Lactobacillaceae
Les Lactobacillaceae sont une famille de bactéries de l'ordre des Lactobacillales.
Lactobacillus est le genre type. Il est composé de bactéries présentes dans les produits laitiers (fromages, yaourts), la viande, le poisson, les céréales, l'eau, les égouts, la bière, le vin, les fruits et jus de fruit, les légumes, les sauces et plats cuisinés. Ils constituent une partie du microbiote de la bouche, de l'intestin et du vagin de plusieurs animaux (y compris l'humain). Ils ne sont pathogènes que dans le cas des caries dentaires[2] - [3].
Caractéristiques microbiologiques
Les Lactobacillaceae ont une morphologie variée : bacilles longs et fins, coccobacilles évoquant les corynebacterium ou coques[4]. Généralement, ils se regroupent en chaînes sauf pour les Pediococcus qui se groupent par deux ou quatre.
- Gram positif
- non sporulé
- oxydase négatif
- catalase négatif (absence de l'enzyme catalase capable de décomposer l'eau oxygénée)
- aéro-anaérobie ou anaérobie
- métabolisme fermentatif conduisant à la formation d'acide lactique
- exigences nutritionnelles complexes nécessitant des acides aminés, des peptides, des dérivés d'acides nucléiques, des vitamines, des sels minéraux, des acides gras, des esters d'acides gras et des sucres fermentescibles.
Phylogénie
La taxonomie actuellement acceptée est basée sur la List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature[5] et la phylogénie sur le séquençage du génome entier[6].
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Liste des genres
La famille des Lactobacillaceae est circonscrite sur la base des analyses phylogénétiques déduites de l'étude des séquences des ARNr 16S.
- Acetilactobacillus Zheng et al. 2020
- Agrilactobacillus Zheng et al. 2020
- Amylolactobacillus Zheng et al. 2020
- Apilactobacillus Zheng et al. 2020
- Bombilactobacillus Zheng et al. 2020
- Companilactobacillus Zheng et al. 2020
- Convivina Praet et al. 2015
- Dellaglioa Zheng et al. 2020
- Fructilactobacillus Zheng et al. 2020
- Fructobacillus Endo and Okada 2008
- Furfurilactobacillus Zheng et al. 2020
- Holzapfelia Zheng et al. 2020
- Lacticaseibacillus Zheng et al. 2020
- Lactiplantibacillus Zheng et al. 2020
- Lactobacillus Beijerinck 1901 (approuvé en 1980)
- Lapidilactobacillus Zheng et al. 2020
- Latilactobacillus Zheng et al. 2020
- Lentilactobacillus Zheng et al. 2020
- Leuconostoc van Tieghem 1878 (approuvé en 1980)
- Levilactobacillus Zheng et al. 2020
- Ligilactobacillus Zheng et al. 2020
- Limosilactobacillus Zheng et al. 2020
- Liquorilactobacillus Zheng et al. 2020
- Loigolactobacillus Zheng et al. 2020
- Oenococcus Dicks et al. 1995
- Paralactobacillus Leisner et al. 2000
- Paucilactobacillus Zheng et al. 2020
- Pediococcus Claussen 1903 (approuvé en 1980)
- Schleiferilactobacillus Zheng et al. 2020
- Secundilactobacillus Zheng et al. 2020
- Weissella Collins et al. 1994
Notes et références
- (en) C.-E. A. Winslow, Jean Broadhurst, Robert Earle Buchanan, Charles Krumwiede Jr., Lore Alford Rogers et George A. Smith, « The Families and Genera of the Bacteria: Preliminary Report of the Committee of the Society of American Bacteriologists on Characterization and Classification of Bacterial Types », Journal of Bacteriology, vol. 2, no 5,‎ , p. 505–566 (ISSN 0021-9193 et 1098-5530, DOI 10.1128/JB.2.5.505-566.1917, lire en ligne, consulté le )
- Garcia
- (en) David R. Boone, George M. Garrity, Richard W. Castenholz, Don J. Brenner, Noel R. Krieg et James T. Staley, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: The Firmicutes, Springer, (ISBN 0387684891)
- Euzéby
- Euzéby JP, Parte AC, « Lactobacillaceae », List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) (consulté le )
- Zheng J, Wittouck S, Salvetti E, ((Franz CMAP)), ((Harris HMB)), Mattarelli P, O'Toole PW, Pot B, Vandamme P, Walter J, Watanabe K, Wuyts S, Felis GE, Gänzle MG, ((Lebeer S.)), « A taxonomic note on the genus Lactobacillus: Description of 23 novel genera, emended description of the genus Lactobacillus Beijerinck 1901, and union of Lactobacillaceae and Leuconostocaceae », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 70, no 4,‎ , p. 2782–2858 (PMID 32293557, DOI 10.1099/ijsem.0.004107
) - NCBI, consulté le 7 avril 2021
Références biologiques
- (fr+en) Référence EOL : Lactobacillaceae (consulté le )
- (fr+en) Référence GBIF : Lactobacillaceae (consulté le )
- (en) Référence IRMNG : Lactobacillaceae Winslow & al. 1917 (consulté le )
- (fr+en) Référence ITIS : Lactobacillaceae Winslow & al., 1917 (consulté le )
- (en) Référence NCBI : Lactobacillaceae Winslow & al. 1917 (Approved Lists 1980) emend. Zheng & al. 2020 (taxons inclus) (consulté le )
- (en) Référence uBio : site déclaré ici indisponible le 7 avril 2023
- (en) Référence World Register of Marine Species : taxon Lactobacillaceae (+ liste genres + liste espèces) (consulté le )