Sulfuricaulis limicola
Sulfuricaulis limicola est l'espèce type du genre bactérien Sulfuricaulis. Ce sont des bacilles à Gram négatif capables d'oxyder le soufre et qui ont été isolés au Japon. Cette espèce est assignée à la famille Acidiferrobacteraceae de l'embranchement des Pseudomonadota.
| Règne | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Pseudomonadota |
| Classe | Gammaproteobacteria |
| Ordre | Acidiferrobacterales |
| Famille | Acidiferrobacteraceae |
| Genre | Sulfuricaulis |
Taxonomie
Étymologie
L'étymologie de l'espèce Sulfuricaulis limicola est la suivante : li.mi’co.la L. masc. n. limus, boue; L. masc./fem. n. suff. -cola, habitant; du L. masc./fem. n. incola, habitant; N.L. masc./fem. n. limicola, habitant la boue[1] - [2].
Historique
L'espèce Sulfuricaulis limicola a été décrite en même temps que son genre Sulfuricaulis en , à partir d'une souche de bactérienne isolé d'un lac au Japon[1]. L'étude phylogénique de cette souche sur la base de l'ARN ribosomal 16S a positionné cette souche proche de l'espèce Sulfurifustis variabilis décrite un an auparavant. Le genre Sulfuricaulis et son espèce type Sulfuricaulis limicola ont donc été assignés à la famille Acidiferrobacteraceae et à l'ordre Acidiferrobacterales dans lesquels figuraient déjà Sulfurifustis et Acidiferrobacter[3] - [4].
Description
Lors de sa description de , l'espèce Sulfuricaulis limicola comprend des bactéries gram négatives[1]. Ce sont des bacilles mobiles de 0,3 à 0,5 µm de diamètre pour une longueur de 1,2 à 6,0 μm[1]. Le contenu en bases GC est d'environ 63%. Les bactéries peuvent croître entre 8 °C et 37 °C et étant optimale entre 28 °C et 32 °C[1]. La croissance est possible dans une gamme de pH située entre 6,1 et 9,2 et dans un milieu sans NaCl[1].
La souche type de cette espèce est la souche HA5 déposée dans des banques de cultures bactériennes sous les numéros DSM 100373 et NBRC 110752[1] - [2].
Gènes séquencés
Lors de sa description, 3 gènes ont été séquencés : ARNr 16S, cbbL et aprA[1].
Habitat
La souche type HA5 de cette espèce a été isolée des sédiments du lac Harutori (ja) au Japon[1]. Des séquences nucléotidiques de clones de souches non cultivées et isolées de sédiments légèrement alcalins d'un réservoir eutrophe en Chine[1].
Notes et références
- (en) Hisaya Kojima, Tomohiro Watanabe et Manabu Fukui, « Sulfuricaulis limicola gen. nov., sp. nov., a sulfur oxidizer isolated from a lake », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 66, no 1, , p. 266-270 (DOI 10.1099/ijsem.0.000709)
- (en) « Species Sulfuricaulis limicola », sur LPSN,
- (en) Kevin B. Hallberg, Sabrina Hedrich et D. Barrie Johnson, « Acidiferrobacter thiooxydans, gen. nov. sp. nov.; an acidophilic, thermo-tolerant, facultatively anaerobic iron- and sulfur-oxidizer of the family Ectothiorhodospiraceae », Extremophiles, vol. 15, , p. 271–279 (DOI 10.1007/s00792-011-0359-2)
- (en) Hisaya Kojima, Arisa Shinohara et Manabu Fukui, « Sulfurifustis variabilis gen. nov., sp. nov., a sulfur oxidizer isolated from a lake, and proposal of Acidiferrobacteraceae fam. nov. and Acidiferrobacterales ord. nov. », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 65, no 10, , p. 3709-3713 (DOI 10.1099/ijsem.0.000479)
Liens externes
- Ressources relatives au vivant :