Institut suisse de bioinformatique

À l'origine, l'Institut suisse de bioinformatique a été créé pour fournir un cadre de financement stable à long terme à la fois pour la base de données Swiss-Prot et le nœud suisse EMBnet. Swiss-Prot en particulier a connu une crise majeure de financement en 1996[1] qui a conduit les dirigeants des cinq groupes de recherche actifs en bioinformatique à Genève et Lausanne, Ron Appel, Amos Bairoch, Philipp Bucher, Victor Jongeneel et Manuel Peitsch à proposer la création de l'institut[2]. Après sa création, l'institut a pu alors demander un financement en vertu d'une loi suisse qui permet au gouvernement de financer jusqu'à 50 % des dépenses liées à la recherche et aux infrastructures d'enseignement vitales[3].

Le premier directeur de l'institut est Victor Jongeneel, suivi entre 2001 et septembre 2007 par Ernest Feytmans puis par Ron Appel, l'un de ses membres fondateurs[4]. Entre juin 2018 et mars 2022, l'institut est co-dirigé par Christine Durinx et Ron Appel[5]. Depuis avril 2022, Christophe Dessimoz a remplacé Christine Durinx en tant que co-directeur[6].

L'Institut Suisse de Bioinformatique est une fédération de groupes de recherche de bioinformaticiens affiliés à 21 institutions partenaires, entre autres les Universités de Bâle, Berne, Fribourg, Genève, Lausanne, Lugano et Zurich, les Ecoles Polytechniques Fédérales de Lausanne et Zurich, l'Institut Friedrich Miescher pour la recherche biomédicale, ainsi que la Haute école de gestion de Genève (HEG). Les groupes de recherche de l'institut se trouvent à Bâle, Berne, Fribourg, Genève, Lausanne, Lugano, Zurich, Yverdon, Wädenswil, Bellinzone et Davos.

L'institut fédère plus de 70 groupes de recherche, services et infrastructures, rassemblant plus de 700 scientifiques, dans des domaines aussi variés que la protéomique, la transcriptomique, la génomique, la biologie des systèmes, la bioinformatique structurale, la bioinformatique de l'évolution, la modélisation, l'imagerie, la biophysique, la biocuration, la génétique des populations et la bioinformatique clinique.

L'Institut suisse de bioinformatique offre un large éventail de ressources utiles à la communauté des chercheurs en sciences de la vie, la plupart étant accessibles via Expasy, le portail des ressources en ligne. Elles comprennent des bases de données, des logiciels et des infrastructures technologiques

L'une des priorités de l'Institut suisse de bioinformatique est de promouvoir et de coordonner l'enseignement en bioinformatique. Ses membres sont directement ou indirectement impliqués dans un certain nombre de cours de bioinformatique à tous les niveaux d'enseignement — de l'école secondaire à l'enseignement supérieur — ainsi que dans la formation continue spécialisée pour les scientifiques des sciences de la vie. L'institut a également développé un réseau de doctorants en bioinformatique, qui est ouvert aux étudiants diplômés des écoles suisses de l'enseignement supérieur. Les objectifs de ce réseau sont de deux ordres :

1. offrir aux étudiants des cycles supérieurs en bioinformatique un éventail de cours de haute qualité, mêlant à la fois théorie et pratique, afin de leur permettre de mener avec succès un projet de recherche de doctorat ;
2. favoriser le développement du réseau de doctorants, promouvoir les échanges d'idées, ainsi que la mobilité des étudiants entre les institutions participantes.

L'institut s'applique aussi à faire découvrir et à faire comprendre la bioinformatique à un public profane. Comprendre l'importance croissante que cette récente discipline a dans la société actuelle est un enjeu fondamental. En effet, dans un avenir proche, les patients feront référence à des résultats directement générés par des méthodes bioinformatiques. Depuis l'an 2000, dans le but de sensibiliser le grand public, l'institut participe à de nombreuses portes ouvertes scientifiques, a créé deux magazines en ligne[7] - [8], une exposition en plein air et en 2012, une exposition virtuelle[9].