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Chlorobiota

Les Chlorobiota sont un embranchement (ou phylum, ou encore division) du règne des Bacteria. Son nom provient de son genre type, Chlorobium et cet embranchement comprend des bactéries à Gram négatif anaérobies strictes.

Chlorobiota
Description de cette image, également commentée ci-après
Les Cholorobiaceae qui croissent en bas de cette colonne de Winogradsky font partie de l'embranchement des Chlorobiota
Classification selon LPSN
Règne Bacteria

Embranchement

Chlorobiota
Iino et al. 2021[1]

Synonymes

  • Ignavibacteriota Podosokorskaya et al. 2021
  • Ignavibacteriota Whitman et al. 2018
  • Ignavibacteraeota Oren et al. 2015
  • Ignavibacteriae Podosokorskaya et al. 2013
  • Chlorobi Iino et al. 2010

Historique

Cet embranchement est proposé dès 2010 par Iino sous le nom de Chlorobi pour contenir deux classes de bactéries à Gram négatifs strictement anaérobies, les classes Chlorobea et Ignavibacteria[2]. Cette création est proposée suite à la description de l'espèce Ignavibacterium album isolée à Yumata (Nagano, Japon)[2]. Il avait alors été établi que son ordre type était les Chlorobiales[2]. En , il a été proposé que le nom devienne Chlorobiota avec la classe Chlorobia comme classe type[3].

En 2021, ce nom du phylum est effectivement publié de manière valide par Oren et Garrity après un renommage conforme au code de nomenclature bactérienne[1]. Le nom d'auteur de ce phylum (Iino) et qui fait autorité, diffère volontairement du nom des auteurs de l'article de la publication valide (Oren et Garrity)[4]. Dans le même temps, ces auteurs proposent aussi le nom de Ignavibacteriota comme nom de phylum publié de manière valide pour contenir les Ignavibacterium comme genre type[1]. Ce dernier phylum est désormais considéré comme un synonyme hétérotypique du phylum Chlorobiota[4].

Taxonomie

Étymologie

L'étymologie de ce phylum Chlorobiota est la suivante : Chlo.ro.bi.o’ta N.L. neut. n. Chlorobium, genre type de ce phylum; N.L. neut. pl. n. suff. -ota, suffixe pour définir un phylum; N.L. neut. pl. n. Chlorobiota, le phylum des Chlorobium[2] - [4].

Phylogénie

Le phylum Chlorobiota a été défini dès 2010 sur la base du séquençage de l'ARNr 16S[2].

Liste de classes

Selon la LPSN (10 novembre 2022)[5] :

  • « Chlorobiia » corrig. Garrity & Holt 2001, publié de manière non valide
  • Ignavibacteria Iino et al. 2010

Références

  1. Oren et Garrity 2021, p. 2-3.
  2. Iino et 2010 Iino2010, p. 1381.
  3. (en) WB Whitman, A Oren, M Chuvochina, MS da Costa, GM Garrity, FA Rainey, R Rossello-Mora, B Schink, I Sutcliffe, ME Trujillo et Stefano VEntura, « Proposal of the suffix -ota to denote phyla. Addendum to 'Proposal to include the rank of phylum in the International Code of Nomenclature of Prokaryotes », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 68, no 3, , p. 967-969 (DOI 10.1099/ijsem.0.002593)
  4. (en) « Phylum Chlorobiota », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le )
  5. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 10 novembre 2022

Bibliographie

  • (en) Takao Iino, Koji Mori, Yoshihito Uchino, Tatsunori Nakagawa, Shigeaki Harayama et Ken-ichiro Suzuki, « Ignavibacterium album gen. nov., sp. nov., a moderately thermophilic anaerobic bacterium isolated from microbial mats at a terrestrial hot spring and proposal of Ignavibacteria classis nov., for a novel lineage at the periphery of green sulfur bacteria », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 60, , p. 1376-1382 (DOI 10.1099/ijs.0.012484-0)
  • (en) A Oren et GM Garrity, « Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 71, no 10, , p. 005056 (DOI 10.1099/ijsem.0.005056)

Liens externes

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