Chloroflexia
Chloroflexes
| Règne | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Chloroflexota |
- Chloroflexi Gupta et al. 2013
- Chlorobacteria Cavalier-Smith 2002
Les Chloroflexia (les Chloroflexes) sont une classe de bactéries filamenteuses photosynthétiques à Gram négatif de l'embranchement des Chloroflexota. Son nom provient de Chloroflexales qui est l'ordre type de cette classe.
Ils constituent l'essentiel des phototrophes anoxygeniques filamenteux (anciennement connus sous le nom des bactéries vertes non sulfureuses), même si certains sont classés séparément comme les Thermomicrobiota. Ils sont nommés ainsi pour leur pigment vert, le plus souvent trouvé dans les organites photosynthétiques appelés chlorosomes.
Les chloroflexes sont généralement filamenteux. Ils sont facultativement aérobies, mais ne produisent pas de dioxygène lors de la photosynthèse, contrairement par exemple aux cyanobactéries dont ils sont phylogénétiquement très éloignés. Ils ne peuvent pas non plus fixer biologiquement le dioxyde de carbone, ils sont donc photohétérotrophes. (à l’exception de Chloroflexus aurantiacus qui possède la voie métabolique du 3-Hydroxyproniate bi-cycle permettant la fixation du carbone inorganique en carbone organique[2])
Arbre phylogénétique de base des chloroflèxes
Cet arbre simplifié permet de naviguer directement vers les catégories les plus importantes. La classification phylogénétique détaillée du groupe considéré est stockée dans les catégories indiquées.
- Chloroflexi
- Herpetosiphonales
- Chloroflexales
- Chloroflexaceae
- Oscillochloridaceae
- Position dans l’arbre phylogénétique
- Bactérie
- Chlorobacteria
- Dehalococcoidetes
- Thermomicrobia
- Sphaerobacterales
- Thermomicrobiales
-
- Anaerolinaeles
- Chloroflexi
-
- Hadobacteria
-
- Cyanobacteria
-
- Gracilicutes
- Eurybacteria
- Chlorobacteria
Liste d'ordres
Selon la LPSN (2 décembre 2022)[3] :
- Chloroflexales Gupta et al. 2013 – ordre type
- Herpetosiphonales Gupta et al. 2013
- Kallotenuales Cole et al. 2013
Liens externes
- (en) Référence Tree of Life Web Project : Chloroflexi
- (en) Référence Catalogue of Life : Chloroflexi Garrity & Holt, 2002 (consulté le )
- (en) Référence NCBI : Chloroflexi (taxons inclus)
Bibliographie
- Euzéby, J.P. (1997). "List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature: a folder available on the Internet". Int J Syst Bacteriol 47 (2): 590-2. (ISSN 0020-7713). . http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/47/2/590.
- Hugenholtz P, Stackebrandt E (2004). "Reclassification of Sphaerobacter thermophilus from the subclass Sphaerobacteridae in the phylum Actinobacteria to the class Thermomicrobia (emended description) in the phylum Chloroflexi (emended description)". ""Int. J. Syst. Evol. Microbiol.
- Maymo-Gatell, X., Chien, Y., Gossett, J.M., and Zinder, S.H. "Isolation of a bacterium that reductively dechlorinates tetrachloroethene to ethene." Science (1997) 276:1568-1571.
- Moe, W.M., Yan, J., Nobre, M.F., da Costa, M.S., and Rainey, F.A. "Dehalogenimonas lykanthroporepellens gen. nov., sp. nov., a reductive dehalogenating bacterium isolated from chlorinated solvent-contaminated groundwater." Int. J. Syst. Evol. Microbiol. (in press)
Notes et références
- Gupta RS, Chander P & George S « Phylogenetic framework and molecular signatures for the class Chloroflexi and its different clades; proposal for division of the class Chloroflexia class. nov. [corrected] into the suborder Chloroflexineae subord. nov., consisting of the emended family Oscillochloridaceae and the family Chloroflexaceae fam. nov., and the suborder Roseiflexineae subord. nov., containing the family Roseiflexaceae fam. nov. » Antonie Van Leeuwenhoek 2013;103(1):99-119. https://doi.org/10.1007/s10482-012-9790-3
- Jan Zarzycki, Volker Brecht, Michael Müller et Georg Fuchs, « Identifying the missing steps of the autotrophic 3-hydroxypropionate CO2 fixation cycle in Chloroflexus aurantiacus », Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 106, no 50,‎ , p. 21317–21322 (PMID 19955419, PMCID PMC2795484, DOI 10.1073/pnas.0908356106, lire en ligne, consulté le )
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 2 décembre 2022