Tannerellaceae
Tannerellaceae est une famille de bactéries à Gram négatif qui ont été séparées de la famille Porphyromonadaceae. Cette famille fait partie de l'ordre des Bacteroidales et du phylum Bacteroidota.
| Règne | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Bacteroidota |
| Classe | Bacteroidia |
| Ordre | Bacteroidales |
Genres de rang inférieur
- Parabacteroides
- Tannerella, genre type
Historique
La création du genre Parabacteroides à partir du groupe de bactéries dites «groupe Bacteroides fragilis» résistantes à la bile a montré que ces bactéries sont plus proche phylogénétiquement des Tannerella que des Bacteroides où elles étaient initialement identifiées ou même des Porphyromonas[3]. D'abord classées parmi les Porphyromonadaceae, des analyses ultérieures ont abouti à la création d'une nouvelle famille nommée Tannerellaceae[1].
Taxonomie
Étymologie
L'étymologie du genre Tannerellaceae est la suivante : Tannerella, un genre de bactérie, -aceae suffixe pour nommer une famille, N.L. fem. pl. n. Tannerellaceae, ce qui signifie : la famille des Tannerella[1] - [4].
Classification Phylogénique
L'analyse phylogénétique de bactéries du groupe résistant à la bile identifiées comme des Bacteroides a présenté une similarité de séquence de l'ARNr 16S avec l'espèce Tannerella forsythensis de près de 90% contre seulement 82% (environ) avec les autres espèces de Bacteroides et environ 84% avec un groupe de Porphyromonas[3]. Elle a positionné les trois espèces de ce nouveau genre Parabacteroides dans un même clade plus proche des genres Tannerella et Porphyromonas que de Bacteroides[5] ce qui a conduit le Bergey's Manual à les classer à partir de dans celle des Porphyromonadaceae[6]. En , les Parabacteroides et les Tannerella sont reclassées dans la famille des Tannerellaceae nouvellement créée et incluses dans l'ordre des Bacteroidales[7], la classe des Bacteroidia et dans le phylum Bacteroidota[4]. CE déplcement des deux genres bactériens et le nouveau nom de Famille a été validé en par l'International Committee on Systematics of Prokaryotes[2].
Notes et références
- Ormerod et et al. 2016, p. 12.
- (en) A Oren et George M. Garrity, « Validation list no. 206. List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published. », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 72,‎ , p. 5422 (DOI 10.1099/ijsem.0.005422)
- Sakamoto et Benno 2006, p. 1599.
- (en) « Family Tannerellaceae », sur LPSN,
- Sakamoto et Benno 2006, p. 1601.
- Krieg 2010, p. 61.
- Ormerod et et al. 2016, p. 36.
Bibliographie
- (en) Mitsuo Sakamoto et Yoshimi Benno, « Reclassification of Bacteroides distasonis, Bacteroides goldsteinii and Bacteroides merdae as Parabacteroides distasonis gen. nov., comb. nov., Parabacteroides goldsteinii comb. nov. and Parabacteroides merdae comb. nov. », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 56, no 7,‎ , p. 1599-1605 (DOI 10.1099/ijs.0.64192-0)
- (en) Arnold H. Eggerth et Bernard H. Gagnon, « The Bacteroides of Human Feces. », J Bacteriol, vol. 25,‎ , p. 389-413 (DOI 10.1128/jb.25.4.389-413.1933)
- (en) Noel R. Krieg, « Family IV. Porphyromonadaceae fam. nov. », dans Krieg NR, Staley JT, Brown DR, Hedlund BP, Paster BJ, Ward NL, Ludwig W, Whitman WB (eds), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol. 4, New York, Springer, , 2nd edn éd. (DOI 10.1007/978-0-387-68572-4), p. 61
- (en) KL Ormerod, DL Wood, N Lachner, SL Gellatly, JN Daly, JD Parsons, CG Dal'Molin, RW Palfreyman, LK Nielsen, MA Cooper, Mark Morrison, Philip M. Hansbro et Philip Hugenholtz, « Genomic characterization of the uncultured Bacteroidales family S24-7 inhabiting the guts of homeothermic animals », Microbiome, vol. 4,‎ , p. 36 (DOI 10.1186/s40168-016-0181-2)