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David Klenerman

David Klenerman (né en 1959) est un chimiste biophysique britannique et professeur de chimie biophysique au Département de chimie de l'Université de Cambridge [1] et membre du Christ's College, Cambridge [2]. Il est surtout connu pour sa contribution dans le domaine du séquençage de nouvelle génération de l'ADN (qui aboutit ensuite à Solexa, une société de séquençage d'ADN à haut débit qu'il a cofondée) [3] - [4] - [5] microscopie à conductance ionique à balayage basée sur des nanopipettes et microscopie à super-résolution [6].

David Klenerman
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Biographie
Naissance
Formation
Activités
Autres informations
A travaillé pour
Membre de
Directeur de thèse
Ian William Murison Smith (en)
Distinctions
MĂ©daille royale ()
Knight Bachelor ()
Membre de l'Academy of Medical Sciences (en)

Éducation

Klenerman fait ses études à l'Université de Cambridge où il est étudiant de premier cycle au Christ's College de Cambridge et obtient son baccalauréat en 1982 [7]. Il obtient son doctorat en chimie en 1986 en tant qu'étudiant de troisième cycle au Churchill College de Cambridge, supervisé par Ian William Murison Smith [7].

Carrière et recherche

Après son doctorat, Klenerman part à l'Université Stanford en tant que boursier Fulbright pour travailler sur la chimie des hautes harmoniques, avec Richard Zare. Après ses recherches postdoctorales à Stanford, il retourne au Royaume-Uni pour travailler chez BP Research pendant sept ans. Puis, en 1994, il rejoint l'Université de Cambridge, en tant que membre du corps professoral du Département de chimie et membre du Christ's College[7] - [8].

Klenerman, avec Shankar Balasubramanian, invente une méthode de Séquençage de l'ADN de nouvelle génération qui est communément connue aujourd'hui sous le nom de séquençage Solexa ou séquençage de colorant Illumina [3] - [5]. La méthode est basée sur la détection de nucléotides marqués par un fluorophore lorsqu'ils sont incorporés dans les brins d'ADN [9]. Cette méthode de séquençage par synthèse gagne en popularité [10] - [11] et est actuellement considérée comme la plate-forme la plus largement utilisée pour remplacer la technique de séquençage Sanger conventionnelle, malgré sa capacité de multiplexage relativement faible des échantillons, car elle offre plusieurs avantages clés : elle est automatisée, rapide, très précise, capable de séquencer plusieurs brins simultanément via un séquençage massif en parallèle, et économiquement moins chère en cas de séquençage du génome entier [12] - [13] - [14].

Il est également connu pour avoir exploré les méthodes de microscopie à conductance ionique à balayage à base de nanopipette (au lieu de micropipette conventionnelle) [15]. Son groupe de recherche réussit à obtenir des images topographiques à très haute résolution de cellules vivantes, en mode d'imagerie par sauts, à délivrer avec précision de petites molécules à la cellule et à étudier en temps réel le fonctionnement détaillé des cellules [16].

Plus récemment, son groupe se concentre sur la microscopie à super-résolution 3D pour développer de nouvelles connaissances sur le mauvais repliement des protéines et les maladies neurodégénératives [6].

Klenerman et Shankar Balasubramanian commercialisent leur invention sur le séquençage d'ADN à grande vitesse basé sur la fluorescence d'une seule molécule et fondent conjointement Solexa en 1998. Plus tard, en 2007, cette société est acquise par Illumina pour 600 millions de dollars [3].

En 2004, Klenerman cofonde une autre entreprise dérivée, Ionscope, pour fournir des microscopes à conductance ionique à balayage assemblés à la communauté des chercheurs qui recherchent des images 3D haute résolution de cellules vivantes. Selon le Conseil de recherche en biotechnologie et en sciences biologiques, en février 2014, Ionscope a vendu 35 unités SICM dans le monde [17].

Il reçoit en 2007 le prix interdisciplinaire RSC de la Royal Society of Chemistry. En 2008, il prononcée la conférence de la British Biophysical Society à l'University College de Dublin [18]. En 2012, il est élu Fellow de la Royal Society (FRS)[19] et en 2015, il est élu membre de l'Académie des sciences médicales (FMedSci)[20]. Il reçoit en 2018 la Médaille royale par la Royal Society [21]. Il est fait chevalier dans les honneurs du Nouvel An 2019 pour ses services à la science et le développement de la technologie de séquençage d'ADN à grande vitesse et remporte en 2020 le Millennium Technology Prize avec le professeur Sir Shankar Balasubramanian pour leur innovation du séquençage d'ADN de nouvelle génération et en 2021 remporte le prix Breakthrough 2022 en sciences de la vie avec le professeur Sir Shankar Balasubramanian et Pascal Mayer pour leur innovation du séquençage d'ADN de nouvelle génération [22].

