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Desulfovibrio

Desulfovibrio est un genre de bacilles à Gram négatif, pouvant prendre des formes variées (droits, incurvés ou de forme sigmoïde).

Desulfovibrio
Description de cette image, également commentée ci-aprÚs
Desulfovibrio vulgaris vue en microscopie Ă©lectronique Ă  transmission (barre = 0,5 micron).

Genre

Desulfovibrio
Kluyver & van Niel 1936 emend. Loubinoux et al. 2002[1]

Synonymes

  • Desulfomonas Moore et al. 1976[2]
  • Sporovibrio Starkey 1938[2] - [3]

C’est un genre des bacilles non sporulĂ©s, mesurant de 0,5 Ă  1,5 ”m de large sur 2,5 Ă  10,0 ”m de long et mobiles grĂące Ă  un unique flagelle polaire ou parfois une ciliature lophotriche. (cf. Tableau 1 : CaractĂ©ristiques des bactĂ©ries du genre Desulfovibrio). Les espĂšces du genre Desulfovibrio sont parfois halophiles, anaĂ©robies, Ă  mĂ©tabolisme gĂ©nĂ©ralement respiratoire (respiration anaĂ©robie), utilisant les sulfates ou d'autres composĂ©s soufrĂ©s comme accepteurs finaux d'Ă©lectrons (la rĂ©duction conduit Ă  la formation d'hydrogĂšne sulfurĂ©). Mais elles peuvent ĂȘtre aussi mĂ©sophiles, chimio-organotrophes, oxydant de maniĂšre incomplĂšte les composĂ©s organiques, synthĂ©tisant une dĂ©sulfoviridine (sulfite rĂ©ductase) et n'hydrolysant pas la gĂ©latine [4]. On peut retrouver les espĂšces de Desulfovibrio principalement dans les sĂ©diments ou les boues et l'environnement marin mais aussi dans l'intestin de l'homme et des animaux.

Classe /genreDimensions (”m) et morphologieExigence en oxygÚneAutres caractÚres distinctifs
Ύ -protéobactéries
Desulfovibrio0,5-1,5 x 2,5-10 bùtonnets incurvés ou parfois droit mobiles par des flagelles polaires anaérobiesoxydent les composés organiques en acétate et réduisent le sulfate ou le soufre en H2S

Tableau 1 : Caractéristiques des bactéries du genre Desulfovibrio[5].

Desulfovibrio desulfuricans est une des bactĂ©ries capables de rĂ©duire les sulfates en sulfures, puis en hydrogĂšne sulfurĂ©. Bien qu’étant anaĂ©robie stricte, cette bactĂ©rie rĂ©siste bien Ă  l’oxygĂšne. On la retrouve dans les sols, mais aussi dans les vases, mĂȘme salĂ©es, sous les pierres oĂč leur prĂ©sence est attestĂ©e par un dĂ©pĂŽt de sulfure de fer noirĂątre et une forte odeur d’H2S.

Pour les rĂ©actions concernant la respiration anaĂ©robie des espĂšces de Desulfuvibrio : SO42− + 8 e- + 8 H+ ⇒ S2− + 4 H2O. L’accepteur final correspond Ă  l’ion sulfate SO24− ; les sulfates sont ainsi rĂ©duit en sulfure. Ce dernier est souvent ensuite rĂ©duit en hydrogĂšne sulfureux (H2S).

Ces bactĂ©ries sont trĂšs importantes pour le recyclage du soufre dans les Ă©cosystĂšmes. Des quantitĂ©s significatives de sulfate sont prĂ©sentes dans presque tous les habitats aquatiques et terrestres, aussi les bactĂ©ries rĂ©ductrices de sulfate sont-elles rĂ©pandues et actives dans les lieux rendus anoxiques par la digestion microbienne des matiĂšres organiques. Les espĂšces de Desulfovibrio et d’autres bactĂ©ries rĂ©ductrices de sulfate prospĂšrent dans des habitats comme les boues et les sĂ©diments des lacs et des cours d’eau polluĂ©s, les lagunes et les digesteurs d’eaux dĂ©gouts, et les sols gorgĂ©s d’eau[6].

Remarques

Les bactĂ©ries du genre Desulfovibrio sont l’un des groupes principaux Ă  ĂȘtre responsable du processus de corrosion anaĂ©robie. De plus, les espĂšces du genre Desulfovibrio peuvent ĂȘtre prĂ©sentes dans la colonne de Winogradsky.

