Symbiobacterium ostreiconchae
Symbiobacterium ostreiconchae est une bactérie thermophile de coloration de gram négative mais dont la paroi cellulaire est typique des bactéries à Gram-positif.
| Règne | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Bacillota |
| Classe | Clostridia |
| Ordre | Eubacteriales |
| Famille | Symbiobacteriaceae |
| Genre | Symbiobacterium |
Historique
C'est le long des côtes du Pacifique au niveau d'Eno-shima (Japon), que la souche KY38, devenue souche type de l'espèce Symbiobacterium ostreiconchae, a été isolée d'une huître[2]. Cette espèce a été décrite en même temps que les espèces S. turbinis et S. terraclitae[3].
Taxonomie
Étymologie
L'étymologie de cette espèce Symbiobacterium ostreiconchae est la suivante : os.tre’i.con’chae. L. fem. n. ostrea, huître; L. fem. n. concha, une coquille; N.L. gen. fem. n. ostreiconchae car la souche type de cette espèce a été isolée d'une coquille d'huître[4] - [5]. Le nouveau nom a été validé également en 2015 par l'ICSP et publié dans le journal IJSEM[6].
Phylogénie
Les analyses phylogénétiques des séquences de l'ARNr 16S de la souche KY38 ont démontré que cette bactérie appartient bien au genre Symbiobacterium[7]. La séquence de cette souche est identique à 97,8 % de celle de Symbiobacterium thermophilum[7]. Le groupe de bactéries des Symbiobacterium représente un cluster au sein de l'ordre Clostridiales mais distinct des autres familles[7].
Références
- Shiratori-Takano et at al. 2014, p. 3380.
- Shiratori-Takano et at al. 2014, p. 3376.
- Shiratori-Takano et at al. 2014, p. 3375.
- Shiratori-Takano et at al. 2014, p. 3381.
- (en) « Species Symbiobacterium ostreiconchae », sur LPSN,
- (en) Aharon Oren et George M. Garrity, « Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 64, part 10, of the IJSEM », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 65, no 1,‎ , p. 5-6 (DOI 10.1099/ijs.0.000005-0)
- Shiratori-Takano et at al. 2014, p. 3379.
Bibliographie
- (en) Michiyo Ohno, Hatsumi Shiratori, Mie-Jun Park, Yoko Saitoh, Yasuyuki Kumon, Naoko Yamashita, Aiko Hirata, Hiromi Nishida, Kenji Ueda et Teruhiko Beppu, « Symbiobacterium thermophilum gen. nov., sp. nov., a symbiotic thermophile that depends on co-culture with a Bacillus strain for growth », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 50, no 5,‎ , p. 1829–1832 (ISSN 1466-5026, PMID 11034494, DOI 10.1099/00207713-50-5-1829, lire en ligne, consulté le )
- (en) Hatsumi Shiratori-Takano, Kae Akita, Kazune Yamada, Takashi Itoh, Takafumi Sugihara, Teruhiko Beppu et Kenji Ueda, « Description of Symbiobacterium ostreiconchae sp. nov., Symbiobacterium turbinis sp. nov. and Symbiobacterium terraclitae sp. nov., isolated from shellfish, emended description of the genus Symbiobacterium and proposal of Symbiobacteriaceae fam. nov. », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 64,‎ , p. 3375-3383 (DOI 10.1099/ijs.0.063750-0).
Liens externes
- Ressources relatives au vivant :