Rhizodéposition
La rhizodéposition, terme inventé par le pédologue Saad Shamoot en 1968[1], est la mort de cellules (notamment celles de la coiffe), la fuite de molécules et surtout la sécrétion de composés organiques (cellules détachées de la racine, lysats, mucilages, exsudats, composés désignés sous le terme générique de rhizodépôts) directement dans le sol par les racines des plantes vivantes. Ces composés sont riches en carbone, et sont donc une source d'énergie essentielle pour les micro-organismes de la rhizosphère. Cette mince couche du sol qui colle aux racines contient en particulier des bactéries, protozoaires, nématodes, champignons[2].
Interaction sol-plantes et cycle du carbone
La rhizodéposition correspond en moyenne à une proportion de 5 à 15 % du carbone[3] fixé par la plante durant la photosynthèse et peut monter pour les cas extrêmes jusqu'à 40 %[4]. Les variations sont importantes suivant les espèces végétales et leur environnement[5]. Ce mécanisme est essentiel à la compréhension des interactions sol-plantes. Les activités et les structures des communautés microbiennes de la rhizosphère sont ainsi considérablement affectées par rapport au reste du sol, où le carbone organique disponible peut être beaucoup moins abondant[5].
Le carbone organique ainsi transféré se rencontre sous la forme de petites molécules, de sucres, d'acides organiques exsudés ou excrétés, de mucilages et de cellules mortes[6].
Au fil de l'histoire évolutive des végétaux, le phénomène de rhizodéposition s'est maintenu malgré son coût énergétique important, ce qui suggère que l'investissement lié à la libération des rhizodépôts favorables au microbiote rhizosphérique contribue à la valeur sélective de la plante[7].
Autres composés
La rhizodéposition a lieu notamment à l’apex des racines. Elle contribue à injecter des composés carbonés sur l’ensemble du profil de sol colonisé par les racines. Le processus ne concerne pas seulement le cycle biogéochimique du carbone puisque les rhizodépôts peuvent contenir des nutriments (azote (N)), des signaux moléculaires ou stimuler la minéralisation de matières organiques du sol et des nutriments (N ou phosphore (P)). La rhizodéposition est un processus pour lequel il manque encore de données quantitatives compte tenu de la difficulté de l’estimer au champ[5].
Références
- (en) Saad Shamoot, Lain McDonald & W. V. Bartholomew, « Rhizo-Deposition of Organic Debris in Soil », Soil Science Society of America Journal Abstract, vol. 32, no 6,‎ , p. 817-820 (DOI 10.2136/sssaj1968.03615995003200060031x).
- « Les flux d'énergie de la plante vers le sol », sur Jardinons Sol Vivant !, (consulté le )
- Le flux de carbone est mesuré par traçage isotopique.
- (en) J. Swinnen, J.A. Van Veen, R. Merckx, « Rhizosphere carbon fluxes in field-grown spring wheat: Model calculations based on 14C partitioning after pulse-labelling », Soil Biology and Biochemistry, vol. 26, no 2,‎ , p. 171-182 (DOI 10.1016/0038-0717(94)90160-0).
- « Les racines au coeur du fonctionnement de la rhizosphère - A2C le site de l'agriculture de conservation », sur agriculture-de-conservation.com (consulté le )
- « Rhizodéposition: définition et explications », sur AquaPortail (consulté le )
- Philippe Lemanceau et Manuel Blouin, Les sols au cœur de la zone critique, ISTE Editions, (lire en ligne), p. 62-63.