Liste d'espĂšces

Selon Catalogue of Life (30 novembre 2020)[7] et ITIS (30 novembre 2020)[1] :

  • Desulfovibrio acrylicus van der Maarel & al., 1997
  • Desulfovibrio aerotolerans Mogensen & al., 2009
  • Desulfovibrio aespoeensis Motamedi & Pedersen, 1998
  • Desulfovibrio africanus Campbell & al., 1966
  • Desulfovibrio alaskensis Feio & al., 2004
  • Desulfovibrio alcoholivorans Qatibi & al., 1995
  • Desulfovibrio alkalitolerans Abildgaard & al., 2006
  • Desulfovibrio aminophilus Baena & al., 1999
  • Desulfovibrio arcticus Pecheritsyna & al., 2012
  • Desulfovibrio bastinii Magot & al., 2004
  • Desulfovibrio bizertensis Haouari & al., 2006
  • Desulfovibrio burkinensis Ouattara & al., 1999
  • Desulfovibrio butyratiphilus Suzuki & al., 2010
  • Desulfovibrio carbinolicus Nanninga & Gottschal, 1995
  • Desulfovibrio carbinoliphilus Allen & al., 2008
  • Desulfovibrio cuneatus Sass & al., 1998
  • Desulfovibrio dechloracetivorans Sun & al., 2001
  • Desulfovibrio desulfuricans (Beijerinck, 1895) Kluyver & van Niel, 1936
  • Desulfovibrio ferrireducens Vandieken & al., 2006
  • Desulfovibrio frigidus Vandieken & al., 2006
  • Desulfovibrio fructosivorans Ollivier & al., 1990
  • Desulfovibrio furfuralis Folkerts & al., 1989
  • Desulfovibrio gabonensis Tardy-Jacquenod & al., 1996
  • Desulfovibrio giganteus Esnault & al., 1988
  • Desulfovibrio gigas Le Gall, 1963
  • Desulfovibrio gracilis Magot & al., 2004
  • Desulfovibrio halophilus Caumette & al., 1991
  • Desulfovibrio hydrothermalis Alazard & al., 2003
  • Desulfovibrio idahonensis Sass & al., 2009
  • Desulfovibrio indonesiensis Feio & al., 2000
  • Desulfovibrio inopinatus Reichenbecher & Schink, 1999
  • Desulfovibrio intestinalis Fröhlich & al., 1999
  • Desulfovibrio litoralis Sass & al., 1998
  • Desulfovibrio longreachensis Redburn & Patel, 1995
  • Desulfovibrio longus Magot & al., 1992
  • Desulfovibrio magneticus Sakaguchi & al., 2002
  • Desulfovibrio marinisediminis Takii & al., 2008
  • Desulfovibrio marinus Ben Dhia Thabet & al., 2007
  • Desulfovibrio marrakechensis Chamkh & al., 2009
  • Desulfovibrio mexicanus Hernandez-Eugenio & al., 2001
  • Desulfovibrio oxamicus (Postgate & Campbell, 1966) LĂłpez-CortĂ©s & al., 2006
  • Desulfovibrio oxyclinae Krekeler & al., 2000
  • Desulfovibrio paquesii van Houten & al., 2009
  • Desulfovibrio piezophilus Khelaifia & al., 2011
  • Desulfovibrio piger (Moore & al., 1976) Loubinoux & al., 2002
  • Desulfovibrio portus Suzuki & al., 2010
  • Desulfovibrio profundus Bale & al., 1997
  • Desulfovibrio psychrotolerans Sasi Jyothsna & al., 2008
  • Desulfovibrio putealis Basso & al., 2005
  • Desulfovibrio salexigens Postgate & Campbell, 1966
  • Desulfovibrio senezii Tsu & al., 1999
  • Desulfovibrio simplex Zellner & al., 1990
  • Desulfovibrio sulfodismutans Bak & Pfennig, 1988
  • Desulfovibrio termitidis Trinkerl & al., 1991
  • Desulfovibrio tunisiensis Ben Ali Gam & al., 2009
  • Desulfovibrio vietnamensis Dang & al., 2002
  • Desulfovibrio vulgaris Postgate & Campbell, 1966
  • Desulfovibrio zosterae Nielsen & al., 1999

Selon NCBI (30 novembre 2020)[2] :

