Thermomicrobia
Les Thermomicrobia sont une classe de bacilles Gram négatifs de l'embranchement des Thermomicrobiota. Son nom provient de Thermomicrobiales qui est l'ordre type de cette classe. Ce sont des bactéries extrémophiles thermophiles semblable aux Chloroflexia par le phénotype (bactéries vertes non sulfureuses), mais distinctes sur le plan phylogénétique.
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Taxonomie
Étymologie
L'étymologie de la classe Thermomicrobia est la suivante : Ther.mo.mi.cro’bi.a N.L. neut. n. Thermomicrobium, Genre type de l'ordre type de la classe; N.L. neut. pl. n. Thermomicrobia[2].
Nomenclature
Cette classe est proposée en 2001 par G.M. Garrity et J.G . Holt dans la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology[1]. Elle est validée l'année suivante par une publication dans l'IJSEM[3].
En 2004 P. Hugenholtz et E. Stackebrandt proposent de rattacher cette classe, non pas à l'embranchement alors nommé lui aussi « Thermomicrobia », mais à un sous-embranchement de l'embranchement des « Chloroflexi » (depuis renommé en Chloroflexota)[4]. Par la suite, en 2021, ce taxon a été élevé au rang d'embranchement à part entière sous le nom de Thermomicrobiota[5].
Liste des ordres
Selon LPSN (2 décembre 2022)[6] :
- Sphaerobacterales Stackebrandt et al. 1997
- Thermomicrobiales Garrity & Holt 2002 – ordre type
Notes et références
- Garrity GM & Holt JG « Class I. Thermomicrobia class. nov. » In: Boone DR, Castenholz RW, Garrity GM (eds) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2ème édition, vol. 1 (The Archaea and the Deeply Branching and Phototrophic Bacteria). Springer, New York, 2001. https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-0-387-21609-6_24
- (en) « Class Thermomicrobia », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le )
- Anonyme « Validation list no. 85. List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published » Int J Syst Evol Microbiol. 2002;52(3):685-690. Accès libre.
- (en) Hugenholtz P, Stackebrandt E, « Reclassification of Sphaerobacter thermophilus from the subclass Sphaerobacteridae in the phylum Actinobacteria to the class Thermomicrobia (emended description) in the phylum Chloroflexi (emended description) », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 54, no Pt 6,‎ , p. 2049–51 (PMID 15545432, DOI 10.1099/ijs.0.03028-0)
- Oren A & Garrity GM « Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes » Int J Syst Evol Microbiol. 2021;71(10):005056. Accès libre.
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 2 décembre 2022
Liens externes
- (en) Référence Tree of Life Web Project : Thermomicrobia
- (en) Référence Catalogue of Life : Thermomicrobia Garrity & Holt, 2001 (consulté le )
- (en) Référence NCBI : Thermomicrobia (taxons inclus)