Références
  1. « Professor David Klenerman FMedSci FRS », Department of Chemistry, University of Cambridge, University of Cambridge (consulté le )
  2. « Professor David Klenerman », Christ's College, Cambridge (consulté le )
  3. « History of Illumina Sequencing », Illumina (consulté le )
  4. Kevin Davies, The $1,000 Genome, Free Press, , 102–115 (ISBN 978-1416569596, lire en ligne Inscription nécessaire)
  5. Bentley, Balasubramanian et Swerdlow, « Accurate whole human genome sequencing using reversible terminator chemistry », Nature, vol. 456, no 7218,‎ , p. 53–59 (PMID 18987734, PMCID 2581791, DOI 10.1038/nature07517, Bibcode 2008Natur.456...53B)
  6. Hell, Sahl, Bates et Zhuang, « The 2015 super-resolution microscopy roadmap », Journal of Physics D, vol. 48, no 44,‎ , p. 443001 (DOI 10.1088/0022-3727/48/44/443001, Bibcode 2015JPhD...48R3001H, arXiv 1711.04999, S2CID 4804015)
  7. Anon, Who's Who (en) (online Oxford University Press), A & C Black (en), (DOI 10.1093/ww/9780199540884.013.266724, lire en ligne Accès payant), « Klenerman, Prof. David » Inscription nĂ©cessaire
  8. « David Klenerman elected FRS », Christ's College, Cambridge (consulté le )
  9. Balasubramanian, « Sequencing nucleic acids: from chemistry to medicine », Chemical Communications, vol. 47, no 26,‎ , p. 7281–7286 (PMID 21544287, PMCID 3428630, DOI 10.1039/c1cc11078k)
  10. Quail, « A large genome center's improvements to the Illumina sequencing system », Nature Methods, vol. 5, no 12,‎ , p. 1005–1010 (PMID 19034268, PMCID 2610436, DOI 10.1038/nmeth.1270)
  11. Cronn, « Multiplex sequencing of plant chloroplast genomes using Solexa sequencing-by-synthesis technology », Nucleic Acids Research, vol. 36, no 19,‎ , e122 (PMID 18753151, PMCID 2577356, DOI 10.1093/nar/gkn502)
  12. Metzker, « Sequencing technologies – the next generation », Nature Reviews Genetics, vol. 11, no 1,‎ , p. 31–46 (PMID 19997069, DOI 10.1038/nrg2626, S2CID 205484500, CiteSeerx 10.1.1.719.3885)
  13. Pettersson, Lundeberg et Ahmadian, « Generations of sequencing technologies », Genomics, vol. 93, no 2,‎ , p. 105–111 (PMID 18992322, DOI 10.1016/j.ygeno.2008.10.003)
  14. Quail, « A tale of three next generation sequencing platforms: comparison of Ion Torrent, Pacific Biosciences and Illumina MiSeq sequencers », BMC Genomics, vol. 13, no 341,‎ , p. 341 (PMID 22827831, PMCID 3431227, DOI 10.1186/1471-2164-13-341)
  15. Shevchuk, « Realizing the biological and biomedical potential of nanoscale imaging using a pipette probe », Nanomedicine, vol. 6, no 3,‎ , p. 565–575 (PMID 21542692, DOI 10.2217/nnm.10.154)
  16. Bergner, Vatsyayan et Matysik, « Recent advances in high resolution scanning electrochemical microscopy of living cells – A review », Analytica Chimica Acta, vol. 775,‎ , p. 1–13 (PMID 23601970, DOI 10.1016/j.aca.2012.12.042)
  17. « New microscope technology enables imaging of live cells », BBSRC (consulté le )
  18. « British Biophysical Society Lecture Tour », University College Dublin (consulté le )
  19. « David Klenerman: Royal Society », Fellows Directory, Royal Society (consulté le )
  20. « Fellow: Academy of Medical Sciences », Academy of Medical Sciences, United Kingdom (consulté le )
  21. Royal Medal 2018
  22. (en) « Breakthrough Prize – Winners Of The 2022 Breakthrough Prizes In Life Sciences, Fundamental Physics And Mathematics Announced », breakthroughprize.org (consulté le )

Liens externes
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