Séquence répétée

Chez l'homme, les séquences répétées représentent 50 % du génome. Dans les séquences d'ADN hautement répétitives, on distingue principalement trois types de séquences répétées :

Séquences localisées répétées en tandem :
ADN satellites : répété environ 5 000 fois, et se trouvent au niveau des centromères, il en existe différentes catégories.
- Séquences microsatellites : des séquences d'une à cinq paires de bases sont répétées un grand nombre de fois, répétitions longues de plusieurs kilobases (Kb), il y a plus de 10 000 zones de répétition dans le génome.
- Séquences minisatellites : des séquences de quinze à vingt-cinq paires de bases (pb) sont répétées un grand nombre de fois (mille à deux mille fois) . Ils sont télomériques, très polymorphes.
- Grands blocs d'ADN satellite (environ 10 % du génome humain) : blocs allant jusqu'à une dizaine de mégabases, localisés très majoritairement au niveau des centromères et télomères. Il y a des possibilités d'erreurs lors de l'ajout des séquences monotones.

Les tranposons : constituent des séquences répétées dispersées. Ils sont répartis sur l'ensemble du génome :
- Les rétrotransposons :
  - Petits éléments nucléaires intercalés (SINE) : leur taille varie entre 130 et 500 pb, les plus abondantes chez l'homme sont les séquences ALU.
  - Longs éléments nucléaires intercalés (LINE) : leur taille est de quelques kilobases ou plus précisément 6 000 à 7 000 pb. Ils constituent 17 % du génome humain. Les éléments LINE-1 ou L1 sont toujours actifs chez l'homme.
  - Les rétrotransposons à séquences terminales longues répétées (LTR), présents en très grand nombre (~ 400 000 copies), ils peuvent provenir de rétrovirus.
- Les transposons à ADN
  - transposons à ADN : ils représentent environ 300 000 copies et sont issus de la transposition de certains gènes d'une partie d'un chromosome, voire d'un chromosome complètement différent, vers une autre partie du génome.

Séquence répétée

Notes et références

Voir aussi

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