Parabacteroides merdae
Parabacteroides merdae est une bactérie à Gram négatif du genre Parabacteroides et fait partie de l'ordre des Bacteroidales et de l'embranchement des Bacteroidota.
| Règne | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Bacteroidota |
| Classe | Bacteroidia |
| Ordre | Bacteroidales |
| Famille | Tannerellaceae |
| Genre | Parabacteroides |
Historique
L'espèce Parabacteroides merdae a été décrite en sous le nom de Bacteroides merdae[1]. Cette espèce a été reclassée en dans un nouveau genre et renommée comme Parabacteroides merdae à la suite de l'analyse de sa séquence de l'ARNr 16S[2].
Taxonomie
Étymologie
L'étymologie de l'espèce Parabacteroides merdae est la suivante : mer’dae L. gen. fem. n. merdae, des selles, nommée ainsi pour faire référence au lieu d'isolement de cette bactérie[3] - [4] - [5].
Classification Phylogénique
Décrite comme une Bacteroides en , l'espèce nommée alors Bacteroides merdae a toutefois une similarité de séquence de l'ARNr 16S de plus de 92,3 % avec Bacteroides distasonis et B. goldsteinii formant un clade monophylétique proche de Tannerella forsythensis[6]. La comparaison nucléotidique montre une similarité moins importante avec les genres Bacteroides, Dysgonomonas, Paludibacter et Porphyromonas[7]. Le clade monophylétique comprenant les trois espèces de Parabacteroides est phylogénétiquement relié aux Tannerella puis aux Porphyromonas[7] et est inclus dans la famille des Tannerellaceae, l'ordre des Bacteroidales, la classe des Bacteroidia et dans le phylum Bacteroidota[5].
Description
Parabacteroides merdae est une bactérie à Gram négatif en forme de bacille et anaérobie strict. C'est une bactérie négative pour les tests catalase et uréase[3].
Habitat
La souche type de Parabacteroides merdae a été isolée de selles humaines[3].
Notes et références
- Johnson, Moore et Moore 1986, p. 499.
- Sakamoto et Benno 2006, p. 1599.
- Sakamoto et Benno 2006, p. 1604.
- (en) « Species Bacteroides merdae », sur LPSN,
- (en) « Species Parabacteroides merdae », sur LPSN,
- Sakamoto et Benno 2006, p. 1600.
- Sakamoto et Benno 2006, p. 1601.
Bibliographie
- (en) JL Johnson, WEC Moore et LVH Moore, « Bacteroides caccae sp. nov., Bacteroides merdae sp. nov., and Bacteroides stercoris sp. nov. isolated from human feces. », Int. J. Syst. Bacteriol., vol. 36, no 4,‎ , p. 499-501 (DOI 10.1099/00207713-36-4-499)
- (en) Mitsuo Sakamoto et Yoshimi Benno, « Reclassification of Bacteroides distasonis, Bacteroides goldsteinii and Bacteroides merdae as Parabacteroides distasonis gen. nov., comb. nov., Parabacteroides goldsteinii comb. nov. and Parabacteroides merdae comb. nov. », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 56, no 7,‎ , p. 1599-1605 (DOI 10.1099/ijs.0.64192-0)
- (en) Arnold H. Eggerth et Bernard H. Gagnon, « The Bacteroides of Human Feces. », J Bacteriol, vol. 25,‎ , p. 389-413 (DOI 10.1128/jb.25.4.389-413.1933)
Liens externes
- Ressources relatives au vivant :