  • Candidatus Desulfovibrio kirbyi Takeuchi & al. 2020
  • Candidatus Desulfovibrio trichonymphae Sato & al. 2009
  • Desulfomonas oviles
  • Desulfovibrio aerotolerans Mogensen & al. 2009
  • Desulfovibrio alaskensis Feio & al. 2004
  • Desulfovibrio alcoholivorans Qatibi & al. 1995
  • Desulfovibrio aminophilus Baena & al. 1999
  • Desulfovibrio arcticus Pecheritsyna & al. 2012
  • Desulfovibrio bastinii Magot & al. 2004
  • Desulfovibrio biadhensis Fadhlaoui & al. 2015
  • Desulfovibrio bizertensis Haouari & al. 2006
  • Desulfovibrio brasiliensis "" Warthmann & al. 2005
  • Desulfovibrio burkinensis Ouattara & al. 1999
  • Desulfovibrio butyratiphilus Suzuki & al. 2010
  • Desulfovibrio caledoniensis
  • Desulfovibrio capillatus Miranda-Tello & al. 2013
  • Desulfovibrio carbinolicus Nanninga & Gottschal 1995
  • Desulfovibrio carbinoliphilus Allen & al. 2008
  • Desulfovibrio cavernae "" Sass & Cypionka 2004
  • Desulfovibrio cuneatus Sass & al. 1998
  • Desulfovibrio dechloracetivorans Sun & al. 2001
  • Desulfovibrio desulfuricans "Bacillus desulfuricans" (Beijerinck 1895) Saltet 1900
  • Desulfovibrio fairfieldensis "" McDougall & al. 1997
  • Desulfovibrio ferrireducens Vandieken & al. 2006
  • Desulfovibrio ferrophilus
  • Desulfovibrio frigidus Vandieken & al. 2006
  • Desulfovibrio fructosivorans corrig. Ollivier & al. 1990
  • Desulfovibrio gabonensis Tardy-Jacquenod & al. 1996
  • Desulfovibrio giganteus Esnault & al. 1988
  • Desulfovibrio gigas Le Gall 1963
  • Desulfovibrio gilichinskyi Ryzhmanova & al. 2019
  • Desulfovibrio gracilis Magot & al. 2004
  • Desulfovibrio halophilus Caumette & al. 1991
  • Desulfovibrio hontreensis "" Tarasov & al. 2015
  • Desulfovibrio hydrothermalis Alazard & al. 2003
  • Desulfovibrio idahonensis Sass & al. 2009
  • Desulfovibrio indonesiensis corrig. Feio & al. 2000
  • Desulfovibrio inopinatus Reichenbecher & Schink 1999
  • Desulfovibrio intestinalis Frohlich & al. 1999
  • Desulfovibrio lacusfryxellense "" Sattley & Madigan 2010
  • Desulfovibrio legallii "Desulfovibrio legallis" Thabet & al. 2011
  • Desulfovibrio litoralis Sass & al. 1998
  • Desulfovibrio longreachensis corrig. Redburn & Patel 1995
  • Desulfovibrio longus Magot & al. 1992
  • Desulfovibrio magneticus Sakaguchi & al. 2002
  • Desulfovibrio marinus Ben Dhia Thabet & al. 2007
  • Desulfovibrio marrakechensis Chamkh & al. 2009
  • Desulfovibrio mexicanus Hernandez-Eugenio & al. 2001
  • Desulfovibrio multispirans "" Czechowski & al. 1984
  • Desulfovibrio oliviopondense
  • Desulfovibrio oryzae
  • Desulfovibrio oxamicus (Postgate & Campbell 1966) Lopez-Cortes & al. 2006
  • Desulfovibrio oxyclinae Krekeler & al. 2000
  • Desulfovibrio paquesii van Houten & al. 2009
  • Desulfovibrio piger Desulfomonas pigra Moore & al. 1976
  • Desulfovibrio psychrotolerans Sasi Jyothsna & al. 2008
  • Desulfovibrio putealis Basso & al. 2005
  • Desulfovibrio salexigens "Microspira aestuarii" van Delden 1903
  • Desulfovibrio salinus Ben Ali Gam & al. 2018
  • Desulfovibrio senegalensis Thioye & al. 2017
  • Desulfovibrio senezii Tsu & al. 1999
  • Desulfovibrio simplex Zellner & al. 1990
  • Desulfovibrio singaporenus
  • Desulfovibrio sulfodismutans "Desulfolutivibrio sulfodismutans" (Bak & Pfennig 1988) Thiel & al. 2020
  • Desulfovibrio termitidis Trinkerl & al. 1991
  • Desulfovibrio tunisiensis Ben Ali Gam & al. 2009
  • Desulfovibrio vietnamensis Dang & al. 2002
  • Desulfovibrio vulgaris Postgate & Campbell 1966
  • Desulfovibrio zosterae Nielsen & al. 1999

Notes et références

  1. Integrated Taxonomic Information System (ITIS), www.itis.gov, CC0 https://doi.org/10.5066/F7KH0KBK, consulté le 30 novembre 2020
  2. NCBI, consulté le 30 novembre 2020
  3. BioLib, consulté le 30 novembre 2020
  4. http://www.bacterio.cict.fr/bacdico/dd/desulfovibrio.html
  5. D’aprĂšs le tableau 22.8 page 563 du livre Microbiologie, 3e Ă©dition, (de Boeck), Prescott, Harley, Klein et al. 2010, 1088 pages.
  6. Microbiologie, 3e Ă©dition (de Boeck), Prescott, Harley, Klein et al. 2010, 1088 pages.
  7. Catalogue of Life Checklist, consulté le 30 novembre 2020

Références biologiques

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