Desulfovibrio
Desulfovibrio est un genre de bacilles à Gram négatif, pouvant prendre des formes variées (droits, incurvés ou de forme sigmoïde).
RĂšgne | Bacteria |
---|---|
Sous-rĂšgne | Negibacteria |
Embranchement | Proteobacteria |
Classe | Deltaproteobacteria |
Ordre | Desulfovibrionales |
Famille | Desulfovibrionaceae |
Câest un genre des bacilles non sporulĂ©s, mesurant de 0,5 Ă 1,5 ”m de large sur 2,5 Ă 10,0 ”m de long et mobiles grĂące Ă un unique flagelle polaire ou parfois une ciliature lophotriche. (cf. Tableau 1 : CaractĂ©ristiques des bactĂ©ries du genre Desulfovibrio). Les espĂšces du genre Desulfovibrio sont parfois halophiles, anaĂ©robies, Ă mĂ©tabolisme gĂ©nĂ©ralement respiratoire (respiration anaĂ©robie), utilisant les sulfates ou d'autres composĂ©s soufrĂ©s comme accepteurs finaux d'Ă©lectrons (la rĂ©duction conduit Ă la formation d'hydrogĂšne sulfurĂ©). Mais elles peuvent ĂȘtre aussi mĂ©sophiles, chimio-organotrophes, oxydant de maniĂšre incomplĂšte les composĂ©s organiques, synthĂ©tisant une dĂ©sulfoviridine (sulfite rĂ©ductase) et n'hydrolysant pas la gĂ©latine [4]. On peut retrouver les espĂšces de Desulfovibrio principalement dans les sĂ©diments ou les boues et l'environnement marin mais aussi dans l'intestin de l'homme et des animaux.
Classe /genre | Dimensions (”m) et morphologie | Exigence en oxygÚne | Autres caractÚres distinctifs |
---|---|---|---|
Ύ -protéobactéries | |||
Desulfovibrio | 0,5-1,5 x 2,5-10 bùtonnets incurvés ou parfois droit mobiles par des flagelles polaires | anaérobies | oxydent les composés organiques en acétate et réduisent le sulfate ou le soufre en H2S |
Tableau 1 : Caractéristiques des bactéries du genre Desulfovibrio[5].
Desulfovibrio desulfuricans est une des bactĂ©ries capables de rĂ©duire les sulfates en sulfures, puis en hydrogĂšne sulfurĂ©. Bien quâĂ©tant anaĂ©robie stricte, cette bactĂ©rie rĂ©siste bien Ă lâoxygĂšne. On la retrouve dans les sols, mais aussi dans les vases, mĂȘme salĂ©es, sous les pierres oĂč leur prĂ©sence est attestĂ©e par un dĂ©pĂŽt de sulfure de fer noirĂątre et une forte odeur dâH2S.
Pour les rĂ©actions concernant la respiration anaĂ©robie des espĂšces de Desulfuvibrio : SO42â + 8 e- + 8 H+ â S2â + 4 H2O. Lâaccepteur final correspond Ă lâion sulfate SO24â ; les sulfates sont ainsi rĂ©duit en sulfure. Ce dernier est souvent ensuite rĂ©duit en hydrogĂšne sulfureux (H2S).
Ces bactĂ©ries sont trĂšs importantes pour le recyclage du soufre dans les Ă©cosystĂšmes. Des quantitĂ©s significatives de sulfate sont prĂ©sentes dans presque tous les habitats aquatiques et terrestres, aussi les bactĂ©ries rĂ©ductrices de sulfate sont-elles rĂ©pandues et actives dans les lieux rendus anoxiques par la digestion microbienne des matiĂšres organiques. Les espĂšces de Desulfovibrio et dâautres bactĂ©ries rĂ©ductrices de sulfate prospĂšrent dans des habitats comme les boues et les sĂ©diments des lacs et des cours dâeau polluĂ©s, les lagunes et les digesteurs dâeaux dĂ©gouts, et les sols gorgĂ©s dâeau[6].
Remarques
Les bactĂ©ries du genre Desulfovibrio sont lâun des groupes principaux Ă ĂȘtre responsable du processus de corrosion anaĂ©robie. De plus, les espĂšces du genre Desulfovibrio peuvent ĂȘtre prĂ©sentes dans la colonne de Winogradsky.
