SATB1
La protéine 1 de liaison aux séquences riches en AT (en anglais special AT-rich sequence-binding protein-1, SATB1) est une protéine codée chez l'humain par le gène SATB1[1].
| SATB1 | ||
 Structure tridimensionnelle de la protéine SATB1 | ||
| Caractéristiques générales | ||
|---|---|---|
| Symbole | SATB1 | |
| Synonymes | GTF2D, GTF2D1 | |
| Locus | 3p24.3 | |
Fonction
SATB1 est un facteur de transcription et un organisateur global de la chromatine, qui a émergé comme un facteur clef dans l'intégration de l'architecture de la chromatine par l'intermédiaire de régulation de l'expression génique[2]. Des études récentes ont révélé le rôle de SATB1 dans l'organisation de la chromatine loopscape et sa nature dynamique en réponse à des stimulations physiologiques[3]. À niveau du génome, SATB1 semble jouer un rôle important dans l'organisation de la chromatine transcriptionnellement active. SATB1 organise le locus du CMH-I en diverses boucles de la chromatine, moyennant le recrutement de MARs à la matrice nucléaire à une distance fixe. Le silençage de SATB1 mime les effets du traitement avec l'interféron gamma dans l'architecture de la chromatine du locus du CMH-I, et altère l'expression de gènes à l'intérieur de ce locus. SATB1 aussi semble induire le cancer du sein et métastases en raison de l'altération de l'expression de nombreux gènes.
Interactions
La protéine SATB1 a démontré être capable d'interagir avec:
Notes et références
- « Entrez Gene: SATB1 SATB homeobox 1 »
- K. Pavan, P. umar, P. K. Purbey, C. K. Sinha, D. Notani, A. Limaye, R. S. Jayani et S. Galande, « Phosphorylation of SATB1, a global gene regulator, acts as a molecular switch regulating its transcriptional activity in vivo », Molecular Cell, vol. 22, no 2,‎ , p. 231–43 (PMID 16630892, DOI 10.1016/j.molcel.2006.03.010)
- S. Galande, P. K. Purbey, D. Notani et P. P. Kumar, « The third dimension of gene regulation: organization of dynamic chromatin loopscape by SATB1 », Current Opinion in Genetics & Development, vol. 17, no 5,‎ , p. 408–14 (PMID 17913490, DOI 10.1016/j.gde.2007.08.003)
- D. Yasui, M. Miyano, S. Cai, P. Varga-Weisz et T. Kohwi-Shigematsu, « SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances », Nature, vol. 419, no 6907,‎ , p. 641–5 (PMID 12374985, DOI 10.1038/nature01084)
- J. Liu, A. Barnett, E. J. Neufeld et J. P. Dudley, « Homeoproteins CDP and SATB1 interact: potential for tissue-specific regulation », Molecular and Cellular Biology, vol. 19, no 7,‎ , p. 4918–26 (PMID 10373541, PMCID 84297, DOI 10.1128/mcb.19.7.4918)
- L. K. Durrin et T. G. Krontiris, « The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11 », Genomics, vol. 79, no 6,‎ , p. 809–17 (PMID 12036295, DOI 10.1006/geno.2002.6772)
Liens externes
- www.uniprot.org : fiche de la protéine SATB1 sur la banque de données UniProt.
- Ressources relatives à la santé :