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Nir Friedman

Nir Friedman (né en 1967) est un professeur d'informatique et de biologie à l'université hébraïque de Jérusalem[1] - [2].

Nir Friedman
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Biographie
Naissance
Formation
Activités
Autres informations
A travaillé pour
Domaine
Apprentissage automatique et biologie computationnelle
Directeur de thèse
Élève notable
Dana Pe'er (en)
Site web
Distinctions

Ses recherches portent sur la combinaison de l'apprentissage automatique et l'apprentissage statistique avec la biologie des systèmes, tout particulièrement dans les domaines de la régulation de l'expression des gènes, la transcription et la chromatine.

Formation et recherche

Friedman obtient un B. Sc. à l'université de Tel Aviv en 1987 et un M. Sc. à l'Institut Weizmann en 1992[3]. En 1997, il obtient un Ph. D. à l'université Stanford sous la supervision de Joseph Y. Halpern, dns le domaine de l'intelligence artificielle[4] (titre de la thèse : « Modeling Beliefs in Dynamic Systems »[5]).

Il est ensuite chercheur postdoctoral à l'université de Californie à Berkeley, puis rejoint la School of Computer Science[6], de l'université hébraïque de Jérusalem, comme professeur associé d'abord, puis comme professeur.

Ses recherches[7] - [8] comprennent des travaux sur des classificateurs de réseaux bayésiens[9] (avec Danny Geiger et Moises Goldszmid), la maximisation bayésienne structurelle en moyenne (expectation maximization)[10], et l'usage de méthodes bayésiennes pour l’analyse de données pour l'expression génétique[11] - [12] - [13] - [14] (avec Aviv Regev (en), Dana Pe'er (en), Eran Segal (en), Daphne Koller et David Botstein). Plus récemment, il s'est concentré sur le modèle graphique probabiliste, la reconstruction de réseaux de régulation de gènes, l'épistasie et le rôle de la chromatine dans la régulation de la transcription (avec Oliver Rando)[15].

En 2009, Friedman et Koller publient un ouvrage sur les modèles graphiques probabilistes[16]. Cette même année, il devient également professeur à l'Institute of Life Sciences[17] et ouvre un laboratoire expérimental utilisant des outils robotiques pour étudier la régulation de la transcription du levain saccharomyces cerevisiae[18].

Prix et distinctions

Nir Friedman est distinguished fellow 2014 de l'ISCB (International society of computational biology)[19]. Il est lauréat du Michael Bruno Memorial Award (2010)[20], et il a bénéfié d'une bourse du Conseil européen de la recherche (2009–2014) ; il a également obtenu le prix Juludan (2007),et une bourse de la fondation Sir Zelman Cowen Universities Fund (2007)[21]

Notes et références
(en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « Nir Friedman » (voir la liste des auteurs).
  1. « Nir Friedman », sur Cs.huji.ac.il (consulté le ).
  2. « Nir Friedman's Lab », sur Systemsbio.cs.huji.ac.il (consulté le ).
  3. « Curriculum Vitae—Nir Friedman », sur Cs.huji.ac.il (consulté le ).
  4. « Copie archivée de la thèse » (version du 25 avril 2012 sur Internet Archive)
  5. (en) « Nir Friedman », sur le site du Mathematics Genealogy Project
  6. « The Rachel and Selim Benin School of Computer Science and Engineering », sur Cs.huji.ac.il (consulté le )
  7. « Nir Friedman - Google Scholar », sur Scholar.google.com (consulté le )
  8. N. Friedman sur PubMedAuthorSearch.
  9. « Bayesian network classifiers », sur Cs.huji.ac.il (consulté le )
  10. « The Bayesian structural EM algorithm », sur Cs.huji.ac.il (consulté le )
  11. N. Friedman, M. Linial, I. Nachman et D. Pe'er, « Using Bayesian Networks to Analyze Expression Data », Journal of Computational Biology, vol. 7, nos 3–4,‎ , p. 601–620 (PMID 11108481, DOI 10.1089/106652700750050961, CiteSeerx 10.1.1.191.139)
  12. E. Segal, M. Shapira, A. Regev, D. Pe'er, D. Botstein, D. Koller et N. Friedman, « Module networks: Identifying regulatory modules and their condition-specific regulators from gene expression data », Nature Genetics, vol. 34, no 2,‎ , p. 166–176 (PMID 12740579, DOI 10.1038/ng1165)
  13. N. Friedman, « Inferring Cellular Networks Using Probabilistic Graphical Models », Science, vol. 303, no 5659,‎ , p. 799–805 (PMID 14764868, DOI 10.1126/science.1094068)
  14. E. Segal, N. Friedman, D. Koller et A. Regev, « A module map showing conditional activity of expression modules in cancer », Nature Genetics, vol. 36, no 10,‎ , p. 1090–1098 (PMID 15448693, PMCID 2271138, DOI 10.1038/ng1434)
  15. « Nir Friedman (publications) », sur Cs.huji.ac.il (consulté le )
  16. Nir Friedman et Daphne Koller, Probabilistic Graphical Models : Principles and Techniques, MIT Press, , 1231 p. (ISBN 978-0-262-01319-2, lire en ligne).
  17. « The Alexander Silberman Institute of Life Sciences », sur Bio.huji.ac.il (consulté le ).
  18. « Robotic Facility », sur Systemsbio.cs.huji.ac.il (consulté le )
  19. Liste des fellows de l'ISCB.
  20. « Nir Friedman - Yad Hanadiv », sur Yadhanadiv.org.il (consulté le )
  21. « Young HU biologist wins Australian award », The Jerusalem Post - JPost.com (consulté le ).

Liens externes
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