Aquifex
Aquifex est un genre de bactéries, l'un des rares qui appartiennent à l'embranchement des Aquificota. Les deux espèces classées dans ce genre sont A. pyrophilus (en) et A. aeolicus (en). Elles sont toutes deux hyperthermophiles, se développant au mieux à des températures variant de 85 à 95 °C. Ce sont de véritables bactéries, par opposition aux autres habitants d'environnements extrêmes, les archées[1].
| Règne | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Aquificota |
| Classe | Aquificae |
| Ordre | Aquificales |
| Famille | Aquificaceae |
Les deux espèces connues d'Aquifex sont des bacilles d'une longueur de 2 à 6 µm et d'un diamètre d'environ 0,5 µm. Ce sont des organismes autotrophes à Gram négatif non sporulantes. Aquifex signifie « qui fait de l'eau » en latin et évoque le fait que sa méthode de respiration crée de l'eau. Aquifex tend à former des agrégats qui peuvent compter jusqu'à 100 cellules.
Étant hyperthermophyle, Aquifex croît souvent près de volcans sous-marins ou de sources chaudes[2]. A. aeolicus a besoin d'oxygène pour survivre, mais peut croître dans des milieux où la teneur en oxygène n'est que de 7,5 ppm. A. pyrophilus peut même croître en anaérobie en réduisant l'azote plutôt que l'oxygène. Comme les autres bactéries thermophiles, Aquifex a d'importants usages dans l'industrie.
Le génome d'A. aeolicus a été cartographié avec succès[3] - [4]. Cette cartographie a été facilitée par le fait que la longueur du génome ne mesure que le tiers de celle du génome d'E. coli. La comparaison du génome d'A. aeolicus avec celui d'autres organismes montre qu'environ 16 % de ses gènes proviennent du domaine des archées. Les membres de ce genre passent pour être certains des premiers membres du domaine des eubactéries.
A. aeolicus a été découvert au nord de la Sicile, tandis qu'A. pyrophilus a d'abord été trouvé juste au nord de l'Islande.
Liste d'espèces
Selon la LPSN (10 novembre 2022)[5] :
- Aquifex pyrophilus Huber & Stetter 2001 est la seule espèce validement publiée, c'est donc également l'espèce type du genre
- Aquifex aeolicus est une espèce en attente de publication valide
Notes et références
- (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « Aquifex » (voir la liste des auteurs).
- (en) Anna-Louise Reysenbach, « Aquificae phy. nov. », dans DR Boone DR et RW Castenholz, Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, Berlin, Springer-Verlag, , 2e éd. (ISBN 0-683-00603-7), p. 359–367.
- M. Madigan (dir.) et J. Martinko (dir.), Brock Biology of Microorganisms, Prentice Hall, , 11e Ă©d. (ISBN 978-0-13-144329-7).
- G Deckert et al., « The complete genome of the hyperthermophilic bacterium Aquifex aeolicus. », Nature, vol. 392, no 6674,‎ , p. 353–358 (PMID 9537320, DOI 10.1038/32831).
- (en) « Aquifex aeolicus VF5 Genome Page », sur J. Craig Venter Institute (consulté le ).
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 10 novembre 2022
Références taxinomiques
- (en) Référence Catalogue of Life : Aquifex Huber & Stetter, 1992 (consulté le )
- (en) Référence NCBI : Aquifex (taxons inclus) (consulté le )
- (en) Référence Tree of Life Web Project : Aquifex (consulté le )
- (en) Référence uBio : site déclaré ici indisponible le 7 avril 2023
- (en) Référence World Register of Marine Species : taxon Aquifex Huber, Wilharm, Huber, Trincone, Burggraf, Konig, Rachel, Rockinger, Fricke & Stetter, 1992 (+ liste espèces) (consulté le )
Liens externes
- (en) « Aquifex », sur MicrobeWiki.
- The Prokaryotes: An Evolving Electronic Resource for the Mircobiological Community, 2004, Springer-Verlag, New York, LLC.