Liste d'espĂšces
Selon Catalogue of Life (30 novembre 2020)[7] et ITIS (30 novembre 2020)[1] :
- Desulfovibrio acrylicus van der Maarel & al., 1997
- Desulfovibrio aerotolerans Mogensen & al., 2009
- Desulfovibrio aespoeensis Motamedi & Pedersen, 1998
- Desulfovibrio africanus Campbell & al., 1966
- Desulfovibrio alaskensis Feio & al., 2004
- Desulfovibrio alcoholivorans Qatibi & al., 1995
- Desulfovibrio alkalitolerans Abildgaard & al., 2006
- Desulfovibrio aminophilus Baena & al., 1999
- Desulfovibrio arcticus Pecheritsyna & al., 2012
- Desulfovibrio bastinii Magot & al., 2004
- Desulfovibrio bizertensis Haouari & al., 2006
- Desulfovibrio burkinensis Ouattara & al., 1999
- Desulfovibrio butyratiphilus Suzuki & al., 2010
- Desulfovibrio carbinolicus Nanninga & Gottschal, 1995
- Desulfovibrio carbinoliphilus Allen & al., 2008
- Desulfovibrio cuneatus Sass & al., 1998
- Desulfovibrio dechloracetivorans Sun & al., 2001
- Desulfovibrio desulfuricans (Beijerinck, 1895) Kluyver & van Niel, 1936
- Desulfovibrio ferrireducens Vandieken & al., 2006
- Desulfovibrio frigidus Vandieken & al., 2006
- Desulfovibrio fructosivorans Ollivier & al., 1990
- Desulfovibrio furfuralis Folkerts & al., 1989
- Desulfovibrio gabonensis Tardy-Jacquenod & al., 1996
- Desulfovibrio giganteus Esnault & al., 1988
- Desulfovibrio gigas Le Gall, 1963
- Desulfovibrio gracilis Magot & al., 2004
- Desulfovibrio halophilus Caumette & al., 1991
- Desulfovibrio hydrothermalis Alazard & al., 2003
- Desulfovibrio idahonensis Sass & al., 2009
- Desulfovibrio indonesiensis Feio & al., 2000
- Desulfovibrio inopinatus Reichenbecher & Schink, 1999
- Desulfovibrio intestinalis Fröhlich & al., 1999
- Desulfovibrio litoralis Sass & al., 1998
- Desulfovibrio longreachensis Redburn & Patel, 1995
- Desulfovibrio longus Magot & al., 1992
- Desulfovibrio magneticus Sakaguchi & al., 2002
- Desulfovibrio marinisediminis Takii & al., 2008
- Desulfovibrio marinus Ben Dhia Thabet & al., 2007
- Desulfovibrio marrakechensis Chamkh & al., 2009
- Desulfovibrio mexicanus Hernandez-Eugenio & al., 2001
- Desulfovibrio oxamicus (Postgate & Campbell, 1966) López-Cortés & al., 2006
- Desulfovibrio oxyclinae Krekeler & al., 2000
- Desulfovibrio paquesii van Houten & al., 2009
- Desulfovibrio piezophilus Khelaifia & al., 2011
- Desulfovibrio piger (Moore & al., 1976) Loubinoux & al., 2002
- Desulfovibrio portus Suzuki & al., 2010
- Desulfovibrio profundus Bale & al., 1997
- Desulfovibrio psychrotolerans Sasi Jyothsna & al., 2008
- Desulfovibrio putealis Basso & al., 2005
- Desulfovibrio salexigens Postgate & Campbell, 1966
- Desulfovibrio senezii Tsu & al., 1999
- Desulfovibrio simplex Zellner & al., 1990
- Desulfovibrio sulfodismutans Bak & Pfennig, 1988
- Desulfovibrio termitidis Trinkerl & al., 1991
- Desulfovibrio tunisiensis Ben Ali Gam & al., 2009
- Desulfovibrio vietnamensis Dang & al., 2002
- Desulfovibrio vulgaris Postgate & Campbell, 1966
- Desulfovibrio zosterae Nielsen & al., 1999
Selon NCBI (30 novembre 2020)[2] :
- Candidatus Desulfovibrio kirbyi Takeuchi & al. 2020
- Candidatus Desulfovibrio trichonymphae Sato & al. 2009
- Desulfomonas oviles
- Desulfovibrio aerotolerans Mogensen & al. 2009
- Desulfovibrio alaskensis Feio & al. 2004
- Desulfovibrio alcoholivorans Qatibi & al. 1995
- Desulfovibrio aminophilus Baena & al. 1999
- Desulfovibrio arcticus Pecheritsyna & al. 2012
- Desulfovibrio bastinii Magot & al. 2004
- Desulfovibrio biadhensis Fadhlaoui & al. 2015
- Desulfovibrio bizertensis Haouari & al. 2006
- Desulfovibrio brasiliensis "" Warthmann & al. 2005
- Desulfovibrio burkinensis Ouattara & al. 1999
- Desulfovibrio butyratiphilus Suzuki & al. 2010
- Desulfovibrio caledoniensis
- Desulfovibrio capillatus Miranda-Tello & al. 2013
- Desulfovibrio carbinolicus Nanninga & Gottschal 1995
- Desulfovibrio carbinoliphilus Allen & al. 2008
- Desulfovibrio cavernae "" Sass & Cypionka 2004
