Liège, consulté le 2 mai 2013
- (en) Eleanor Lawrence (dir.), Henderson's Dictionary of Biology : Fourteenth Edition, Harlow (Essex), Pearson Education, , 14e Ă©d. (1re Ă©d. 1920), xii + 759 (ISBN 978-0-321-50579-8, lire en ligne), p. 744-745
- Guiry, M.D. & Guiry, G.M. AlgaeBase. World-wide electronic publication, National University of Ireland, Galway. https://www.algaebase.org, consulté le 12 septembre 2022
- World Register of Marine Species, consulté le 12 septembre 2022
- NCBI, consulté le 30 avril 2013
Liens externes
- (en) Référence AlgaeBase : classe Labyrinthulea Olive ex Cavalier-Smith, 1986 (consulté le )
- (en) Référence BioLib : Labyrinthulomycetes Dick, 2001 (consulté le )
- (en) Référence Catalogue of Life : Labyrinthulea (consulté le )
- (fr+en) Référence EOL : Labyrinthulea (consulté le )
- (en) Référence Index Fungorum : Labyrinthulomycetes Arx (+ MycoBank) (consulté le )
- (fr+en) Référence GBIF : Labyrinthulea (consulté le )
- (en) Référence IRMNG : Labyrinthulea (consulté le )
- (en) Référence MycoBank : Labyrinthulomycetes Arx (consulté le )
- (en) Référence NCBI : Labyrinthulomycetes (taxons inclus) (consulté le )
- (en) Référence The Taxonomicon : Labyrinthulea Olive ex Cavalier-Smith, 1986 (consulté le )
- (en) Référence Tree of Life Web Project : Labyrinthulomycetes (consulté le )
- (en) Référence World Register of Marine Species : taxon Labyrinthulomycetes [non valide] (+ liste espèces) (consulté le )
- (en) Référence World Register of Marine Species : taxon Labyrinthulea (+ liste espèces) (consulté le )