- Desulfovibrio cuneatus Sass & al. 1998
- Desulfovibrio dechloracetivorans Sun & al. 2001
- Desulfovibrio desulfuricans "Bacillus desulfuricans" (Beijerinck 1895) Saltet 1900
- Desulfovibrio fairfieldensis "" McDougall & al. 1997
- Desulfovibrio ferrireducens Vandieken & al. 2006
- Desulfovibrio ferrophilus
- Desulfovibrio frigidus Vandieken & al. 2006
- Desulfovibrio fructosivorans corrig. Ollivier & al. 1990
- Desulfovibrio gabonensis Tardy-Jacquenod & al. 1996
- Desulfovibrio giganteus Esnault & al. 1988
- Desulfovibrio gigas Le Gall 1963
- Desulfovibrio gilichinskyi Ryzhmanova & al. 2019
- Desulfovibrio gracilis Magot & al. 2004
- Desulfovibrio halophilus Caumette & al. 1991
- Desulfovibrio hontreensis "" Tarasov & al. 2015
- Desulfovibrio hydrothermalis Alazard & al. 2003
- Desulfovibrio idahonensis Sass & al. 2009
- Desulfovibrio indonesiensis corrig. Feio & al. 2000
- Desulfovibrio inopinatus Reichenbecher & Schink 1999
- Desulfovibrio intestinalis Frohlich & al. 1999
- Desulfovibrio lacusfryxellense "" Sattley & Madigan 2010
- Desulfovibrio legallii "Desulfovibrio legallis" Thabet & al. 2011
- Desulfovibrio litoralis Sass & al. 1998
- Desulfovibrio longreachensis corrig. Redburn & Patel 1995
- Desulfovibrio longus Magot & al. 1992
- Desulfovibrio magneticus Sakaguchi & al. 2002
- Desulfovibrio marinus Ben Dhia Thabet & al. 2007
- Desulfovibrio marrakechensis Chamkh & al. 2009
- Desulfovibrio mexicanus Hernandez-Eugenio & al. 2001
- Desulfovibrio multispirans "" Czechowski & al. 1984
- Desulfovibrio oliviopondense
- Desulfovibrio oryzae
- Desulfovibrio oxamicus (Postgate & Campbell 1966) Lopez-Cortes & al. 2006
- Desulfovibrio oxyclinae Krekeler & al. 2000
- Desulfovibrio paquesii van Houten & al. 2009
- Desulfovibrio piger Desulfomonas pigra Moore & al. 1976
- Desulfovibrio psychrotolerans Sasi Jyothsna & al. 2008
- Desulfovibrio putealis Basso & al. 2005
- Desulfovibrio salexigens "Microspira aestuarii" van Delden 1903
- Desulfovibrio salinus Ben Ali Gam & al. 2018
- Desulfovibrio senegalensis Thioye & al. 2017
- Desulfovibrio senezii Tsu & al. 1999
- Desulfovibrio simplex Zellner & al. 1990
- Desulfovibrio singaporenus
- Desulfovibrio sulfodismutans "Desulfolutivibrio sulfodismutans" (Bak & Pfennig 1988) Thiel & al. 2020
- Desulfovibrio termitidis Trinkerl & al. 1991
- Desulfovibrio tunisiensis Ben Ali Gam & al. 2009
- Desulfovibrio vietnamensis Dang & al. 2002
- Desulfovibrio vulgaris Postgate & Campbell 1966
- Desulfovibrio zosterae Nielsen & al. 1999
Notes et références
- Integrated Taxonomic Information System (ITIS), www.itis.gov, CC0 https://doi.org/10.5066/F7KH0KBK, consulté le 30 novembre 2020
- NCBI, consulté le 30 novembre 2020
- BioLib, consulté le 30 novembre 2020
- http://www.bacterio.cict.fr/bacdico/dd/desulfovibrio.html
- DâaprĂšs le tableau 22.8 page 563 du livre Microbiologie, 3e Ă©dition, (de Boeck), Prescott, Harley, Klein et al. 2010, 1088 pages.
- Microbiologie, 3e Ă©dition (de Boeck), Prescott, Harley, Klein et al. 2010, 1088 pages.
- Catalogue of Life Checklist, consulté le 30 novembre 2020
Références biologiques
- (en) Référence BioLib : Desulfovibrio Kluyver & van Niel, 1936 (consulté le )
- (en) Référence Catalogue of Life : Desulfovibrio Kluyver & van Niel, 1936 emend. Loubinoux et al., 2002 emend. Loubinoux & al. , 2002 (consulté le )
- (fr+en) Référence EOL : Desulfovibrio (consulté le )
- (fr+en) Référence GBIF : Desulfovibrio Kluyver & van Niel, 1936 (consulté le )
- (en) Référence IRMNG : Desulfovibrio Kluyver & van Niel, 1936 (consulté le )
- (fr+en) Référence ITIS : Desulfovibrio Kluyver & van Niel, 1936 emend. Loubinoux & al., 2002 (consulté le )
- (en) Référence NCBI : Desulfovibrio Kluyver & van Niel 1936 emend. Loubinoux & al. 2002 (taxons inclus) (consulté le )
- (en) Référence World Register of Marine Species : taxon Desulfovibrio Kluyver & van Niel, 1936 (+ liste espÚces) (consulté le )